182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1829 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1599  hybrid cluster protein  65.69 
 
 
549 aa  758    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0893  hydroxylamine reductase  65.5 
 
 
546 aa  719    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0479  hydroxylamine reductase  63.03 
 
 
540 aa  724    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1125  hydroxylamine reductase  62.92 
 
 
542 aa  672    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000097703  normal  0.234741 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0506  hydroxylamine reductase  61.81 
 
 
542 aa  658    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.775368 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1669  hydroxylamine reductase  62.55 
 
 
540 aa  675    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.100106  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1490  hydroxylamine reductase  61.81 
 
 
540 aa  682    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000660036  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18290  hydroxylamine reductase  59.78 
 
 
555 aa  655    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000343984  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1053  hydroxylamine reductase  57.59 
 
 
539 aa  646    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1660  hydroxylamine reductase  58.5 
 
 
562 aa  650    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2909  hydroxylamine reductase  68.56 
 
 
547 aa  775    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1120  hydroxylamine reductase  71.2 
 
 
568 aa  847    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.170872  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2587  hydroxylamine reductase  68.37 
 
 
547 aa  773    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000431874  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1978  hydroxylamine reductase  62.55 
 
 
542 aa  681    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.881596  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0466  hydroxylamine reductase  61.44 
 
 
542 aa  639    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0149  hydroxylamine reductase  62.36 
 
 
542 aa  682    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00268758  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3948  hybrid cluster protein  59.6 
 
 
551 aa  667    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0512  hydroxylamine reductase  61.1 
 
 
540 aa  664    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.96139  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0036  hydroxylamine reductase  66.79 
 
 
542 aa  752    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4539  hydroxylamine reductase  68.8 
 
 
549 aa  765    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0977  hydroxylamine reductase  61.57 
 
 
555 aa  698    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.349617 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1595  hydroxylamine reductase  61.72 
 
 
543 aa  673    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.333402  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0970  hydroxylamine reductase  63.55 
 
 
591 aa  691    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164641  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0219  hydroxylamine reductase  61 
 
 
538 aa  680    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1919  hydroxylamine reductase  65.1 
 
 
553 aa  687    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.877615  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2875  hydroxylamine reductase  64.17 
 
 
548 aa  673    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115588  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1829  hydroxylamine reductase  100 
 
 
545 aa  1122    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0164  hydroxylamine reductase  63.79 
 
 
546 aa  714    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.930451  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2846  hydroxylamine reductase  69.76 
 
 
621 aa  811    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0749  hydroxylamine reductase  62.64 
 
 
543 aa  671    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000113817  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0957  hydroxylamine reductase  67.28 
 
 
547 aa  754    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0754  hydroxylamine reductase  57.07 
 
 
552 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2189  hydroxylamine reductase  57.51 
 
 
538 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00125687  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1634  hydroxylamine reductase  57.88 
 
 
538 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.228305  normal  0.622946 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1163  hydroxylamine reductase  52.58 
 
 
543 aa  580  1e-164  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2242  hydroxylamine reductase  55.76 
 
 
541 aa  566  1e-160  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.675401  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1173  hydroxylamine reductase  50.28 
 
 
549 aa  552  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000032867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1201  hydroxylamine reductase  51.38 
 
 
531 aa  533  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0213  hydroxylamine reductase  49.82 
 
 
533 aa  527  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2872  hydroxylamine reductase  49.02 
 
 
553 aa  528  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000295577  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3576  hydroxylamine reductase  49.91 
 
 
531 aa  528  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3702  hydroxylamine reductase  49.45 
 
 
533 aa  524  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.456407  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0663  hydroxylamine reductase  49.91 
 
 
541 aa  523  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.430546  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0585  hydroxylamine reductase  49.26 
 
 
533 aa  520  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000760383  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2647  hydroxylamine reductase  49.26 
 
 
533 aa  520  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.654819  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1364  hydroxylamine reductase  49.28 
 
 
549 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.453221  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1609  hydroxylamine reductase  49 
 
 
542 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.726092  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2834  hydroxylamine reductase  48.92 
 
 
547 aa  512  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787255  hitchhiker  0.00000000000275149 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3228  hydroxylamine reductase  48.63 
 
