More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1347 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  68.69 
 
 
497 aa  744    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  60.84 
 
 
503 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  60.16 
 
 
502 aa  641    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  60.57 
 
 
496 aa  639    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  60.84 
 
 
503 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  60.04 
 
 
505 aa  640    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  68.89 
 
 
497 aa  740    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  61.04 
 
 
500 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  60.84 
 
 
518 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  60.28 
 
 
510 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  60.24 
 
 
500 aa  641    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  60.24 
 
 
500 aa  641    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  60.44 
 
 
500 aa  642    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  60.77 
 
 
496 aa  644    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  60.44 
 
 
500 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  60.24 
 
 
500 aa  641    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1347  glycerol kinase  100 
 
 
498 aa  1026    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0455293  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  69.98 
 
 
497 aa  748    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0246  glycerol kinase  60 
 
 
501 aa  649    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  60.84 
 
 
518 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  60.84 
 
 
518 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  60.84 
 
 
518 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  60.84 
 
 
518 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  60.84 
 
 
500 aa  644    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  60.32 
 
 
516 aa  634  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  61.94 
 
 
505 aa  633  1e-180  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  59.76 
 
 
513 aa  633  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  60.56 
 
 
499 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  58.59 
 
 
498 aa  629  1e-179  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  60.16 
 
 
499 aa  629  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  60.36 
 
 
499 aa  628  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  59.72 
 
 
501 aa  619  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  60.69 
 
 
496 aa  619  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  58.79 
 
 
497 aa  620  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  60.29 
 
 
496 aa  619  1e-176  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  59.92 
 
 
494 aa  614  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  59.92 
 
 
496 aa  615  1e-175  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  58.4 
 
 
496 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  59.43 
 
 
496 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  58.69 
 
 
496 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  60.64 
 
 
501 aa  613  9.999999999999999e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  59.11 
 
 
520 aa  613  9.999999999999999e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  58.04 
 
 
495 aa  608  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  58.2 
 
 
496 aa  609  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  59.03 
 
 
498 aa  609  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  59.44 
 
 
500 aa  609  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  59.05 
 
 
500 aa  610  1e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  59.55 
 
 
495 aa  610  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  57.79 
 
 
496 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  59.47 
 
 
494 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  57.58 
 
 
496 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  57.79 
 
 
496 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  57.79 
 
 
496 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3399  glycerol kinase  59.15 
 
 
497 aa  604  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  56.88 
 
 
494 aa  607  9.999999999999999e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  57.58 
 
 
496 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  57.58 
 
 
496 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  57.79 
 
 
496 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  59.06 
 
 
494 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  58.92 
 
 
507 aa  606  9.999999999999999e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3466  glycerol kinase  57.87 
 
 
498 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0225971  normal  0.260214 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  58.66 
 
 
494 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  59.06 
 
 
494 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  58.66 
 
 
494 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  59.06 
 
 
494 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  58.66 
 
 
494 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  58.32 
 
 
505 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  57.81 
 
 
489 aa  601  1e-170  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  58.66 
 
 
494 aa  600  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  56.82 
 
 
495 aa  600  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  58.45 
 
 
494 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0385  glycerol kinase  59.39 
 
 
504 aa  593  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  57.8 
 
 
503 aa  591  1e-168  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  58.01 
 
 
498 aa  592  1e-168  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  57.23 
 
 
493 aa  593  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  56.54 
 
 
507 aa  589  1e-167  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0876  glycerol kinase  59.15 
 
 
497 aa  589  1e-167  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1245  glycerol kinase  56.71 
 
 
494 aa  590  1e-167  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0682  glycerol kinase  58.22 
 
 
505 aa  589  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4187  glycerol kinase  58.08 
 
 
496 aa  590  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  57.58 
 
 
507 aa  588  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0476  glycerol kinase  57.23 
 
 
497 aa  588  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  57.58 
 
 
507 aa  588  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  58.98 
 
 
496 aa  588  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  58.37 
 
 
496 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  57.58 
 
 
507 aa  588  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0328  glycerol kinase  58.04 
 
 
497 aa  590  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426539  hitchhiker  0.00844444 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3168  glycerol kinase  57.46 
 
 
507 aa  585  1e-166  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119094  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  56.77 
 
 
502 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  56.77 
 
 
502 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  56.57 
 
 
502 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  56.77 
 
 
502 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  56.77 
 
 
502 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  57.55 
 
 
500 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  56.77 
 
 
502 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  57 
 
 
503 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  56.57 
 
 
502 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  56.77 
 
 
502 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  56.77 
 
 
502 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1242  glycerol kinase  56.97 
 
 
497 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0753074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>