More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1768 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  100 
 
 
325 aa  663    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2028  NLP/P60 protein  41.76 
 
 
233 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  39.66 
 
 
202 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  44.7 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0199  NLP/P60 protein  44.63 
 
 
191 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  36.31 
 
 
181 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  44.88 
 
 
267 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  43.59 
 
 
265 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  41.86 
 
 
221 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  47.33 
 
 
302 aa  108  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
424 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  46.34 
 
 
220 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  42.97 
 
 
234 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  41.83 
 
 
187 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  43.97 
 
 
223 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  41.94 
 
 
181 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  44.86 
 
 
368 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  41.67 
 
 
193 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  42.96 
 
 
183 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  38.81 
 
 
218 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  38.85 
 
 
221 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  38.81 
 
 
218 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  38.81 
 
 
218 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  38.81 
 
 
218 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  38.81 
 
 
234 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
274 aa  105  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  38.81 
 
 
234 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  38.81 
 
 
234 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  38.81 
 
 
234 aa  105  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0021  NLP/P60 protein  43.55 
 
 
165 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  40.16 
 
 
224 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  41.53 
 
 
223 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  41.94 
 
 
205 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  41.53 
 
 
223 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  45.9 
 
 
192 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  42.37 
 
 
223 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  42.37 
 
 
223 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  41.61 
 
 
283 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  42.37 
 
 
223 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  37.84 
 
 
150 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  41.53 
 
 
224 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  45.9 
 
 
192 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  42.28 
 
 
221 aa  103  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  40.46 
 
 
177 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  41.8 
 
 
173 aa  103  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  40.46 
 
 
197 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  42.96 
 
 
283 aa  102  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  43.7 
 
 
273 aa  102  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  41.94 
 
 
266 aa  102  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  44.17 
 
 
150 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  40.34 
 
 
476 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  43.38 
 
 
201 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  41.73 
 
 
179 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  37.78 
 
 
269 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  41.79 
 
 
452 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1717  NLP/P60 protein  41.48 
 
 
324 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00794283  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  41.8 
 
 
217 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  37.78 
 
 
269 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  39.37 
 
 
283 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  44.55 
 
 
327 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  38.26 
 
 
342 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  39.02 
 
 
209 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  39.37 
 
 
283 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  39.37 
 
 
283 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  44.96 
 
 
211 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  39.02 
 
 
209 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  43.48 
 
 
278 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  42.19 
 
 
273 aa  99.8  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  40.32 
 
 
177 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0239  NlpC/P60 family protein  44.35 
 
 
249 aa  100  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  42.37 
 
 
341 aa  99.8  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  46.22 
 
 
242 aa  99.8  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3380  NLP/P60 protein  44.35 
 
 
234 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  43.93 
 
 
340 aa  99.8  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  41.27 
 
 
156 aa  99.8  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3393  NLP/P60 protein  38.93 
 
 
208 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00222  predicted lipoprotein and C40 family peptidase  38.93 
 
 
249 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00226  hypothetical protein  38.93 
 
 
249 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  36.16 
 
 
458 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  39.69 
 
 
174 aa  99  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  38.81 
 
 
178 aa  99  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  39.52 
 
 
177 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0255  NlpC/P60 family protein  43.55 
 
 
269 aa  99  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0271  NlpC/P60 family protein  43.55 
 
 
257 aa  99  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.677165 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  38.67 
 
 
333 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  42.74 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  41.38 
 
 
208 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  41.61 
 
 
198 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0261  NlpC/P60 family protein  43.55 
 
 
269 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  40.5 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  38.18 
 
 
194 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
188 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0223  YafL  38.26 
 
 
249 aa  97.8  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  41.41 
 
 
275 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  39.52 
 
 
177 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  41.74 
 
 
303 aa  97.4  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  40.5 
 
 
279 aa  97.4  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  42.28 
 
 
177 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  41.41 
 
 
271 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  41.41 
 
 
271 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>