198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2125 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2125  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  100 
 
 
393 aa  800    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2896  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  66.16 
 
 
384 aa  525  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.217971 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1113  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  63.87 
 
 
384 aa  509  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0397617  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2133  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  64.38 
 
 
384 aa  498  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.411689  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1963  quinone-interacting membrane-bound oxidoreductase complex subunit C  56.89 
 
 
407 aa  430  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829701 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3201  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  54.45 
 
 
408 aa  402  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1834  heterodisulfide reductase, putative  36.8 
 
 
391 aa  268  8e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0759481  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1001  heterodisulfide reductase, putative  37.2 
 
 
398 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.284636  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0035  heterodisulfide reductase, putative  36.23 
 
 
393 aa  251  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000417872  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1582  heterodisulfide reductase, putative  34.14 
 
 
392 aa  249  5e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00374998  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1077  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.07 
 
 
382 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0184362  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1285  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.99 
 
 
367 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4092  heterodisulfide reductase subunit C-like  35.83 
 
 
148 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4071  CitB domain-containing protein  25.97 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0625  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.23 
 
 
193 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2663  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  37.97 
 
 
129 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0239  hypothetical protein  39.33 
 
 
194 aa  71.6  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.577493 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2241  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit C  35.56 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0469153  normal  0.0166067 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3416  CitB domain protein  25.45 
 
 
408 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0590  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.96 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321199  normal  0.0726 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1836  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.67 
 
 
191 aa  68.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139025  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0394  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.74 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00274296  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2085  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  36.56 
 
 
387 aa  67  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.32982  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0563  putative heterodisulfide reductase, C subunit  32.97 
 
 
211 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1806  heterodisulfide reductase, C subunit  34.07 
 
 
189 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0793  CitB domain-containing protein  25.96 
 
 
403 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3857  CitB domain-containing protein  24.75 
 
 
377 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000315554 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0474  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.5 
 
 
193 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.561183  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2808  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.5 
 
 
383 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0358  putative heterodisulfide reductase, C subunit  30.97 
 
 
187 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0402  CoB--CoM heterodisulfide reductase  36.46 
 
 
192 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0280446  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1446  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.5 
 
 
383 aa  62.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0968  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.74 
 
 
437 aa  62  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.405818  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1517  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  34.04 
 
 
192 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.507445  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.89 
 
 
196 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.802269  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3814  CitB domain-containing protein  24.35 
 
 
394 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.986403 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2551  iron-sulfur cluster-binding protein  29.03 
 
 
239 aa  60.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802978  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.23 
 
 
192 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1325  heterodisulfide reductase, C subunit  29.21 
 
 
188 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0151  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  30.34 
 
 
192 aa  60.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2503  putative ferredoxin  23.56 
 
 
404 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5625  CitB domain protein  23.56 
 
 
404 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3581  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  30.34 
 
 
192 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0636  iron-sulfur cluster-binding protein  33.77 
 
 
238 aa  60.1  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.126769 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1783  hypothetical protein  36.96 
 
 
386 aa  60.1  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3675  putative heterodisulfide reductase, C subunit  32.22 
 
 
195 aa  60.1  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.141926 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0322  heterodisulfide reductase, C subunit  30.11 
 
 
186 aa  59.7  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1452  hypothetical protein  34.78 
 
 
412 aa  59.3  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.275657 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0439  heterodisulfide reductase subunit C-like  35.53 
 
 
156 aa  58.9  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2212  heterodisulfide reductase subunit C  29.55 
 
 
238 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0191178  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2098  heterodisulfide reductase, C subunit  28.97 
 
 
193 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1604  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  37.11 
 
 
184 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.455044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0826  heterodisulfide reductase, C subunit  30.11 
 
 
186 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1351  heterodisulfide reductase, C subunit  28.89 
 
 
193 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0539  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  37.11 
 
 
184 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.214937  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.11 
 
 
184 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0092  heterodisulfide reductase subunit  29.89 
 
 
182 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3424  heterodisulfide reductase subunit  28.41 
 
 
216 aa  58.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3134  CitB domain protein  24.56 
 
 
408 aa  57  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.870392  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0848  heterodisulfide reductase, C subunit  31.46 
 
 
202 aa  57  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1700  putative heterodisulfide reductase, C subunit  31.87 
 
 
193 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000309238 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0377  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.67 
 
 
184 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0861  heterodisulfide reductase subunit  29.21 
 
 
194 aa  56.6  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17750  hypothetical protein  32.18 
 
 
204 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4212  putative citrate utilization protein B (citB)  22.74 
 
 
372 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.762767  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0032  heterodisulfide reductase subunit  28.09 
 
 
194 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0031  heterodisulfide reductase subunit  28.09 
 
 
194 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1078  heterodisulfide reductase subunit C  27.46 
 
 
253 aa  55.1  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.114051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1196  heterodisulfide reductase, C subunit  27.38 
 
 
184 aa  54.7  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4211  Citrate utilization protein B  21.52 
 
 
390 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3524  heterodisulfide reductase, C subunit  24.73 
 
 
185 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1574  putative heterodisulfide reductase, C subunit  30.49 
 
 
174 aa  53.9  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0620  citrate utilization protein B  25.71 
 
 
388 aa  53.9  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2284  hypothetical protein  27.47 
 
 
282 aa  53.1  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5879  CitB domain-containing protein  22.94 
 
 
404 aa  53.1  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237858  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0198  heterodisulfide reductase subunit C  26.42 
 
 
213 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0633  putative heterodisulfide reductase, C subunit  30 
 
 
200 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0975  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  32.29 
 
 
133 aa  51.6  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.826747  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2344  putative heterodisulfide reductase, C subunit  33 
 
 
188 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628999  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2317  heterodisulfide reductase subunit C  26.42 
 
 
213 aa  52.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  32.29 
 
 
502 aa  51.2  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3574  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  29.89 
 
 
202 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2087  CitB domain-containing protein  22.33 
 
 
389 aa  50.8  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0934488  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0688  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  29.79 
 
 
413 aa  50.8  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1882  heterodisulfide reductase subunit C  34.52 
 
 
195 aa  49.7  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1335  heterodisulfide reductase, C subunit  30 
 
 
177 aa  49.7  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.7 
 
 
497 aa  49.7  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0093  hypothetical protein  39.39 
 
 
423 aa  48.9  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0395  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  32.47 
 
 
424 aa  49.3  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  29.55 
 
 
502 aa  48.9  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1125  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  32.91 
 
 
499 aa  48.9  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3489  citrate utilization protein B  25.3 
 
 
388 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57381  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1261  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.82 
 
 
502 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0572  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  28.7 
 
 
259 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104644  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6302  CitB domain-containing protein  24.28 
 
 
400 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2860  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.57 
 
 
699 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2470  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur protein  29.36 
 
 
231 aa  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2382  CitB domain protein  24.55 
 
 
378 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0846  citrate utilization protein B  23.21 
 
 
379 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>