More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1874 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1874  amidohydrolase  100 
 
 
432 aa  862    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0465  amidohydrolase  46.95 
 
 
399 aa  279  5e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.742317  normal  0.0452938 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2963  amidohydrolase family protein  41.62 
 
 
468 aa  243  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1424  amidohydrolase  40.55 
 
 
478 aa  243  5e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2239  S-adenosylhomocysteine deaminase  36.26 
 
 
392 aa  184  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.975396 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0252  amidohydrolase  35.09 
 
 
368 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00951952  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1275  amidohydrolase  35.38 
 
 
399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3087  amidohydrolase  35.09 
 
 
424 aa  139  8.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000127453 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1827  cytosine deaminase/metal-dependent hydrolase  32.24 
 
 
428 aa  137  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0600638  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0024  amidohydrolase  32.62 
 
 
299 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1743  S-adenosylhomocysteine deaminase  30.56 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1971  amidohydrolase  31.67 
 
 
416 aa  117  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4208  amidohydrolase  30.57 
 
 
416 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00909299  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1241  amidohydrolase  27.66 
 
 
414 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29686e-19 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0961  amidohydrolase  30.75 
 
 
413 aa  107  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3009  amidohydrolase  27.89 
 
 
414 aa  104  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3845  amidohydrolase  28.75 
 
 
392 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1825  amidohydrolase  31.27 
 
 
368 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.629302  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3409  amidohydrolase  28.65 
 
 
428 aa  103  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00196752  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0399  amidohydrolase  34.86 
 
 
412 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.408969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0398  amidohydrolase  35.64 
 
 
412 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.535979  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0370  amidohydrolase 1  36.31 
 
 
412 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  33.82 
 
 
444 aa  97.1  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0991  amidohydrolase  27.73 
 
 
413 aa  96.7  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8785  amidohydrolase  31.28 
 
 
428 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.988159  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.87 
 
 
484 aa  92.4  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0145  amidohydrolase  31.86 
 
 
432 aa  92.8  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15770  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.84 
 
 
445 aa  91.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  29.32 
 
 
440 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.87 
 
 
451 aa  92.4  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1515  amidohydrolase  28.24 
 
 
429 aa  91.7  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2081  amidohydrolase  27.93 
 
 
415 aa  90.9  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515321  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0873  cytosine deaminase  27.32 
 
 
457 aa  89.4  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.291965  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  28.69 
 
 
442 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.09 
 
 
441 aa  89.4  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  28.21 
 
 
432 aa  88.2  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1851  amidohydrolase  27.86 
 
 
432 aa  86.7  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1645  Atz/Trz family chlorohydrolase  28.8 
 
 
421 aa  86.7  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1708  Atz/Trz family chlorohydrolase  26.98 
 
 
420 aa  86.7  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0266273  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.53 
 
 
439 aa  85.9  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8056  amidohydrolase  27.57 
 
 
428 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0441  amidohydrolase  25.71 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1577  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.6 
 
 
455 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0236916  unclonable  0.000000239085 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0482  amidohydrolase  27.83 
 
 
416 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.338769 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0549  amidohydrolase  21.96 
 
 
425 aa  83.2  0.000000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000560695  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0576  amidohydrolase  26.91 
 
 
388 aa  82.8  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  28.8 
 
 
458 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1688  amidohydrolase  25.92 
 
 
440 aa  80.9  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.126758 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  23.77 
 
 
432 aa  80.5  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  26.5 
 
 
447 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1531  N-ethylammeline chlorohydrolase  46.08 
 
 
439 aa  80.1  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3616  formiminoglutamate deiminase  28.13 
 
 
452 aa  80.1  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0953492  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6263  formiminoglutamate deiminase  28.42 
 
 
429 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1506  amidohydrolase  29.33 
 
 
445 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111511  normal  0.058245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23240  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.23 
 
 
444 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576591 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1273  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.73 
 
 
438 aa  77.4  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  26.22 
 
 
431 aa  77  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.42 
 
 
444 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0289  amidohydrolase  27.66 
 
 
408 aa  77  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  38.61 
 
 
442 aa  76.6  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2149  N-ethylammeline chlorohydrolase  34.43 
 
 
446 aa  76.3  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.450112  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1743  hydrolase, Atz/Trz family  27.49 
 
 
443 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  31.55 
 
 
428 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.54 
 
 
444 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1460  chlorohydrolase  23.76 
 
 
435 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00231906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  27.5 
 
 
431 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  23.44 
 
 
422 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1183  amidohydrolase  23.44 
 
 
422 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2404  amidohydrolase  30.33 
 
 
432 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.378859  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0042  amidohydrolase  26.48 
 
 
426 aa  74.3  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3132  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.25 
 
 
465 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2584  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25 
 
 
465 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934679  normal  0.607445 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  24.02 
 
 
435 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  24.93 
 
 
440 aa  73.6  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  36.62 
 
 
464 aa  72.8  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  24.02 
 
 
435 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  24.02 
 
 
435 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1707  chlorohydrolase  24.02 
 
 
435 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1681  chlorohydrolase  24.02 
 
 
435 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00472799  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  32.16 
 
 
448 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  24.02 
 
 
435 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0809  amidohydrolase  25 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1721  chlorohydrolase  24.02 
 
 
441 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1915  amidohydrolase  24.73 
 
 
421 aa  71.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232567  normal  0.102109 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0677  amidohydrolase  35 
 
 
444 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0556  amidohydrolase  22.48 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.216303  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  23.76 
 
 
435 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1865  chlorohydrolase  23.76 
 
 
435 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1903  chlorohydrolase  23.76 
 
 
435 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2494  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.64 
 
 
442 aa  70.9  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3649  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.71 
 
 
443 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  24.74 
 
 
433 aa  70.5  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0947  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.02 
 
 
441 aa  70.1  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2295  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.99 
 
 
442 aa  70.1  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.853343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3705  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.93 
 
 
451 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  22.46 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2834  amidohydrolase  25.14 
 
 
451 aa  69.3  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  27.53 
 
 
656 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0086  amidohydrolase  22.92 
 
 
422 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  24.57 
 
 
431 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>