58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1422 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1422  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
185 aa  374  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1169  metal dependent phosphohydrolase  61.08 
 
 
187 aa  235  3e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0761  metal dependent phosphohydrolase  60.54 
 
 
185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.933081 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1591  hypothetical protein  57.3 
 
 
187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1974  metal dependent phosphohydrolase  54.1 
 
 
184 aa  187  9e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.475926  normal  0.164885 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0374  metal dependent phosphohydrolase  57.61 
 
 
184 aa  184  9e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1325  metal dependent phosphohydrolase  40.98 
 
 
180 aa  150  8.999999999999999e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0723  metal dependent phosphohydrolase  40.88 
 
 
180 aa  145  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1221  metal dependent phosphohydrolase  42.7 
 
 
182 aa  144  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0027  metal dependent phophohydrolase  39.67 
 
 
184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0279  HDIG domain-containing protein  41.85 
 
 
183 aa  139  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000148406  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0328  metal dependent phosphohydrolase  42.16 
 
 
217 aa  138  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15740  metal dependent phosphohydrolase  39.13 
 
 
183 aa  137  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329898  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1234  metal dependent phosphohydrolase  41.57 
 
 
175 aa  136  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0272  metal dependent phosphohydrolase  41.85 
 
 
183 aa  136  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00103666  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1488  metal dependent phosphohydrolase  40.76 
 
 
183 aa  131  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0145  metal dependent phosphohydrolase  38.04 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617038  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0422  metal dependent phosphohydrolase  43.62 
 
 
188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1412  metal dependent phosphohydrolase  40.96 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0296584 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2951  metal dependent phosphohydrolase  41.71 
 
 
189 aa  129  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1635  metal dependent phosphohydrolase  39.01 
 
 
181 aa  128  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0547  HDIG domain-containing protein  41.92 
 
 
183 aa  127  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0523  metal dependent phosphohydrolase  41.32 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1352  metal dependent phosphohydrolase  40.76 
 
 
183 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00103581  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_488  HD superfamily hydrolase  41.32 
 
 
183 aa  122  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0853951  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1569  metal dependent phophohydrolase  40.54 
 
 
184 aa  122  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2783  HDIG domain-containing protein  39.13 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2011  metal dependent phosphohydrolase  35.33 
 
 
183 aa  117  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000379503  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3535  metal dependent phosphohydrolase  38.98 
 
 
199 aa  115  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0692  metal dependent phophohydrolase  36.76 
 
 
191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000253532  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1079  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 
196 aa  108  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0703  metal dependent phophohydrolase  36.22 
 
 
191 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000160771 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2682  metal dependent phosphohydrolase  37.23 
 
 
190 aa  107  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0703847  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1228  hypothetical protein  35.14 
 
 
183 aa  106  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2258  metal dependent phosphohydrolase  39.13 
 
 
186 aa  105  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.331666  hitchhiker  0.000431176 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2818  HDIG domain-containing protein  41.85 
 
 
201 aa  105  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0140878 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01460  predicted HD superfamily hydrolase  34.78 
 
 
200 aa  102  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0275977  normal  0.728206 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2145  metal dependent phosphohydrolase  39.18 
 
 
187 aa  99.8  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3835  metal dependent phophohydrolase  39.36 
 
 
216 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3779  metal dependent phosphohydrolase  39.36 
 
 
218 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3919  metal dependent phophohydrolase  39.36 
 
 
214 aa  97.8  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300311  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3184  metal dependent phophohydrolase  35.56 
 
 
186 aa  97.8  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3897  metal dependent phophohydrolase  37.37 
 
 
224 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0567621 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3414  metal dependent phosphohydrolase  34.47 
 
 
212 aa  95.5  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.014123 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0010  metal dependent phosphohydrolase  37.84 
 
 
190 aa  95.9  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2109  metal dependent phosphohydrolase  34.24 
 
 
185 aa  92.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00149234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4580  metal dependent phosphohydrolase  36.41 
 
 
200 aa  90.5  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000627017  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3456  metal dependent phophohydrolase  33.33 
 
 
213 aa  89  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.986512  normal  0.0301443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5425  metal dependent phophohydrolase  37.97 
 
 
189 aa  85.9  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0190213 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4403  metal dependent phophohydrolase  32.86 
 
 
213 aa  85.9  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.127842  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2830  metal dependent phosphohydrolase  36.99 
 
 
193 aa  79  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1236  metal dependent phophohydrolase  33.7 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  35.36 
 
 
771 aa  74.3  0.0000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3125  metal dependent phosphohydrolase  34.91 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0572222 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2252  metal dependent phosphohydrolase  26.74 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0289443  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0463  metal dependent phosphohydrolase  30.36 
 
 
187 aa  58.9  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1546  metal dependent phophohydrolase  30.77 
 
 
187 aa  58.2  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0373  metal dependent phophohydrolase  31.55 
 
 
187 aa  57.8  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.196484  normal  0.0301256 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>