More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1244 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1244  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 347 aa  708    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.75152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0516  ApbE family lipoprotein  41.69 
 
 		 336 aa  242  7e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  40.71 
 
 		 342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  41.14 
 
 		 337 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  33.91 
 
 		 352 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.71 
 
 		 357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0536  ApbE family lipoprotein  33.62 
 
 		 345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  34.87 
 
 		 344 aa  172  5e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  35.16 
 
 		 344 aa  172  9e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  31.79 
 
 		 336 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4867  ApbE family lipoprotein  35.14 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.1173 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.07 
 
 		 363 aa  132  7.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  28.57 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  30.34 
 
 		 350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  33.55 
 
 		 349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1534  ApbE family lipoprotein  33.22 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1333  ApbE family lipoprotein  33.57 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.254528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  31.37 
 
 		 317 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3618  ApbE family lipoprotein  32.75 
 
 		 320 aa  122  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128321  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2856  ApbE family lipoprotein  31.31 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.56 
 
 		 349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  34.13 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  28.1 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  26.69 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6013  nitrous oxide reductase accessory protein NosX (required for nitrous oxide reduction), ApbE-like lipoprotein  33.04 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.279768  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0280  nosX protein  31.89 
 
 		 330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  32.71 
 
 		 355 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  27.65 
 
 		 381 aa  119  9e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2415  ApbE family lipoprotein  32.51 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.410887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3147  twin-arginine translocation pathway signal  30.36 
 
 		 344 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  25.82 
 
 		 345 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  26.32 
 
 		 335 aa  115  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  31.8 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  30.2 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  29.88 
 
 		 346 aa  114  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  32.97 
 
 		 345 aa  113  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3962  ApbE family lipoprotein  34.31 
 
 		 327 aa  113  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.376919  normal  0.0354055 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  26.42 
 
 		 360 aa  112  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  27.49 
 
 		 359 aa  112  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0309  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.17 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.912952 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  32.27 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.77 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  31.91 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  27.49 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.49 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  31.87 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0433  twin-arginine translocation pathway signal  30.1 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.74 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  32.02 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2356  ApbE family lipoprotein  29.71 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  29.05 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  26.14 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  27.21 
 
 		 316 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  24.57 
 
 		 343 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  32.33 
 
 		 350 aa  109  9.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  32.42 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  29.18 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  25.16 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  27.45 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  26.71 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  30.65 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  27.54 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  27.57 
 
 		 353 aa  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  29.33 
 
 		 338 aa  106  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  31.75 
 
 		 338 aa  106  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.74 
 
 		 337 aa  106  7e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  30.83 
 
 		 362 aa  106  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  29.64 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  31.02 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  31.02 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  31.06 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  33.02 
 
 		 370 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  31.02 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  31.02 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  29.46 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  27.99 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  32.05 
 
 		 344 aa  104  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  24.83 
 
 		 350 aa  102  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.97 
 
 		 367 aa  102  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2606  ApbE family lipoprotein  30.84 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  31.51 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.31 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.83 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.14 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  31.07 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  31.51 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1563  carboxynorspermidine decarboxylase  37.72 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  31.51 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  29.8 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  26.45 
 
 		 380 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.14 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.41 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.52 
 
 		 361 aa  100  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  32.03 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  27.15 
 
 		 369 aa  99.8  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.84 
 
 		 351 aa  99.4  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2609  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.8 
 
 		 350 aa  99.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425275 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2506  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.8 
 
 		 350 aa  99.4  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410483 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2280  ApbE family lipoprotein  26.4 
 
 		 372 aa  99.4  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.506741 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  32.11 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>