More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1937 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1937  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
552 aa  1090    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  47.12 
 
 
522 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  44.79 
 
 
502 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  41.51 
 
 
528 aa  330  3e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  38.84 
 
 
505 aa  280  4e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  38.88 
 
 
520 aa  272  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  34.45 
 
 
521 aa  237  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  35.71 
 
 
506 aa  233  6e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  33.52 
 
 
521 aa  232  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  34.82 
 
 
507 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  34.24 
 
 
507 aa  223  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  32.73 
 
 
516 aa  223  7e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  33.27 
 
 
477 aa  219  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  31.61 
 
 
525 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  34.2 
 
 
510 aa  207  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  34.04 
 
 
542 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  30.89 
 
 
529 aa  163  7e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  29.44 
 
 
526 aa  151  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1912  apolipoprotein N-acyltransferase  26.87 
 
 
537 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000101188  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  29.91 
 
 
489 aa  145  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  27.06 
 
 
524 aa  145  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  26.95 
 
 
524 aa  144  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  26.04 
 
 
522 aa  143  8e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0889  apolipoprotein N-acyltransferase  37.63 
 
 
510 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.623273  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  29.39 
 
 
507 aa  140  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  25.3 
 
 
510 aa  140  6e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  26.41 
 
 
513 aa  138  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12280  apolipoprotein N-acyltransferase  29.01 
 
 
511 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2751  apolipoprotein N-acyltransferase  29.89 
 
 
562 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444108  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2616  apolipoprotein N-acyltransferase  29.75 
 
 
562 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244944  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1124  apolipoprotein N-acyltransferase  29.4 
 
 
511 aa  136  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.693748  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  29.18 
 
 
534 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  29.8 
 
 
506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2726  apolipoprotein N-acyltransferase  28.92 
 
 
567 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  29.74 
 
 
505 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  33.42 
 
 
543 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  29.39 
 
 
505 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  29.88 
 
 
505 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  28.6 
 
 
529 aa  133  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  30.23 
 
 
479 aa  133  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  29.09 
 
 
532 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3783  apolipoprotein N-acyltransferase  28.21 
 
 
507 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.299433 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  28 
 
 
534 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  28.6 
 
 
512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1679  apolipoprotein N-acyltransferase  30.64 
 
 
550 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  28.6 
 
 
529 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  28.6 
 
 
529 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  28.6 
 
 
512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  28.6 
 
 
512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  28.6 
 
 
529 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  28.6 
 
 
529 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  28.81 
 
 
532 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3304  apolipoprotein N-acyltransferase  27.55 
 
 
521 aa  131  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  28.42 
 
 
512 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  26.43 
 
 
523 aa  131  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  28.6 
 
 
512 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1060  apolipoprotein N-acyltransferase  27.2 
 
 
526 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  33.52 
 
 
524 aa  130  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  30.04 
 
 
506 aa  130  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3334  apolipoprotein N-acyltransferase  28.92 
 
 
582 aa  130  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.499479  normal  0.16189 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  30.95 
 
 
523 aa  130  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  30.95 
 
 
523 aa  130  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  31.02 
 
 
532 aa  130  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  28.42 
 
 
512 aa  130  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  34.11 
 
 
507 aa  130  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  28.42 
 
 
512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0600  apolipoprotein N-acyltransferase  34.03 
 
 
553 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0630  apolipoprotein N-acyltransferase  29.34 
 
 
505 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.112466  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0625  apolipoprotein N-acyltransferase  28.6 
 
 
567 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  27.53 
 
 
512 aa  127  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  35.11 
 
 
528 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129672  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  26.92 
 
 
509 aa  127  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  30.09 
 
 
510 aa  127  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2135  apolipoprotein N-acyltransferase  32.84 
 
 
500 aa  127  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.180116  normal  0.129079 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6026  apolipoprotein N-acyltransferase  28.57 
 
 
562 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115466  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4441  apolipoprotein N-acyltransferase  29.87 
 
 
502 aa  127  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3403  apolipoprotein N-acyltransferase  35.97 
 
 
566 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72267  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  30.36 
 
 
535 aa  126  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  35.61 
 
 
567 aa  126  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3576  apolipoprotein N-acyltransferase  26.24 
 
 
532 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.708418  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  26.76 
 
 
554 aa  125  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3532  apolipoprotein N-acyltransferase  35.61 
 
 
567 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212796  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09030  apolipoprotein N-acyltransferase  33.11 
 
 
516 aa  125  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36821  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2087  apolipoprotein N-acyltransferase  32.77 
 
 
567 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187747  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2699  apolipoprotein N-acyltransferase  32.77 
 
 
567 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000283733  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  27.88 
 
 
508 aa  123  9e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  27.88 
 
 
512 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  25.37 
 
 
515 aa  123  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  34.15 
 
 
504 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  25.37 
 
 
515 aa  123  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  25.37 
 
 
515 aa  123  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  29.67 
 
 
536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0151  apolipoprotein N-acyltransferase  32.5 
 
 
475 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.721179  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  30.38 
 
 
514 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1364  apolipoprotein N-acyltransferase  32.65 
 
 
488 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00243577  hitchhiker  0.000524625 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  33.09 
 
 
576 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  34.4 
 
 
520 aa  120  9e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0358  apolipoprotein N-acyltransferase  29.47 
 
 
505 aa  120  9e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0220  apolipoprotein N-acyltransferase  32.08 
 
 
568 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  29.41 
 
 
541 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>