48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1964 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1964  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 214 aa  434  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1912  3'-5' exonuclease  59.16 
 
 		 202 aa  234  7e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254298  normal  0.272354 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0883  3'-5' exonuclease  57.07 
 
 		 201 aa  224  7e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0280341 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2388  3'-5' exonuclease  54.74 
 
 		 201 aa  216  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000109184  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0888  3'-5' exonuclease  46.63 
 
 		 238 aa  177  9e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329161  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_002950  PG0365  3'-5' exonuclease domain-containing protein  34.97 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1397  3'-5' exonuclease  36.46 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937954  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2737  3'-5' exonuclease  35.33 
 
 		 198 aa  88.2  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1014  3'-5' exonuclease  37.04 
 
 		 303 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0976  3'-5' exonuclease  37.04 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0707907 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3433  3'-5' exonuclease  32.46 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271229  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1153  exonuclease, putative  35.57 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3291  3'-5' exonuclease  33.52 
 
 		 315 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000349721  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2827  3'-5' exonuclease  33.15 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0393048  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27893  predicted protein  34.51 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.70309 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3387  3'-5' exonuclease  35.48 
 
 		 315 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395277  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2470  3'-5' exonuclease  32.19 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.774502  normal  0.494629 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2621  3'-5' exonuclease  34.46 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3512  3'-5' exonuclease  34.84 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.643646  normal  0.0140367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2929  3'-5' exonuclease  32.12 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00209751  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1066  3'-5' exonuclease  34.19 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0869717  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0980  3'-5' exonuclease  37.24 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46734  predicted protein  38.55 
 
 		 894 aa  72  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1697  3'-5' exonuclease  30.34 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4830  3'-5' exonuclease  33.79 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0991293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_93442  predicted protein  28.76 
 
 		 389 aa  58.5  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0542  DNA-directed DNA polymerase  29.75 
 
 		 585 aa  55.1  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481022  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  29.71 
 
 		 393 aa  50.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0859  3'-5' exonuclease  31.88 
 
 		 391 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  32.34 
 
 		 392 aa  47.8  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30755  predicted protein  30.77 
 
 		 497 aa  45.4  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  29.33 
 
 		 409 aa  45.1  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  31.85 
 
 		 294 aa  45.1  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1388  ribonuclease D  31.45 
 
 		 377 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0816  3'-5' exonuclease  26.21 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00362431  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2211  3'-5' exonuclease  31.21 
 
 		 296 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.493178  normal  0.0213505 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39090  predicted protein  27.73 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.967738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2261  3'-5' exonuclease  31.85 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1669  3'-5' exonuclease  30.13 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335885  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0736  ribonuclease D  27.27 
 
 		 381 aa  43.5  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0989413  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32970  ribonuclease D protein  30.25 
 
 		 375 aa  43.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.789666  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0015  3'-5' exonuclease  26.62 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2349  3'-5' exonuclease  31.11 
 
 		 288 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  27.85 
 
 		 377 aa  42.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0529  3'-5' exonuclease family protein  25.98 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01380  ribonuclease D  25.32 
 
 		 382 aa  42  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3589  3'-5' exonuclease  44.68 
 
 		 203 aa  42  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  27.22 
 
 		 377 aa  41.6  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>