More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1676 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1676  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 339 aa  711    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1976  ornithine carbamoyltransferase  62.24 
 
 		 332 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4647  ornithine carbamoyltransferase  62.2 
 
 		 333 aa  434  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03645  ornithine carbamoyltransferase  59.27 
 
 		 334 aa  427  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2091  ornithine carbamoyltransferase  59.7 
 
 		 334 aa  427  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.63428  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0520  ornithine carbamoyltransferase  59.09 
 
 		 334 aa  424  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2240  ornithine carbamoyltransferase  61.28 
 
 		 333 aa  426  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.385823  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002420  ornithine carbamoyltransferase  58.66 
 
 		 334 aa  423  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3549  ornithine carbamoyltransferase subunit I  60.3 
 
 		 335 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4042  ornithine carbamoyltransferase subunit I  60 
 
 		 335 aa  418  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4811  ornithine carbamoyltransferase  59.39 
 
 		 334 aa  417  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.278589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0554  ornithine carbamoyltransferase  59.4 
 
 		 339 aa  420  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0450  ornithine carbamoyltransferase  59.09 
 
 		 334 aa  421  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.601732  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4847  ornithine carbamoyltransferase  59.39 
 
 		 334 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4748  ornithine carbamoyltransferase  59.39 
 
 		 334 aa  417  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4867  ornithine carbamoyltransferase  59.39 
 
 		 334 aa  417  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3684  ornithine carbamoyltransferase subunit I  60.3 
 
 		 335 aa  420  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1992  ornithine carbamoyltransferase  60.37 
 
 		 334 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5775  ornithine carbamoyltransferase subunit I  60.48 
 
 		 334 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2799  ornithine carbamoyltransferase  58.79 
 
 		 334 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04120  ornithine carbamoyltransferase 1  60.18 
 
 		 334 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3743  ornithine carbamoyltransferase  60.48 
 
 		 334 aa  414  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3758  ornithine carbamoyltransferase subunit I  60.18 
 
 		 334 aa  412  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4734  ornithine carbamoyltransferase subunit I  60.18 
 
 		 334 aa  412  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.488433  normal  0.892607 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4510  ornithine carbamoyltransferase subunit I  60.18 
 
 		 334 aa  412  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0746684  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4825  ornithine carbamoyltransferase subunit I  60.48 
 
 		 337 aa  413  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04084  hypothetical protein  60.18 
 
 		 334 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4829  ornithine carbamoyltransferase subunit I  59.58 
 
 		 334 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3732  ornithine carbamoyltransferase subunit I  58.21 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0374  ornithine carbamoyltransferase subunit I  58.38 
 
 		 335 aa  408  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4754  ornithine carbamoyltransferase subunit I  58.68 
 
 		 334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4853  ornithine carbamoyltransferase subunit I  58.68 
 
 		 334 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4724  ornithine carbamoyltransferase subunit I  58.68 
 
 		 334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.262435 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4872  ornithine carbamoyltransferase subunit I  58.68 
 
 		 334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.502026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0425  ornithine carbamoyltransferase subunit I  58.68 
 
 		 335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0459  ornithine carbamoyltransferase subunit F  58.98 
 
 		 334 aa  407  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0130179 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4817  ornithine carbamoyltransferase subunit I  58.38 
 
 		 334 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0433  ornithine carbamoyltransferase  57.93 
 
 		 333 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.776106  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3332  ornithine carbamoyltransferase  58.38 
 
 		 334 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.374478  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3566  ornithine carbamoyltransferase subunit I  58.38 
 
 		 339 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1227  ornithine carbamoyltransferase  57.83 
 
 		 333 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.149639  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1252  ornithine carbamoyltransferase  57.83 
 
 		 333 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2126  ornithine carbamoyltransferase  56.63 
 
 		 332 aa  394  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5576  ornithine carbamoyltransferase  55.79 
 
 		 332 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1107  ornithine carbamoyltransferase  56.5 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7762  normal  0.256568 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0425  ornithine carbamoyltransferase  56.53 
 
 		 335 aa  389  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4387  ornithine carbamoyltransferase  56.5 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779242  normal  0.180645 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1037  ornithine carbamoyltransferase  56.5 
 
 		 336 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5203  ornithine carbamoyltransferase  55.15 
 
 		 334 aa  388  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.789532  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1000  ornithine carbamoyltransferase  56.19 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5912  ornithine carbamoyltransferase  54.98 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4224  ornithine carbamoyltransferase  55.89 
 
