More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1345 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  100 
 
 		 467 aa  951    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  39.51 
 
 		 469 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.86 
 
 		 476 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  41.97 
 
 		 481 aa  289  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.72 
 
 		 476 aa  286  8e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  39.5 
 
 		 482 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  40.69 
 
 		 477 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  40.68 
 
 		 476 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  40.68 
 
 		 476 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  35.56 
 
 		 460 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  41.92 
 
 		 484 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  41.92 
 
 		 484 aa  257  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  41.92 
 
 		 492 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  38.12 
 
 		 461 aa  253  6e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  37.56 
 
 		 481 aa  236  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  34.95 
 
 		 451 aa  233  5e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  35.06 
 
 		 451 aa  227  3e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  35.68 
 
 		 485 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.74 
 
 		 464 aa  223  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.01 
 
 		 464 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.01 
 
 		 464 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.01 
 
 		 464 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  37.71 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.77 
 
 		 464 aa  216  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.01 
 
 		 464 aa  216  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  36.7 
 
 		 486 aa  217  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.01 
 
 		 464 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.77 
 
 		 464 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.01 
 
 		 464 aa  216  7e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.77 
 
 		 464 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  31.71 
 
 		 464 aa  207  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  33.18 
 
 		 483 aa  206  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  35.04 
 
 		 455 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  41.41 
 
 		 498 aa  203  7e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  35.39 
 
 		 409 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  33.33 
 
 		 554 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  33.33 
 
 		 495 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  39.03 
 
 		 377 aa  195  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  29.76 
 
 		 492 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  41.38 
 
 		 473 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.58 
 
 		 471 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  32.12 
 
 		 452 aa  190  4e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  29.51 
 
 		 492 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14050  isochorismate synthase family protein  32.41 
 
 		 418 aa  189  7e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  34.4 
 
 		 428 aa  189  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2188  isochorismate synthase  44.14 
 
 		 467 aa  188  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.976142  normal  0.55094 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  42.31 
 
 		 415 aa  188  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  32.03 
 
 		 456 aa  187  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  41.96 
 
 		 451 aa  187  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  30.13 
 
 		 471 aa  187  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2977  isochorismate synthase  31.28 
 
 		 490 aa  186  7e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  39.92 
 
 		 465 aa  182  9.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  31.36 
 
 		 453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  31.36 
 
 		 453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0774  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.84 
 
 		 379 aa  180  4e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  32.42 
 
 		 506 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  33.58 
 
 		 407 aa  179  7e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1234  isochorismate synthase  30.56 
 
 		 465 aa  179  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  33.8 
 
 		 466 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2823  isochorismate synthase  33.75 
 
 		 444 aa  179  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  40.38 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  34.55 
 
 		 412 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  33.33 
 
 		 452 aa  177  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  35.36 
 
 		 449 aa  176  7e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  34.69 
 
 		 384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  40 
 
 		 484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2276  isochorismate synthase  41.94 
 
 		 397 aa  172  9e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  36.06 
 
 		 402 aa  171  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  32.87 
 
 		 482 aa  170  5e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  35.86 
 
 		 473 aa  170  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  31.93 
 
 		 452 aa  169  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  35.69 
 
 		 395 aa  169  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  33.99 
 
 		 469 aa  169  7e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  38.17 
 
 		 403 aa  169  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0469  isochorismate synthase  31.76 
 
 		 386 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000527427  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  40.86 
 
 		 424 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3913  isochorismate synthases  32.2 
 
 		 460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348383  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2088  isochorismate synthases  30.62 
 
 		 477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000640643  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  41.37 
 
 		 394 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  30.17 
 
 		 452 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  30.17 
 
 		 452 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  35.27 
 
 		 391 aa  166  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  35.16 
 
 		 401 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  30.17 
 
 		 452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  29.61 
 
 		 452 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  37.93 
 
 		 391 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  36.06 
 
 		 398 aa  163  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  35.21 
 
 		 395 aa  163  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  37.59 
 
 		 391 aa  163  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3133  isochorismate synthases  32.05 
 
 		 462 aa  163  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  36.07 
 
 		 398 aa  162  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  36.33 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  37.22 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0634  isochorismate synthase EntC  37.55 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  37.22 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  37.22 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  37.22 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0707  isochorismate synthase EntC  37.55 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0648  isochorismate synthase EntC  37.55 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  37.22 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>