More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1420 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 670 aa  1395    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  64.79 
 
 		 657 aa  880    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  62.03 
 
 		 642 aa  851    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 640 aa  663    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0315  methionyl-tRNA synthetase  57.97 
 
 		 648 aa  786    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  58.33 
 
 		 648 aa  788    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0154  methionyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 636 aa  672    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  65.19 
 
 		 663 aa  899    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 650 aa  573  1.0000000000000001e-162  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 654 aa  556  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 651 aa  539  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 647 aa  535  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 632 aa  538  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 628 aa  532  1e-150  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1814  methionyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 642 aa  526  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 		 650 aa  528  1e-148  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 629 aa  524  1e-147  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 645 aa  522  1e-147  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 653 aa  524  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 634 aa  524  1e-147  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 629 aa  524  1e-147  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 653 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 655 aa  517  1.0000000000000001e-145  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 648 aa  511  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 645 aa  511  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 650 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 648 aa  503  1e-141  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1350  methionyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 628 aa  498  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019937  normal  0.216507 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 647 aa  496  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 671 aa  494  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0724  methionyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 670 aa  494  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 645 aa  495  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 		 645 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 660 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 666 aa  491  1e-137  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 659 aa  489  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 660 aa  491  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 660 aa  487  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 660 aa  486  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 660 aa  487  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 638 aa  486  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 660 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0988  methionyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 624 aa  483  1e-135  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 660 aa  484  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 660 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 509 aa  483  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 660 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 660 aa  482  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 675 aa  481  1e-134  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1065  methionyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 644 aa  479  1e-134  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.241007  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 665 aa  478  1e-133  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0727  methionyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 638 aa  476  1e-133  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.163766  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 510 aa  474  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 		 642 aa  474  1e-132  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0485  methionyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 		 667 aa  472  1e-132  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 509 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 		 657 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 		 657 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 509 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 508 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0796  methionyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 632 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.000000000458098  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 509 aa  464  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 		 511 aa  465  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 		 656 aa  461  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 506 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1746  methionyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 		 675 aa  456  1e-127  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 681 aa  457  1e-127  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0300  methionyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 		 702 aa  457  1e-127  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0724  methionyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 		 629 aa  449  1e-125  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.27292  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 518 aa  445  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 634 aa  444  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0445  methionyl-tRNA synthetase  37.52 
 
 		 636 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1255  methionyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 		 651 aa  442  9.999999999999999e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 		 664 aa  436  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 		 654 aa  439  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 533 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0988  methionyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 		 628 aa  429  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 512 aa  432  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0175  methionyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 539 aa  431  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.7084 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0855  methionyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 		 628 aa  427  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.411642  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0925  methionyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 		 628 aa  425  1e-117  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3171  methionyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 530 aa  425  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0359  methionyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 493 aa  424  1e-117  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  41.84 
 
 		 574 aa  420  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 516 aa  419  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0176  methionyl-tRNA synthetase  44 
 
 		 528 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4100  methionyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 722 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.631035  normal  0.0384097 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 519 aa  412  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2723  methionyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 530 aa  405  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.148224 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3334  methionyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 531 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3650  methionyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 517 aa  403  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.826271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1806  methionyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 530 aa  405  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000579293 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1957  methionyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 538 aa  405  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1142  methionyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 525 aa  401  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.873399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3992  methionyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 535 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2008  methionyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 659 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0838931  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 511 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4034  methionyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 535 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.461216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3116  methionyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 514 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0588014  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4858  methionyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 533 aa  396  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000526962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>