More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1733 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  100 
 
 
299 aa  595  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2857  phosphoribosyltransferase  49.55 
 
 
274 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  42.27 
 
 
251 aa  149  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  42.08 
 
 
246 aa  127  2e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  38.86 
 
 
230 aa  126  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  40.09 
 
 
256 aa  123  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  41.59 
 
 
241 aa  122  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0541  phosphoribosyltransferase  40.96 
 
 
269 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  34.6 
 
 
239 aa  119  8e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  41.18 
 
 
241 aa  117  2e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  42.08 
 
 
241 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  37 
 
 
242 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  39.3 
 
 
227 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  41.98 
 
 
237 aa  115  1e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  40.54 
 
 
244 aa  114  2e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  39.73 
 
 
243 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  35.51 
 
 
236 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  37.27 
 
 
243 aa  111  1e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  32.66 
 
 
258 aa  110  2e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  39.19 
 
 
244 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  33.02 
 
 
258 aa  108  9e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  37.9 
 
 
243 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.9 
 
 
243 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  39.25 
 
 
247 aa  105  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  39.43 
 
 
241 aa  105  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  36.41 
 
 
259 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  36 
 
 
239 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  34.25 
 
 
237 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  2.95242e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  36.23 
 
 
233 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  36.49 
 
 
268 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  38.21 
 
 
241 aa  102  9e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  32.11 
 
 
245 aa  102  9e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.16 
 
 
246 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  38.21 
 
 
241 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  35.62 
 
 
261 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0258  amidophosphoribosyltransferases-like protein  37.75 
 
 
279 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  37.78 
 
 
230 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  35.94 
 
 
264 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  38.32 
 
 
246 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  35.93 
 
 
260 aa  99.8  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  31.48 
 
 
270 aa  99.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  33.72 
 
 
233 aa  99.8  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3826  gluconate periplasmic binding protein  34.98 
 
 
227 aa  97.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0367  comF family protein  33.19 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.36 
 
 
240 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3006  phosphoribosyltransferase  36.29 
 
 
270 aa  97.4  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  37.04 
 
 
254 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.39 
 
 
238 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.02342e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
238 aa  96.7  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  32.89 
 
 
246 aa  95.9  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  34.53 
 
 
238 aa  95.9  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.86 
 
 
233 aa  95.9  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  1.70778e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  27.71 
 
 
230 aa  95.9  8e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  31.75 
 
 
227 aa  95.5  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  1.80305e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  32.53 
 
 
286 aa  95.5  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  31.86 
 
 
262 aa  95.5  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  36.41 
 
 
240 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  33.98 
 
 
255 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  29.25 
 
 
229 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  34.67 
 
 
258 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  35.78 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  27.91 
 
 
220 aa  94.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  7.9712e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  31.4 
 
 
296 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  37.16 
 
 
248 aa  94  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  36.57 
 
 
272 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  38.16 
 
 
215 aa  94  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  34.11 
 
 
253 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  34.11 
 
 
247 aa  93.6  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  35.06 
 
 
269 aa  93.2  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  32.42 
 
 
262 aa  93.2  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  39.43 
 
 
240 aa  92.8  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  35.51 
 
 
233 aa  92  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  35.58 
 
 
242 aa  91.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  31.98 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  2.28235e-09  hitchhiker  2.30998e-07 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  29.86 
 
 
234 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  33.33 
 
 
234 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  36.32 
 
 
239 aa  91.3  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  31.02 
 
 
271 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  36.02 
 
 
262 aa  91.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  34.76 
 
 
213 aa  90.5  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  35.75 
 
 
240 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  36.22 
 
 
276 aa  89.7  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.45098e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  31.37 
 
 
269 aa  89.7  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  31.8 
 
 
255 aa  89.4  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  37.22 
 
 
242 aa  89.4  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  36.04 
 
 
266 aa  89  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  33.78 
 
 
249 aa  89  9e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  39.41 
 
 
238 aa  88.6  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  32.86 
 
 
233 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  1.15929e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  37.31 
 
 
258 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  30.86 
 
 
230 aa  88.6  1e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  34.56 
 
 
263 aa  87.8  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  37.17 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0317  gluconate periplasmic binding protein  36.23 
 
 
233 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00615  amidophosphoribosyltransferase  32.2 
 
 
185 aa  87.4  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  26.54 
 
 
232 aa  88.2  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0453  phosphoribosyltransferase  36.53 
 
 
257 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0359  putative competence protein F-related protein  39.2 
 
 
240 aa  87.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.332104 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  39.88 
 
 
215 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  34.56 
 
 
237 aa  87.8  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>