59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2130 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2130  adenylylsulfate reductase, beta subunit  100 
 
 
162 aa  337  5e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.925917  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2137  adenylylsulfate reductase, beta subunit  85.71 
 
 
167 aa  289  9e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1109  adenylylsulfate reductase subunit beta  87.1 
 
 
162 aa  285  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000257152  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2892  adenylylsulfate reductase, beta subunit  83.85 
 
 
167 aa  282  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.409396 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3197  adenylylsulfate reductase, beta subunit  85.26 
 
 
162 aa  280  5.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000312858  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1967  adenylylsulfate reductase, beta subunit  80.26 
 
 
167 aa  257  4e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0419652 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1047  adenylylsulfate reductase, beta subunit  65.19 
 
 
147 aa  190  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0187678  normal  0.010444 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0636  adenylylsulfate reductase, beta subunit  65.41 
 
 
147 aa  189  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1586  adenylylsulfate reductase subunit beta  69.17 
 
 
140 aa  184  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00926364  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3578  adenylylsulfate reductase, beta subunit  63.16 
 
 
146 aa  184  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000448806  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1838  adenylylsulfate reductase, beta subunit  69.17 
 
 
140 aa  185  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0138336  normal  0.023497 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0873  adenylylsulfate reductase, beta subunit  68.8 
 
 
161 aa  184  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.970747  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0997  adenylylsulfate reductase, beta subunit  60.84 
 
 
144 aa  183  7e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000160425  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0040  adenylylsulfate reductase, beta subunit  68.33 
 
 
140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1886  adenylylsulfate reductase, beta subunit  64.71 
 
 
145 aa  182  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000106288  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1081  adenylylsulfate reductase, beta subunit  64.18 
 
 
147 aa  181  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0272  adenylylsulfate reductase, beta subunit  49.15 
 
 
161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000000553885  hitchhiker  0.000000190129 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0064  adenylylsulfate reductase, beta subunit  41.78 
 
 
159 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1234  adenylylsulfate reductase, beta subunit  43.28 
 
 
164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.480788  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0351  adenylylsulfate reductase, beta subunit  41.5 
 
 
160 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.480328  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1429  adenylylsulfate reductase, beta subunit  44.03 
 
 
160 aa  107  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0667078 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2283  adenylylsulfate reductase, beta subunit  40.14 
 
 
160 aa  101  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.9 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1888  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38 
 
 
114 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000841156  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0925  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.63 
 
 
113 aa  79  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.29 
 
 
107 aa  73.6  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1709  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  32.38 
 
 
118 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1192  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.09 
 
 
105 aa  50.8  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1831  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.93 
 
 
103 aa  47.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34920  putative ferredoxin  42.62 
 
 
81 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000025951  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3162  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.28 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274063  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4072  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.94 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.512619  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0206  ferredoxin, 4Fe-4S  42.62 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.623695 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5012  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.62 
 
 
81 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1297  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.98 
 
 
81 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.814234  normal  0.164928 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.98 
 
 
88 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1973  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.62 
 
 
81 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6104  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.62 
 
 
81 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416021  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4092  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.98 
 
 
88 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.141555  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1888  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.98 
 
 
81 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394196  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1961  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.98 
 
 
81 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323948  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0496  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.31 
 
 
672 aa  44.3  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.747428 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5288  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.98 
 
 
81 aa  44.3  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.782627  normal  0.0624847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.58 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3675  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.71 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.969084  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3350  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.71 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417972  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4883  putative ferredoxin  39.71 
 
 
77 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169548  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3883  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.29 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1997  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.98 
 
 
81 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  35.59 
 
 
610 aa  41.6  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0795  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.19 
 
 
642 aa  41.6  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0677  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.71 
 
 
77 aa  41.6  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7631  ferredoxin  40.32 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.295898  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  37.29 
 
 
602 aa  41.2  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0618  hypothetical protein  30.99 
 
 
255 aa  41.2  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0821  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.25 
 
 
1139 aa  41.2  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.187038 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  36.36 
 
 
590 aa  40.8  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  37.65 
 
 
274 aa  40.8  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0440  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.36 
 
 
90 aa  40.4  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>