More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1711 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1519  replication restart DNA helicase PriA  56.67 
 
 		 823 aa  851    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1720  primosomal protein N'  49.25 
 
 		 778 aa  709    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.31928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0061  primosomal protein N'  61.21 
 
 		 806 aa  932    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0259  primosomal protein N'  48.14 
 
 		 769 aa  693    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1711  primosomal protein N'  100 
 
 		 794 aa  1593    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1781  primosomal protein N'  57.09 
 
 		 792 aa  858    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  34.72 
 
 		 732 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  39.84 
 
 		 732 aa  395  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  35.96 
 
 		 758 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  33.5 
 
 		 804 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  35.99 
 
 		 801 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  35.61 
 
 		 738 aa  389  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  41.92 
 
 		 751 aa  385  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  35.16 
 
 		 752 aa  385  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  34.83 
 
 		 754 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  31.07 
 
 		 815 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  33.1 
 
 		 813 aa  381  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  32.84 
 
 		 781 aa  381  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  30.47 
 
 		 801 aa  376  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  34.5 
 
 		 752 aa  378  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  32.08 
 
 		 802 aa  373  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  32.08 
 
 		 802 aa  373  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  32.33 
 
 		 818 aa  375  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  32.55 
 
 		 798 aa  374  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  31.62 
 
 		 802 aa  370  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  30.51 
 
 		 801 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  30.39 
 
 		 801 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  38.22 
 
 		 809 aa  372  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  30.37 
 
 		 801 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  39.79 
 
 		 746 aa  372  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  30.51 
 
 		 801 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  30.39 
 
 		 801 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  37.34 
 
 		 732 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  30.13 
 
 		 801 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  30.27 
 
 		 801 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  36 
 
 		 661 aa  369  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  31.86 
 
 		 802 aa  369  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  30.15 
 
 		 801 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  32.49 
 
 		 803 aa  367  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  31.66 
 
 		 798 aa  369  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  38.5 
 
 		 745 aa  366  1e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  30.39 
 
 		 801 aa  366  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  30.13 
 
 		 801 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  35.34 
 
 		 835 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  35.74 
 
 		 743 aa  362  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0165  primosome assembly protein PriA  34.79 
 
 		 843 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  38.24 
 
 		 775 aa  362  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  39.26 
 
 		 858 aa  360  4e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  32.96 
 
 		 768 aa  359  9e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  30.36 
 
 		 796 aa  359  9.999999999999999e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  34.92 
 
 		 739 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1434  primosomal protein N'  34.81 
 
 		 814 aa  356  1e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  34.3 
 
 		 744 aa  355  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1542  primosomal protein N'  30.97 
 
 		 810 aa  355  2.9999999999999997e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.337717  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  34.53 
 
 		 739 aa  354  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45350  primosome assembly protein PriA  36.02 
 
 		 739 aa  353  5.9999999999999994e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  34.77 
 
 		 746 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  34.56 
 
 		 849 aa  352  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  28.78 
 
 		 790 aa  352  2e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  34.49 
 
 		 739 aa  352  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  34.61 
 
 		 739 aa  350  5e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  34.91 
 
 		 848 aa  350  5e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  34.74 
 
 		 724 aa  349  1e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  36.73 
 
 		 679 aa  348  2e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2378  primosome assembly protein PriA  38.78 
 
 		 735 aa  346  8.999999999999999e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  36.98 
 
 		 749 aa  346  1e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  29.12 
 
 		 803 aa  346  1e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  39.2 
 
 		 730 aa  345  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0400  primosome assembly protein PriA  34.12 
 
 		 744 aa  345  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  39.24 
 
 		 739 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  35.73 
 
 		 731 aa  345  2e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  35.73 
 
 		 731 aa  344  4e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1173  primosomal protein N'  32.2 
 
 		 715 aa  342  1e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0603  primosome assembly protein PriA  35.02 
 
 		 740 aa  342  1e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  34.73 
 
 		 738 aa  342  2e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  31.52 
 
 		 914 aa  340  5e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0896  replication restart DNA helicase PriA  34.54 
 
 		 821 aa  340  7e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0600783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  34.71 
 
 		 828 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1737  primosome assembly protein PriA  36.74 
 
 		 744 aa  338  1.9999999999999998e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1804  primosome assembly protein PriA  36.74 
 
 		 744 aa  338  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.207657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  33.71 
 
 		 739 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  38.01 
 
 		 732 aa  338  2.9999999999999997e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1430  primosomal protein N'  34.81 
 
 		 812 aa  337  5.999999999999999e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1100  primosome assembly protein PriA  37.9 
 
 		 740 aa  335  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.136988  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1169  primosomal protein N'  32.45 
 
 		 811 aa  335  2e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.807249  normal  0.476891 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2267  primosome assembly protein PriA  41.77 
 
 		 745 aa  335  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2792  primosomal protein N'  33.42 
 
 		 745 aa  335  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  35.8 
 
 		 747 aa  333  8e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  38.78 
 
 		 739 aa  332  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0764  primosomal protein N'  41.04 
 
 		 736 aa  332  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129915  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0651  primosome assembly protein PriA  39.06 
 
 		 806 aa  331  3e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0764  primosomal protein N'  40.27 
 
 		 736 aa  331  3e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2035  transcriptional regulator, TrmB  29.29 
 
 		 817 aa  330  5.0000000000000004e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2327  primosomal protein N'  36.54 
 
 		 734 aa  330  6e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0753846  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0822  primosomal protein N'  34.71 
 
 		 723 aa  330  6e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102519  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0770  primosomal protein N'  35.94 
 
 		 735 aa  330  6e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.654251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1417  primosomal protein N'  35.8 
 
 		 810 aa  330  6e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1987  primosomal protein N' (replication factor Y)  35 
 
 		 774 aa  330  8e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2597  primosomal protein N'(replication factor Y)( helicase)  29.93 
 
 		 815 aa  329  1.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.510107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0727  replication restart DNA helicase PriA  40.85 
 
 		 736 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.539418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>