More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2156 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2156  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 401 aa  781    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0808  serine/threonine sodium symporter  63.05 
 
 		 409 aa  500  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1201  sodium:dicarboxylate symporter  60.56 
 
 		 391 aa  466  9.999999999999999e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1230  sodium:dicarboxylate symporter  52.41 
 
 		 397 aa  419  1e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000170025  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1223  sodium:dicarboxylate symporter family protein  56.68 
 
 		 387 aa  404  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00163296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1036  sodium:dicarboxylate symporter family protein  57.87 
 
 		 387 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000829053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0908  sodium:dicarboxylate symporter  38.08 
 
 		 399 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.015304  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1370  sodium:dicarboxylate symporter family protein  38.16 
 
 		 406 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000579538  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1599  sodium:dicarboxylate symporter  37.24 
 
 		 393 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2814  sodium:dicarboxylate symporter  35.45 
 
 		 413 aa  239  5.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0322  serine/threonine transporter  36.65 
 
 		 392 aa  238  1e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2680  sodium:dicarboxylate symporter  37.44 
 
 		 400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0914  sodium:dicarboxylate symporter  34.91 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525524  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1064  sodium:dicarboxylate symporter  35.75 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1183  sodium:dicarboxylate symporter family protein  36.64 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000817553  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0096  sodium:dicarboxylate symporter  35.44 
 
 		 408 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435647  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  37.18 
 
 		 432 aa  210  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1461  sodium:dicarboxylate symporter  31.03 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0890  sodium:dicarboxylate symporter  32.45 
 
 		 412 aa  178  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000498283  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15760  Na+/H+ dicarboxylate symporter  32.29 
 
 		 433 aa  177  3e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2814  sodium:dicarboxylate symporter  29.68 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0211  hypothetical protein  24.48 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.451987  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  35.76 
 
 		 422 aa  82.8  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6400  sodium:dicarboxylate symporter  35.9 
 
 		 470 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3229  sodium:dicarboxylate symporter  30.63 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46672  predicted protein  29.87 
 
 		 1347 aa  80.9  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  28 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  28 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  28.08 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50149  predicted protein  33.75 
 
 		 535 aa  79  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  34.03 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  33.33 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  29.41 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  28.67 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  27.94 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  28.67 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1104  serine/threonine transporter SstT  26.37 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.333475  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  27.27 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  29.81 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  29.81 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  28.62 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1770  Sodium/dicarboxylate symporter  37.75 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  26.13 
 
 		 447 aa  76.6  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  26.33 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  27.27 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  33.89 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  27.27 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  27.27 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  27.27 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  27.27 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  27.27 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0198  putative transporter  24.86 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.000000000551361  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06782  amino acid transporter (Eurofung)  32.07 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.477766 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0145  sodium:dicarboxylate symporter  29.14 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2738  Sodium:dicarboxylate symporter  33.91 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1033  proton glutamate symport protein  30.16 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.207746  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  28.62 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02764  hypothetical protein  26.98 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  25.69 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0142  sodium:dicarboxylate symporter  28.68 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  34.44 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  28.68 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1002  sodium:dicarboxylate symporter  33.73 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.541825 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  31.52 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  28.68 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0142  sodium:dicarboxylate symporter  28.68 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0909  sodium:dicarboxylate symporter  29.08 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  27.08 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  31.05 
 
 		 426 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  24.53 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  35.33 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  28.03 
 
 		 436 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  31.17 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  27.49 
 
 		 437 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  26.44 
 
 		 436 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  31.52 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  32.47 
 
 		 438 aa  72  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  33.33 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  25.77 
 
 		 449 aa  71.2  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  27.15 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02342  proton glutamate symport protein  31.15 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  27.3 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  26.32 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003079  proton/glutamate symporter  27.17 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000289708  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0737  proton/glutamate symporter  28.98 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0146822  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  27.07 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  27.07 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  27.07 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  26.37 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  26.37 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  27.07 
 
 		 419 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  26.37 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  25.63 
 
 		 442 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  26.41 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  29.06 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1093  sodium:dicarboxylate symporter  29.44 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  26.3 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2655  serine/threonine transporter SstT  30.22 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498681  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11013  proton/glutamate symporter  30.41 
 
 		 481 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1279  sodium:dicarboxylate symporter  35.76 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0428035  normal  0.783471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>