More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1681 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1681  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
247 aa  503  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1214  DNA-binding response regulator KdpE  57.33 
 
 
237 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000130813  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2842  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.26 
 
 
235 aa  264  8e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 
232 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 
232 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  48.66 
 
 
232 aa  218  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  48 
 
 
232 aa  217  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 
232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3248  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 
232 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1312  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 
232 aa  214  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.1865 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  48.25 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1672  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 
232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2284  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 
232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2307  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 
232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1872  DNA-binding response regulator KdpE  48.25 
 
 
234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1397  DNA-binding response regulator KdpE  48.25 
 
 
232 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.089264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1088  DNA-binding response regulator KdpE  48.25 
 
 
234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0779  DNA-binding response regulator KdpE  48.25 
 
 
234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97246  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1246  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  48.25 
 
 
232 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1254  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  48.25 
 
 
234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00667548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  48.25 
 
 
234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.25 
 
 
235 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  51.34 
 
 
233 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3600  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 
235 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2213  DNA binding response regulator KdpE  48.89 
 
 
231 aa  209  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1172  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.26 
 
 
235 aa  209  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  48 
 
 
231 aa  209  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  47.56 
 
 
230 aa  208  8e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4088  response regulator receiver  46.22 
 
 
231 aa  207  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0763  DNA-binding transcriptional activator KdpE  48.66 
 
 
225 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.34 
 
 
231 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0891  two component transcriptional regulator  50 
 
 
231 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1206  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 
225 aa  206  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10580  Response regulator  48.21 
 
 
229 aa  205  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0787  DNA-binding transcriptional activator KdpE  48.21 
 
 
225 aa  205  7e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 
225 aa  204  8e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0716  DNA-binding transcriptional activator KdpE  48.21 
 
 
225 aa  204  8e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0593355  normal  0.505732 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.89 
 
 
231 aa  204  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0810  DNA-binding transcriptional activator KdpE  48.21 
 
 
225 aa  204  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00651  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with KdpD  48.21 
 
 
225 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0741  DNA-binding transcriptional activator KdpE  48.21 
 
 
225 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000675118  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0860  DNA-binding transcriptional activator KdpE  48.66 
 
 
225 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00642  hypothetical protein  48.21 
 
 
225 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0720  DNA-binding transcriptional activator KdpE  48.21 
 
 
225 aa  204  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0669037  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0750  DNA-binding transcriptional activator KdpE  48.66 
 
 
225 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.358042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1222  two component transcriptional regulator  47.86 
 
 
235 aa  203  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2962  DNA-binding transcriptional activator KdpE  47.77 
 
 
225 aa  203  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0824  DNA-binding transcriptional activator KdpE  48.21 
 
 
225 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0770111 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1079  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 
230 aa  202  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.67 
 
 
231 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000420296  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0386  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 
229 aa  202  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1214  DNA-binding transcriptional activator KdpE  45.98 
 
 
226 aa  201  6e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00514307  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1244  DNA-binding transcriptional activator KdpE  44.54 
 
 
229 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00224308  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4990  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 
230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0555  DNA-binding transcriptional activator KdpE  47.32 
 
 
225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3050  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 
224 aa  199  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.519152  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3717  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  42.92 
 
 
244 aa  198  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2490  DNA-binding response regulator KdeP  46.09 
 
 
231 aa  198  7e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0057  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 
231 aa  198  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0059  response regulator receiver  46.09 
 
 
231 aa  198  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1587  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 
231 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0742  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 
245 aa  197  9e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2437  two component transcriptional regulator  51.11 
 
 
233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2540  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 
228 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0359  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 
236 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274157  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2604  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 
246 aa  195  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1884  response regulator receiver protein  42.08 
 
 
244 aa  195  7e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5362  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 
230 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0748621 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2931  DNA-binding transcriptional activator KdpE  45.09 
 
 
229 aa  193  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4253  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 
228 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5920  two component transcriptional regulator  44.21 
 
 
247 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0042  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 
231 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189828  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1708  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 
228 aa  192  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.476364 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3087  response regulator transcription regulator protein  45.78 
 
 
234 aa  191  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3370  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 
234 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3023  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 
234 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0828  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.54 
 
 
232 aa  191  1e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.159677 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 
232 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1126  DNA-binding transcriptional activator KdpE  44.64 
 
 
226 aa  190  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.296902  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  44.4 
 
 
231 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  45.33 
 
 
224 aa  189  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2502  two-component response regulator of kdp operon  46.64 
 
 
234 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1666  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 
230 aa  189  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2154  response regulator receiver  44.4 
 
 
231 aa  188  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0828561  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2116  two component transcriptional regulator  44.4 
 
 
231 aa  188  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.291778  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 
231 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5960  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 
226 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.891848  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 
230 aa  186  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  43.1 
 
 
231 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 
231 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1269  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 
228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1196  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 
240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6070  two component response regulator  45.13 
 
 
228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11045  transcriptional regulatory protein kdpE  43.3 
 
 
226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1155  DNA-binding transcriptional activator KdpE  45.19 
 
 
209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1102  DNA-binding transcriptional activator KdpE  45.19 
 
 
209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000603864  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4649  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 
230 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.424735  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  42.04 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3578  DNA-binding transcriptional activator KdpE  45.19 
 
 
209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.693422  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 
241 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.871415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>