More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1916 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 		 219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  53.85 
 
 		 223 aa  250  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  51.6 
 
 		 224 aa  241  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  50.46 
 
 		 256 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  47.73 
 
 		 221 aa  222  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  46.6 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  39.8 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  36.87 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  42.11 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  41.05 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  41.31 
 
 		 217 aa  155  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  40.86 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  40.32 
 
 		 215 aa  147  9e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  41.94 
 
 		 211 aa  139  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  37.57 
 
 		 208 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  38.27 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  35.5 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  35.75 
 
 		 210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  34.15 
 
 		 219 aa  128  6e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  37.04 
 
 		 214 aa  127  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  36.06 
 
 		 232 aa  127  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  37.5 
 
 		 217 aa  125  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  38.55 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  41.29 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  41.29 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  33.97 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  35.6 
 
 		 225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  35.42 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  43.61 
 
 		 145 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  34.1 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  42.34 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3952  signal transduction protein  31.98 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  39.42 
 
 		 162 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  30.77 
 
 		 214 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  32.21 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  36.32 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  36.32 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  36.32 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  36.32 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  36.32 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  36.32 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  36.32 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  38.64 
 
 		 154 aa  106  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  36.32 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  35.79 
 
 		 214 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  35.79 
 
 		 214 aa  105  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  40.62 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  36.5 
 
 		 162 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  34.74 
 
 		 214 aa  104  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  38.85 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2010  CBS domain-containing protein  38.35 
 
 		 144 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.348735  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  35.29 
 
 		 149 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  36.96 
 
 		 216 aa  98.2  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  34.56 
 
 		 147 aa  98.2  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  31.12 
 
 		 202 aa  98.2  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  34.56 
 
 		 147 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  36.76 
 
 		 149 aa  94.4  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  28.9 
 
 		 222 aa  92  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  31.37 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1450  CBS domain-containing protein  32.59 
 
 		 144 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0760  CBS domain containing protein  31.88 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  36.05 
 
 		 152 aa  84.7  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  33.68 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 149 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2280  putative signal transduction protein with CBS domains  28.96 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  34.97 
 
 		 155 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  35.42 
 
 		 150 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  35.83 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  35.37 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.97 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.97 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  33.81 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  31.09 
 
 		 282 aa  78.2  0.00000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0035  CBS domain-containing protein  26.32 
 
 		 201 aa  78.2  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0035  CBS domain-containing protein  26.32 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268631  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0178  CBS domain-containing protein  31.43 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  32.17 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  31.76 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  33.11 
 
 		 150 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  34.03 
 
 		 150 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1304  signal-transduction protein  24.21 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  30.82 
 
 		 153 aa  73.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  32.67 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  32.95 
 
 		 873 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  34.72 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  33.82 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  34.38 
 
 		 262 aa  72  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  30.61 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  31.62 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  37.88 
 
 		 769 aa  71.6  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2060  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.07 
 
 		 490 aa  71.2  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  33.1 
 
 		 151 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  33.56 
 
 		 148 aa  70.5  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  37.93 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  31.76 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  30.71 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  34.09 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1082  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.09 
 
 		 514 aa  69.7  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>