258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1260 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  100 
 
 		 284 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  40.52 
 
 		 265 aa  175  9e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  38.86 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  38.26 
 
 		 263 aa  152  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  36.49 
 
 		 226 aa  132  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  33.67 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  32.5 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  34.65 
 
 		 224 aa  102  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  34.65 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  34.76 
 
 		 234 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  35.24 
 
 		 235 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  36.02 
 
 		 221 aa  99.8  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  35.53 
 
 		 228 aa  99.4  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  37.02 
 
 		 232 aa  98.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  37.02 
 
 		 232 aa  98.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  37.02 
 
 		 232 aa  98.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  37.02 
 
 		 232 aa  98.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  37.02 
 
 		 232 aa  98.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0041  flagellar basal body rod modification protein  30.7 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0080  flagellar basal body rod modification protein  30.7 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  33.65 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  31.1 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  34.6 
 
 		 245 aa  97.1  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  34.98 
 
 		 228 aa  96.3  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  34.98 
 
 		 228 aa  95.9  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  32.84 
 
 		 225 aa  95.5  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  34.97 
 
 		 233 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  34.48 
 
 		 225 aa  95.1  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  35.07 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  29.69 
 
 		 220 aa  92.4  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  33.49 
 
 		 225 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  30.37 
 
 		 221 aa  92  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  35.1 
 
 		 229 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  30.35 
 
 		 222 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  31.1 
 
 		 225 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  34.31 
 
 		 231 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  27.39 
 
 		 221 aa  90.5  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  30.62 
 
 		 225 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  27.39 
 
 		 221 aa  90.5  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  34.31 
 
 		 231 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  35.1 
 
 		 229 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0057  flagellar basal body rod modification protein  29.49 
 
 		 287 aa  89.7  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  33.82 
 
 		 231 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  33.82 
 
 		 231 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  33.82 
 
 		 231 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  33.82 
 
 		 231 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0030  flagellar hook capping protein  30.2 
 
 		 221 aa  89.4  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  35.71 
 
 		 233 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  33.82 
 
 		 231 aa  89.4  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16820  flagellar hook capping protein  40.91 
 
 		 142 aa  88.6  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.274854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2053  flagellar basal body rod modification protein  33.66 
 
 		 231 aa  89  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.251185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5061  flagellar hook capping protein  31.5 
 
 		 228 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.433683  normal  0.0695109 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  33.82 
 
 		 231 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  33.14 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0764  flagellar hook capping protein  33.15 
 
 		 220 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.282848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  32.6 
 
 		 215 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  32.6 
 
 		 215 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  29.26 
 
 		 227 aa  86.3  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  35 
 
 		 237 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  35 
 
 		 227 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  29.47 
 
 		 218 aa  85.5  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  31.22 
 
 		 226 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  31.22 
 
 		 226 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  32.11 
 
 		 218 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  29.49 
 
 		 221 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  29.47 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1329  flagellar hook capping protein  36.07 
 
 		 134 aa  84.7  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4575  flagellar hook capping protein  29.35 
 
 		 223 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  31.07 
 
 		 225 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  30.77 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  30.69 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1589  flagellar basal body rod modification protein  35.12 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  34.64 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  30.54 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  28.5 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  31.32 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  32.22 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2402  flagellar hook capping protein  38.79 
 
 		 185 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2044  flagellar hook capping protein  63.16 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1122  flagellar basal body rod modification protein  31.29 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.957551  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  30.04 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2048  flagellar basal body rod modification protein  31.29 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.854141  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  34 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0290  flagellar basal body rod modification protein  63.64 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1118  flagellar basal body rod modification protein  49.3 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0258  flagellar hook capping protein  31.06 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0256  flagellar hook capping protein  31.06 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5120  flagellar hook capping protein  30.2 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  32.07 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1686  flagellar hook capping protein  49.45 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2010  flagellar basal body rod modification protein  50.7 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  31.03 
 
 		 221 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2166  flagellar hook capping protein  52.7 
 
 		 164 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  30.24 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  29.69 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0472  flagellar hook capping protein  68.75 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3297  flagellar hook capping protein  28.08 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2533  flagellar hook capping protein  28.9 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.816579  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  33.89 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3581  flagellar hook capping protein  27.22 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105254  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>