 
568 aa  514  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1600  hydroxylamine reductase  48.37 
 
 
542 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0674  hydroxylamine reductase  49.37 
 
 
548 aa  510  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.09718  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0988  hydroxylamine reductase  48.62 
 
 
539 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.160693 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0837  hydroxylamine reductase  47.67 
 
 
550 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00540032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1033  hydroxylamine reductase  48.36 
 
 
568 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1326  hydroxylamine reductase  51.49 
 
 
545 aa  501  1e-141  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.611962  normal  0.884501 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0596  hydroxylamine reductase  47.25 
 
 
535 aa  505  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0974  hydroxylamine reductase  47.6 
 
 
546 aa  501  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00100558  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3446  hydroxylamine reductase  45.65 
 
 
542 aa  499  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000118604 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1523  hydroxylamine reductase  52.8 
 
 
526 aa  499  1e-140  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.53511  normal  0.352571 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2641  hydroxylamine reductase  47.44 
 
 
537 aa  498  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.897837  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1750  hybrid cluster protein  46.89 
 
 
532 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.531638  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2941  hydroxylamine reductase  45.64 
 
 
565 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2386  hydroxylamine reductase  45.38 
 
 
566 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00790044  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1239  hydroxylamine reductase  47.65 
 
 
549 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000262121  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28240  hydroxylamine reductase  48.38 
 
 
525 aa  486  1e-136  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.230727 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0704  hydroxylamine reductase  46.69 
 
 
537 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.308475 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0742  hydroxylamine reductase  48.29 
 
 
531 aa  484  1e-135  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.483638  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3038  hydroxylamine reductase  47.29 
 
 
549 aa  480  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2759  hydroxylamine reductase  45.31 
 
 
549 aa  463  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1165  hydroxylamine reductase  44.6 
 
 
552 aa  462  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0845  hydroxylamine reductase  41.73 
 
 
545 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633582  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2190  hydroxylamine reductase  44.12 
 
 
526 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.317395  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1424  hydroxylamine reductase  45.72 
 
 
522 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.013462  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0816  hydroxylamine reductase  41.54 
 
 
545 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3188  hydroxylamine reductase  44.1 
 
 
544 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0212462 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2271  hydroxylamine reductase  44.24 
 
 
550 aa  450  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663099  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1293  hydroxylamine reductase  43.73 
 
 
554 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.86267  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3125  hydroxylamine reductase  42.47 
 
 
551 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3609  hydroxylamine reductase  42.73 
 
 
552 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1069  hydroxylamine reductase  43.29 
 
 
554 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1798  hydroxylamine reductase  43.55 
 
 
557 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1260  hydroxylamine reductase  43.37 
 
 
554 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2371  hydroxylamine reductase  42.68 
 
 
550 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1168  hydroxylamine reductase  42.73 
 
 
552 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1055  hydroxylamine reductase  43.78 
 
 
554 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0406  hybrid cluster protein  44.62 
 
 
554 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1260  hydroxylamine reductase  43.94 
 
 
552 aa  444  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181543  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2832  hydroxylamine reductase  43.01 
 
 
554 aa  445  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.310206  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0895  hydroxylamine reductase  42.83 
 
 
554 aa  444  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.62617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1216  hydroxylamine reductase  42.83 
 
 
554 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.453579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3097  hydroxylamine reductase  43.19 
 
 
554 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213297  normal  0.133055 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1174  hydroxylamine reductase  43.73 
 
 
554 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0529148  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4165  hydroxylamine reductase  40.26 
 
 
549 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2914  hydroxylamine reductase  42.65 
 
 
554 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3011  hydroxylamine reductase  42.47 
 
 
554 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1363  hydroxylamine reductase  42.47 
 
 
554 aa  437  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1657  hydroxylamine reductase  42.36 
 
 
556 aa  436  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.922648  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1121  hydroxylamine reductase  45.77 
 
 
555 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.800783  normal  0.249924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0981  hydroxylamine reductase  42.65 
 
 
557 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00091795 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1355  hydroxylamine reductase  42.36 
 
 
557 aa  436  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>