281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1596 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1596  MATE efflux family protein  100 
 
 		 438 aa  863    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000302768  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0693  MATE efflux family protein  50.12 
 
 		 489 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.266905 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2651  MATE efflux family protein  46.67 
 
 		 495 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.6642  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0999  MATE efflux family protein  49.07 
 
 		 473 aa  375  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2173  MATE efflux family protein  43.81 
 
 		 481 aa  347  3e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.843006 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2521  MATE efflux family protein  41.84 
 
 		 461 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2333  MATE efflux family protein  32.08 
 
 		 456 aa  160  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  24.21 
 
 		 438 aa  120  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 461 aa  94.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  22.97 
 
 		 477 aa  94.4  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  24.63 
 
 		 453 aa  90.1  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  24.2 
 
 		 458 aa  89  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  24.19 
 
 		 467 aa  86.7  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  22.44 
 
 		 462 aa  86.3  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  24.59 
 
 		 464 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  23.76 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  24.71 
 
 		 500 aa  83.2  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 468 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  25.55 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  22.66 
 
 		 454 aa  82.8  0.00000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  23.52 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  25.07 
 
 		 469 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  26.09 
 
 		 462 aa  80.9  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  26.17 
 
 		 492 aa  80.5  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  27.75 
 
 		 486 aa  80.5  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  22.93 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  25.95 
 
 		 458 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  24.64 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  25.74 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  25.74 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1166  MATE efflux family protein  24.19 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0144354 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  24.36 
 
 		 448 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  25.78 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  25.46 
 
 		 477 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 486 aa  76.6  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  25.75 
 
 		 477 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 457 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  25.06 
 
 		 455 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  27 
 
 		 483 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  21.99 
 
 		 453 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  21.6 
 
 		 495 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  20 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  20.99 
 
 		 469 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  23.96 
 
 		 455 aa  74.3  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  22.39 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  20.99 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  22.03 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  19.85 
 
 		 469 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  21.6 
 
 		 547 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  20.74 
 
 		 469 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  20.74 
 
 		 469 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  21.6 
 
 		 547 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  21.6 
 
 		 546 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  20.74 
 
 		 469 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  24.63 
 
 		 469 aa  73.2  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  21.46 
 
 		 495 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  19.85 
 
 		 469 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  21.09 
 
 		 469 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  19.85 
 
 		 469 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  20.74 
 
 		 469 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  21.46 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  24.37 
 
 		 466 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  21.6 
 
 		 484 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  22.04 
 
 		 478 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  21.6 
 
 		 546 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  25.64 
 
 		 490 aa  72  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  21.76 
 
 		 464 aa  71.2  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  21.76 
 
 		 464 aa  71.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  20.49 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  23.19 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  21.99 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  23.32 
 
 		 498 aa  71.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  23.59 
 
 		 468 aa  70.5  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  23.64 
 
 		 464 aa  70.1  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  19.85 
 
 		 469 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  19.6 
 
 		 469 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  25 
 
 		 485 aa  68.2  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  23.31 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  22.38 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  22.4 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  26.73 
 
 		 496 aa  67  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  23.51 
 
 		 471 aa  66.6  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  25.51 
 
 		 466 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  26.38 
 
 		 524 aa  65.9  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.71 
 
 		 461 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  21.43 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  24.3 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  20.83 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  22.2 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  20.78 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.22 
 
 		 485 aa  63.5  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1856  Na+-driven multidrug efflux pump  22.91 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0920105  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 494 aa  63.5  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  26.04 
 
 		 482 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  20.36 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1641  Na+ driven multidrug antiporter, N-terminus  27.08 
 
 		 238 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  23.53 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  24.44 
 
 		 443 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  28.22 
 
 		 478 aa  62.4  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  24.63 
 
 		 457 aa  62  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>