More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1510 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  100 
 
 
275 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0487  Methyltransferase type 11  28.78 
 
 
270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000866959 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  25.76 
 
 
270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  31.37 
 
 
292 aa  122  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  27.14 
 
 
284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  28.46 
 
 
289 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  28.79 
 
 
267 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  28.83 
 
 
299 aa  102  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  25.58 
 
 
284 aa  98.2  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  23.19 
 
 
286 aa  96.3  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  24.02 
 
 
323 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  27.34 
 
 
288 aa  94  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  27.13 
 
 
294 aa  93.2  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  30.86 
 
 
279 aa  88.6  9e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2634  hypothetical protein  23.74 
 
 
268 aa  77  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.167376  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  22.18 
 
 
283 aa  72  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  30.87 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  20.68 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  32.09 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  25.88 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  31.5 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  24.9 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25 
 
 
291 aa  63.5  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  30.87 
 
 
279 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  21.61 
 
 
286 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  28.88 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  20.41 
 
 
286 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  22.58 
 
 
268 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  24.87 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 
255 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  23.77 
 
 
287 aa  60.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  24.62 
 
 
275 aa  58.9  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  25.19 
 
 
273 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  24.66 
 
 
261 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  25.19 
 
 
273 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  27 
 
 
278 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1749  methyltransferase type 12  36.08 
 
 
215 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.110719  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  22.92 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  24.5 
 
 
271 aa  57  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  28.57 
 
 
264 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  23.02 
 
 
269 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.9 
 
 
352 aa  56.6  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  22.61 
 
 
279 aa  55.5  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  29.33 
 
 
273 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  25.37 
 
 
287 aa  55.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  42.11 
 
 
415 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10570  benzoquinone methyltransferase  28.57 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175539  normal  0.480356 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5806  Methyltransferase type 11  39.18 
 
 
281 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  33.02 
 
 
234 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  25.58 
 
 
291 aa  54.3  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  36.25 
 
 
226 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  31.18 
 
 
252 aa  54.7  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1553  methyltransferase type 11  49.18 
 
 
210 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.920902  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1607  methyltransferase type 11  49.18 
 
 
210 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722742  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  29.31 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1583  methyltransferase type 11  49.18 
 
 
197 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.634707  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  24.32 
 
 
268 aa  53.1  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  25.52 
 
 
293 aa  52.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  36.71 
 
 
265 aa  52.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1176  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  40.79 
 
 
463 aa  52  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0393959  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  40.79 
 
 
449 aa  52.4  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0268238  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_002620  TC0410  hypothetical protein  28.57 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.404807  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  25.38 
 
 
277 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1102  RNA methyltransferase, TrmA family  27.74 
 
 
446 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  28.46 
 
 
241 aa  51.6  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1286  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  36.27 
 
 
442 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0270354  unclonable  0.00000000011365 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  38.16 
 
 
449 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  25.43 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  40.79 
 
 
463 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0371274  normal  0.891306 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  38.16 
 
 
460 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  54.35 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  38.16 
 
 
458 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  38.16 
 
 
458 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  38.16 
 
 
458 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  38.16 
 
 
458 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  25 
 
 
302 aa  50.4  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  37.89 
 
 
283 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  38.16 
 
 
458 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  38.16 
 
 
458 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  38.16 
 
 
458 aa  50.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1192  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.79 
 
 
468 aa  50.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000506489  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1527  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35 
 
 
443 aa  50.1  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.334033  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  34.44 
 
 
190 aa  49.7  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  23.92 
 
 
265 aa  49.7  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  26.57 
 
 
291 aa  49.7  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  43.1 
 
 
266 aa  49.7  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1470  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35 
 
 
468 aa  49.7  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00598904  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1048  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  37.76 
 
 
455 aa  49.7  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366869  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  36.25 
 
 
306 aa  49.7  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1610  Methyltransferase type 11  36.14 
 
 
274 aa  49.7  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  22.56 
 
 
274 aa  49.3  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 
250 aa  49.3  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  29.66 
 
 
459 aa  49.3  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1032  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.45 
 
 
443 aa  49.3  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0127983  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  50 
 
 
262 aa  49.3  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0423  tRNA methyltransferase, TrmA family  31.94 
 
 
439 aa  48.9  0.00008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2314  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  41.94 
 
 
231 aa  49.3  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0251558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2460  hypothetical protein  29.29 
 
 
281 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.171848  normal  0.0255916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>