More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2097 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2097  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
153 aa  312  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0417  3-dehydroquinate dehydratase  65.1 
 
 
149 aa  208  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3003  3-dehydroquinate dehydratase  68.12 
 
 
145 aa  205  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216438  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3996  3-dehydroquinate dehydratase  64.83 
 
 
148 aa  202  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588334  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2690  3-dehydroquinate dehydratase  66.67 
 
 
145 aa  200  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2178  3-dehydroquinate dehydratase  66.67 
 
 
148 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5767  3-dehydroquinate dehydratase  63.83 
 
 
145 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.533207  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6025  3-dehydroquinate dehydratase  64.38 
 
 
147 aa  197  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212804  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2360  3-dehydroquinate dehydratase  67.94 
 
 
149 aa  197  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.896861  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4497  3-dehydroquinate dehydratase  62.76 
 
 
149 aa  196  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81741  normal  0.381959 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4434  3-dehydroquinate dehydratase  63.12 
 
 
145 aa  196  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.433738 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1559  3-dehydroquinate dehydratase  62.84 
 
 
148 aa  193  7e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0672163  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5818  3-dehydroquinate dehydratase  64.44 
 
 
146 aa  192  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.546847 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  56.25 
 
 
147 aa  170  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  55.41 
 
 
149 aa  166  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  55.17 
 
 
147 aa  165  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.36 
 
 
145 aa  160  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  53.38 
 
 
150 aa  158  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  52.7 
 
 
150 aa  157  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  52.7 
 
 
150 aa  157  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  52.7 
 
 
150 aa  157  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  52.03 
 
 
150 aa  157  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  52.03 
 
 
150 aa  157  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  51.35 
 
 
207 aa  157  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 
150 aa  156  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  51.35 
 
 
207 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  51.35 
 
 
207 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  51.35 
 
 
150 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  51.35 
 
 
150 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  51.35 
 
 
150 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  51.35 
 
 
150 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  51.35 
 
 
150 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  52.21 
 
 
141 aa  153  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.55 
 
 
149 aa  152  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 
150 aa  150  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.18 
 
 
145 aa  150  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 
153 aa  150  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 
153 aa  150  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.06 
 
 
144 aa  149  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 
151 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 
149 aa  149  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  49.67 
 
 
154 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  51.02 
 
 
151 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55 
 
 
184 aa  148  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5722  3-dehydroquinate dehydratase  48.32 
 
 
149 aa  148  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 
162 aa  147  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  51.47 
 
 
145 aa  147  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 
149 aa  147  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  52.21 
 
 
145 aa  147  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.71 
 
 
150 aa  145  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  51.35 
 
 
162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 
149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 
142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 
156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3689  3-dehydroquinate dehydratase  52.7 
 
 
150 aa  144  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 
148 aa  145  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3059  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00663855  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 
172 aa  144  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0858965 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
150 aa  144  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4605  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 
150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.853087  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0599  3-dehydroquinate dehydratase  47.97 
 
 
151 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.08 
 
 
152 aa  143  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0605  3-dehydroquinate dehydratase  47.97 
 
 
151 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0678891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  52.94 
 
 
145 aa  143  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 
155 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 
155 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3520  3-dehydroquinate dehydratase  46.1 
 
 
145 aa  141  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000267198  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0560  3-dehydroquinate dehydratase  47.97 
 
 
151 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 
144 aa  140  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06970  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 
147 aa  140  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554011  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
151 aa  140  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5566  3-dehydroquinate dehydratase  47.89 
 
 
147 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 
152 aa  139  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.85 
 
 
147 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 
144 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  43.33 
 
 
152 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64090  3-dehydroquinate dehydratase  47.89 
 
 
147 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 
148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5252  3-dehydroquinate dehydratase  51.02 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  45.65 
 
 
146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.58 
 
 
152 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  45.71 
 
 
146 aa  138  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  45.71 
 
 
146 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  45.71 
 
 
146 aa  138  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  45.71 
 
 
146 aa  138  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  45.71 
 
 
146 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  45.71 
 
 
146 aa  138  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  45.71 
 
 
146 aa  138  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.72 
 
 
146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  47.97 
 
 
150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0026  3-dehydroquinate dehydratase  46.38 
 
 
152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.74 
 
 
145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0715  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 
148 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.583785  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 
149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.97 
 
 
150 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  48.97 
 
 
150 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 
145 aa  137  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  45 
 
 
146 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3243  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
144 aa  137  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.414343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>