More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1317 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1317  ABC transporter related  100 
 
 		 270 aa  542  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2312  ABC transporter related  44.58 
 
 		 234 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  hitchhiker  0.0000468431 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1841  ABC transporter, ATP-binding protein  41.27 
 
 		 238 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.551478  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00860  putative ATP-binding component of ABC transporter  40.69 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000878092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0144  ABC transporter ATP-binding protein  39.83 
 
 		 239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.47583  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52030  ATP binding component of ABC transporter  38.5 
 
 		 238 aa  139  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4235  ABC transporter related  36.4 
 
 		 228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0466  ABC transporter related protein  37.21 
 
 		 222 aa  132  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2628  ABC transporter  38.36 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1669  ABC transporter related  41.09 
 
 		 251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2875  ABC transporter, ATP-binding protein  38.03 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0026509  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3150  ABC transporter component  41.71 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2391  ABC transporter related  37.62 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  37.86 
 
 		 248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  37.76 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  32.61 
 
 		 238 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  33.5 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3220  ABC transporter related  41.71 
 
 		 213 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  33.9 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2781  ABC transporter related  31.67 
 
 		 252 aa  112  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2724  ABC transporter related  31.67 
 
 		 252 aa  112  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  37.67 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0367  ABC transporter related  38.27 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2306  ABC transporter related  33.33 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000206589  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2113  ABC transporter related  35.35 
 
 		 240 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000000136112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0021  ABC transporter, ATP-binding protein  30.73 
 
 		 252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5638  ABC transporter related  33.64 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6003  ABC transporter related  33.64 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  34.67 
 
 		 228 aa  109  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  34.23 
 
 		 256 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0526  ABC transporter related  36.16 
 
 		 237 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  34.43 
 
 		 715 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  36.23 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  33.99 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6494  ABC transporter related  33.18 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.87798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  37.76 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  35.82 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7412  ABC efflux pump, ATPase subunit  33.64 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  35.84 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  32.54 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2150  ABC transporter related  37.93 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  33.82 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  37.81 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  32.49 
 
 		 234 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  34.48 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6149  ABC transporter related  33.64 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.563946  normal  0.463374 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  34.48 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2886  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  39.15 
 
 		 365 aa  106  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.224709  normal  0.0364702 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  33.04 
 
 		 235 aa  106  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 228 aa  106  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  33.82 
 
 		 228 aa  106  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  35.82 
 
 		 656 aa  106  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  32.75 
 
 		 653 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1417  ABC transporter related  35.59 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.275967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  35.44 
 
 		 239 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  34.85 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  34.68 
 
 		 654 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  34.48 
 
 		 226 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  35.65 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  33.94 
 
 		 239 aa  105  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  37.37 
 
 		 244 aa  105  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3421  ABC transporter related  35.53 
 
 		 223 aa  105  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0493  ABC transporter related  32.57 
 
 		 259 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0805  ABC transporter related  35.16 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  34.48 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1518  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  38.12 
 
 		 376 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  37.39 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  34.48 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  34.48 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  34.48 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0299  ABC transporter related  33.33 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  34.48 
 
 		 226 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  33 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  34.48 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0292  ABC transporter related  33.33 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  34.48 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  32.16 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  35.96 
 
 		 235 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  35.53 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  35.53 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  34.39 
 
 		 232 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  34.83 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  33.33 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1370  ABC transporter related  34.38 
 
 		 232 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000531133  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4106  ABC transporter related  33.93 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  35.4 
 
 		 244 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  31.56 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  36.5 
 
 		 254 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  34.01 
 
 		 225 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  36.18 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  37.44 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.32 
 
 		 656 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  36.65 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  35.4 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  32.38 
 
 		 643 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  35.38 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  39.7 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  36.27 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  36.65 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>