178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1807 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1807  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  100 
 
 
193 aa  367  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.988739  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  67.78 
 
 
96 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  80.88 
 
 
122 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  75 
 
 
126 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  63.24 
 
 
113 aa  94.4  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.34 
 
 
140 aa  84.7  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  51.9 
 
 
122 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  46.81 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  42.27 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.59 
 
 
106 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.48 
 
 
88 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  42.53 
 
 
120 aa  68.9  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  51.56 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  40.32 
 
 
88 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  34.92 
 
 
178 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.83 
 
 
145 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.47 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.75 
 
 
92 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  47.95 
 
 
180 aa  62.4  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  46.88 
 
 
200 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  48.44 
 
 
172 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  34.95 
 
 
147 aa  61.2  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  32.39 
 
 
139 aa  60.5  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  44.26 
 
 
104 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  47.46 
 
 
90 aa  59.3  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  43.75 
 
 
188 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  27.64 
 
 
155 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.51 
 
 
152 aa  58.5  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.47 
 
 
169 aa  58.5  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  27.59 
 
 
162 aa  58.2  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  44.07 
 
 
87 aa  58.2  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  44.07 
 
 
91 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  48.21 
 
 
162 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  44.07 
 
 
91 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2704  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.97 
 
 
146 aa  56.6  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.89 
 
 
163 aa  56.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.86 
 
 
90 aa  56.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  57.89 
 
 
130 aa  55.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  42.42 
 
 
104 aa  55.8  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1607  sec-independent translocase  32.99 
 
 
162 aa  55.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172406 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 
91 aa  55.5  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  65 
 
 
116 aa  55.1  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.55 
 
 
190 aa  55.1  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350642  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1772  twin-arginine translocation protein TatB  36.62 
 
 
150 aa  54.7  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.6 
 
 
234 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0700  sec-independent translocase  40.28 
 
 
154 aa  53.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.35 
 
 
214 aa  53.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  31.85 
 
 
155 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  33.78 
 
 
149 aa  52.8  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  42.03 
 
 
231 aa  53.1  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  42.03 
 
 
229 aa  52.4  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  32.91 
 
 
96 aa  52.4  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3591  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 
159 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.733353 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  50 
 
 
110 aa  52.4  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0842  sec-independent translocase  34.41 
 
 
170 aa  52.4  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5555  sec-independent translocase  37.5 
 
 
165 aa  52.4  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1987  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.98 
 
 
71 aa  52  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283995  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.08 
 
 
151 aa  52  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  35.59 
 
 
88 aa  52  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  47.06 
 
 
76 aa  52  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1181  sec-independent translocase  32.04 
 
 
152 aa  51.6  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  45.1 
 
 
77 aa  51.6  0.000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3400  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.9 
 
 
153 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3099  sec-independent translocase  31.58 
 
 
168 aa  51.2  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9857  Tat family transporter: protein export (chloroplast membrane protein HCF106C)  44.44 
 
 
67 aa  51.2  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.309601  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.14 
 
 
128 aa  51.2  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45427  predicted protein  35.53 
 
 
436 aa  50.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  34.41 
 
 
182 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3188  putative sec-independent protein translocase protein  47.27 
 
 
169 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885648  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2957  sec-independent translocase  35.62 
 
 
154 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.281897  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0815  sec-independent translocase  37.5 
 
 
160 aa  50.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  34.41 
 
 
182 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3709  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.19 
 
 
153 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  45.16 
 
 
91 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  34.41 
 
 
182 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  34.41 
 
 
182 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  34.41 
 
 
182 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  33.33 
 
 
146 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1210  twin-arginine translocation protein TatB  43.4 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03820  twin-arginine translocation protein, TatA subunit  31.67 
 
 
60 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0745  sec-independent translocase  37.5 
 
 
159 aa  50.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0849771  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.13 
 
 
99 aa  49.7  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1054  sec-independent translocase  29.91 
 
 
164 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0707  sec-independent translocase  36.11 
 
 
155 aa  50.1  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114909  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0782  sec-independent translocase  37.5 
 
 
159 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0330994 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  33.9 
 
 
88 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3518  twin arginine translocase protein A  45.21 
 
 
108 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000524898  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  33.33 
 
 
139 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  32.86 
 
 
171 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.86 
 
 
171 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0908  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.86 
 
 
167 aa  49.3  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.305104  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  31.65 
 
 
95 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  32.86 
 
 
171 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  32.86 
 
 
171 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  32.86 
 
 
171 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  32.86 
 
 
171 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  32.86 
 
 
171 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  32.86 
 
 
171 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  52.38 
 
 
84 aa  49.3  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  56.1 
 
 
96 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>