More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1900 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1900  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 221 aa  456  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65867  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1697  HAD family hydrolase  45.63 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.264529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2173  HAD family hydrolase  43.63 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.9 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0660196 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1666  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.1 
 
 		 236 aa  134  8e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.695428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0404  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.19 
 
 		 224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2933  HAD family hydrolase  35.48 
 
 		 210 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.954117  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.84 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317051 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2451  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.17 
 
 		 212 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2069  HAD family hydrolase  35.79 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.827654  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0937  HAD family hydrolase  35.75 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.43 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0021  hydrolase  34.16 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.993674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2849  hydrolase  34.01 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0604  hydrolase  32.56 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1876  phosphatases  32.69 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000282708  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  32.14 
 
 		 214 aa  88.2  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2242  phosphatases  31.89 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  31.98 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  34.43 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  29.83 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1778  HAD family hydrolase  32.45 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  decreased coverage  0.0000822361 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  31.22 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  31.22 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  30.05 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  33.51 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  29.59 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  40.38 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  30.43 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  30.3 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  30.24 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0934  HAD family hydrolase  29.23 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  30.81 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  32.46 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1348  phosphoglycolate phosphatase  28.86 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  32.98 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.21 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  30.3 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1758  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.41 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0639278  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  30.22 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  30.1 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.75 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  27.72 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  32.98 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  29.1 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2708  phosphoglycolate phosphatase  28.95 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.900688 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  27.96 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  30.32 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  31.22 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  28.71 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.43 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1518  HAD family hydrolase  31.75 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0020263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3752  HAD family hydrolase  30.57 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4773  HAD family hydrolase  33.64 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.330372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  30.73 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.25 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  28.89 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  28.27 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1222  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.51 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2262  hydrolase  27.23 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  29.69 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  26.74 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  32.32 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0659  HAD family hydrolase  33.64 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0468832  normal  0.394115 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  29.32 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  28.33 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  27.32 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  27.89 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4761  HAD superfamily hydrolase  33.64 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000261111  hitchhiker  0.00232434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4635  HAD family hydrolase  33.64 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262111  hitchhiker  0.00233323 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.82 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  36 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  26.11 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  29.53 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  27.22 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1947  HAD family hydrolase  25.41 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0919  HAD family hydrolase  26.5 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000975491  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3177  phosphoglycolate phosphatase  29.9 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  27.84 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  24.74 
 
 		 396 aa  62.8  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  26.92 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  28.65 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  25.26 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  29.02 
 
 		 272 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  31.89 
 
 		 228 aa  62  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  26.84 
 
 		 254 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  26.84 
 
 		 254 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  29.08 
 
 		 243 aa  62  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3737  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.21 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  26.84 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>