 		 336 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2385  ornithine carbamoyltransferase  57.58 
 
 		 336 aa  384  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0499309  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1876  ornithine carbamoyltransferase  54.88 
 
 		 332 aa  384  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0999  ornithine carbamoyltransferase  56.19 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68340  ornithine carbamoyltransferase  55.29 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.246244  normal  0.170592 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2351  ornithine carbamoyltransferase  55.12 
 
 		 333 aa  384  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2685  ornithine carbamoyltransferase  55.29 
 
 		 336 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.841413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1908  ornithine carbamoyltransferase  58.62 
 
 		 331 aa  384  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000351047  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0747  ornithine carbamoyltransferase  55.89 
 
 		 333 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0828856 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1146  ornithine carbamoyltransferase  57.27 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2127  ornithine carbamoyltransferase  57.27 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2176  ornithine carbamoyltransferase  53.66 
 
 		 332 aa  378  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0914  ornithine carbamoyltransferase  57.27 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12594  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1586  ornithine carbamoyltransferase  57.27 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1986  ornithine carbamoyltransferase  57.27 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.370878  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0245  ornithine carbamoyltransferase  57.27 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380448  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1967  ornithine carbamoyltransferase  57.27 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.604049  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4538  ornithine carbamoyltransferase  57.14 
 
 		 336 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0837196  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02370  ornithine carbamoyltransferase  56.57 
 
 		 331 aa  377  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.293811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00840  ornithine carbamoyltransferase  56.57 
 
 		 331 aa  377  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.96498 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0929  ornithine carbamoyltransferase  55.96 
 
 		 338 aa  372  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.142101  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6442  ornithine carbamoyltransferase  54.08 
 
 		 336 aa  371  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.316397  normal  0.303934 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2425  ornithine carbamoyltransferase  53.03 
 
 		 334 aa  371  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0068  ornithine carbamoyltransferase  54.88 
 
 		 329 aa  368  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0090  ornithine carbamoyltransferase, catabolic  54.1 
 
 		 331 aa  370  1e-101  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1948  ornithine carbamoyltransferase  56.1 
 
 		 331 aa  366  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0387191  normal  0.307808 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0182  ornithine carbamoyltransferase  55.66 
 
 		 330 aa  363  2e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06550  ornithine carbamoyltransferase  54.88 
 
 		 331 aa  359  4e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  0.675152 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06660  ornithine carbamoyltransferase  53.5 
 
 		 331 aa  358  6e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000120015  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0342  ornithine carbamoyltransferase  52.74 
 
 		 332 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0473  ornithine carbamoyltransferase  52.44 
 
 		 332 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0158  ornithine carbamoyltransferase  52.45 
 
 		 331 aa  352  4e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0408  ornithine carbamoyltransferase  52.44 
 
 		 332 aa  352  4e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.297743 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0162  ornithine carbamoyltransferase  52.45 
 
 		 331 aa  352  5e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0421  ornithine carbamoyltransferase  52.44 
 
 		 332 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.730242  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1390  ornithine carbamoyltransferase  52.58 
 
 		 334 aa  352  7e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00030197  normal  0.635885 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0872  ornithine carbamoyltransferase  51.06 
 
 		 327 aa  348  5e-95  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00322562  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0349  ornithine carbamoyltransferase  51.96 
 
 		 332 aa  348  6e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4897  ornithine carbamoyltransferase  51.83 
 
 		 332 aa  347  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0031  ornithine carbamoyltransferase  51.06 
 
 		 334 aa  345  8e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2165  ornithine carbamoyltransferase  51.52 
 
 		 337 aa  343  2.9999999999999997e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1457  ornithine carbamoyltransferase  49.39 
 
 		 338 aa  336  2.9999999999999997e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2321  ornithine carbamoyltransferase  49.24 
 
 		 354 aa  332  6e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0421  ornithine carbamoyltransferase  50.46 
 
 		 312 aa  324  1e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000841393  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2658  ornithine carbamoyltransferase  48.17 
 
 		 336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2714  ornithine carbamoyltransferase  48.17 
 
 		 336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0649  ornithine carbamoyltransferase  46.93 
 
 		 326 aa  319  3.9999999999999996e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0046026  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0860  ornithine carbamoyltransferase  46.2 
 
 		 333 aa  313  3.9999999999999997e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2249  ornithine carbamoyltransferase  47.26 
 
 		 335 aa  312  6.999999999999999e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>