174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1730 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1730  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  100 
 
 
974 aa  1931    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000283057  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0546  diguanylate cyclase  50.87 
 
 
792 aa  336  1e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.482559  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2851  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  48.7 
 
 
807 aa  335  3e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0788  TPR repeat-containing protein  46.68 
 
 
866 aa  301  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.940486  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3412  diguanylate cyclase with TPR repeats  34.9 
 
 
816 aa  204  8e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2188  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  39.05 
 
 
801 aa  189  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.73077 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  30.53 
 
 
795 aa  68.6  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 
221 aa  64.3  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  27 
 
 
739 aa  64.3  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 
909 aa  63.9  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  32.19 
 
 
266 aa  63.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  28.1 
 
 
865 aa  63.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 
265 aa  62  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 
637 aa  60.1  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 
362 aa  58.9  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  31 
 
 
808 aa  58.9  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 
681 aa  58.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 
265 aa  57.4  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.87 
 
 
810 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2243  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 
311 aa  56.6  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6122  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1955  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 
311 aa  56.6  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0490064  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
1486 aa  57  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  30 
 
 
816 aa  57  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  29.56 
 
 
603 aa  57  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  29.76 
 
 
540 aa  55.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 
878 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0486  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 
965 aa  55.5  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  27.6 
 
 
436 aa  55.5  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0054  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 
227 aa  55.1  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  29.73 
 
 
267 aa  55.1  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  32.55 
 
 
714 aa  54.7  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.88 
 
 
624 aa  54.7  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.07 
 
 
265 aa  53.9  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 
1049 aa  53.9  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  27.72 
 
 
1240 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 
602 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 
614 aa  53.9  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 
614 aa  53.9  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  31.71 
 
 
864 aa  53.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
685 aa  53.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  32.5 
 
 
732 aa  53.5  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.06 
 
 
626 aa  53.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.65 
 
 
293 aa  53.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 
847 aa  53.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  24.64 
 
 
461 aa  53.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28 
 
 
406 aa  53.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28 
 
 
406 aa  53.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.71 
 
 
875 aa  52.4  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 
265 aa  52.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.77 
 
 
1279 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1965  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
595 aa  52.4  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.546614  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  24.81 
 
 
467 aa  52.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  30 
 
 
397 aa  52.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  37.25 
 
 
937 aa  52  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 
3145 aa  52  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.52 
 
 
626 aa  52  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  26.4 
 
 
936 aa  52  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  30.3 
 
 
614 aa  51.6  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  30.3 
 
 
614 aa  51.6  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 
614 aa  51.6  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  30.3 
 
 
626 aa  51.6  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  32.37 
 
 
340 aa  51.2  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
697 aa  51.6  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 
643 aa  51.2  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
1094 aa  51.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 
313 aa  50.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 
435 aa  50.8  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.33 
 
 
730 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 
1421 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.39 
 
 
632 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  28.48 
 
 
780 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 
750 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 
280 aa  50.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.84 
 
 
887 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 
265 aa  50.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  25.35 
 
 
430 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  28.92 
 
 
566 aa  49.7  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 
374 aa  49.3  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  26.73 
 
 
395 aa  49.7  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0009  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.81 
 
 
620 aa  49.3  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
573 aa  49.7  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  27.43 
 
 
538 aa  49.7  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 
4489 aa  48.9  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  29.93 
 
 
681 aa  49.3  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 
626 aa  48.9  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 
274 aa  48.9  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
615 aa  48.9  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7095  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.86 
 
 
354 aa  48.9  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.524118  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.13 
 
 
565 aa  48.9  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 
2262 aa  48.9  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  25.66 
 
 
725 aa  48.5  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0419  hypothetical protein  28.44 
 
 
122 aa  48.5  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.831767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  39.36 
 
 
590 aa  48.5  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  39.36 
 
 
575 aa  48.5  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 
601 aa  48.1  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  27.27 
 
 
577 aa  48.1  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 
546 aa  48.1  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  30.65 
 
 
620 aa  48.1  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 
670 aa  48.1  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 
632 aa  48.1  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>