More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1241 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1241  electron transport complex RsxE subunit  100 
 
 
225 aa  450  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0519  electron transport complex RsxE subunit  74.77 
 
 
223 aa  327  6e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1957  electron transport complex RsxE subunit  68.22 
 
 
239 aa  314  5e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.875572  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0584  electron transport complex RsxE subunit  68.61 
 
 
224 aa  305  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2827  electron transport complex RsxE subunit  63.92 
 
 
200 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2433  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  53.54 
 
 
218 aa  221  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109684  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1319  electron transport complex RsxE subunit  50 
 
 
222 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.175799  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0260  electron transport complex RsxE subunit  57.65 
 
 
202 aa  216  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0677  electron transport complex RsxE subunit  54.9 
 
 
200 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0531  RnfA-Nqr electron transport subunit  53.92 
 
 
203 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0701  electron transport complex RsxE subunit  54.9 
 
 
200 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.647588  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0214  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  50.67 
 
 
253 aa  210  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000178696  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0082  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  52.76 
 
 
216 aa  201  9e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0420224  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0345  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  48.72 
 
 
239 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0696  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  46.46 
 
 
235 aa  198  5e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.682533  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0390  electron transport complex RsxE subunit  55.11 
 
 
217 aa  198  6e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0613  electron transport complex RsxE subunit  56.84 
 
 
206 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14320  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  53.19 
 
 
199 aa  196  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000437194  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1574  electron transport complex RsxE subunit  55.05 
 
 
204 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0333623  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0307  electron transport complex RsxE subunit  52.94 
 
 
196 aa  189  2.9999999999999997e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1158  electron transport complex RsxE subunit  52.41 
 
 
200 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.252127 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1084  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  49.75 
 
 
205 aa  188  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0652551 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0497  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  50 
 
 
206 aa  188  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000269706  hitchhiker  0.000180019 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1031  electron transport complex RsxE subunit  47.17 
 
 
243 aa  186  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000559383  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2358  electron transport complex RsxE subunit  48.39 
 
 
231 aa  186  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.949569  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1313  electron transport complex RsxE subunit  50.78 
 
 
200 aa  184  9e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.860019  normal  0.240269 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1532  electron transport complex RsxE subunit  52.41 
 
 
201 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0221423  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1064  electron transport complex RsxE subunit  48.77 
 
 
218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0737938  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1381  electron transport complex RsxE subunit  47.03 
 
 
203 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000108717  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2264  electron transport complex RsxE subunit  47.62 
 
 
232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000442718  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4550  electron transport complex RsxE subunit  47.62 
 
 
232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2107  electron transport complex RsxE subunit  47.62 
 
 
232 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.257161  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2060  electron transport complex RsxE subunit  47.62 
 
 
232 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000214893  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2278  electron transport complex RsxE subunit  47.62 
 
 
232 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316323  normal  0.959617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2069  electron transport complex RsxE subunit  49.49 
 
 
232 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00102029  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1906  electron transport complex RsxE subunit  49.49 
 
 
232 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2177  electron transport complex RsxE subunit  50 
 
 
231 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.206237  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2173  electron transport complex RsxE subunit  49.49 
 
 
232 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.303807  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1868  electron transport complex RsxE subunit  47.96 
 
 
231 aa  180  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2513  electron transport complex RsxE subunit  49.49 
 
 
232 aa  179  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1845  electron transport complex RsxE subunit  48.48 
 
 
232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000056167  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0985  electron transport complex RsxE subunit  52.33 
 
 
201 aa  179  4e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2020  electron transport complex RsxE subunit  45.29 
 
 
235 aa  178  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0685  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  50.54 
 
 
222 aa  178  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.360116  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2071  electron transport complex RsxE subunit  47.14 
 
 
232 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2970  electron transport complex RsxE subunit  45.96 
 
 
232 aa  176  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0533  electron transport complex RsxE subunit  49.02 
 
 
230 aa  176  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000076694  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0548  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  48.76 
 
 
219 aa  175  5e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  7.614250000000001e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0733  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  48.24 
 
 
230 aa  175  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22975  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0933  electron transport complex RsxE subunit  45.75 
 
 
238 aa  175  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002944  electron transport complex protein RnfE  45.97 
 
 
230 aa  174  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0179212  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2320  electron transport complex RsxE subunit  49.48 
 
 
235 aa  174  7e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0062  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  45.85 
 
 
219 aa  174  9e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2561  electron transport complex RsxE subunit  45.28 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.428281  normal  0.0236645 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1835  electron transport complex RsxE subunit  46.38 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.521191  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1867  electron transport complex RsxE subunit  46.48 
 
 
228 aa  172  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1540  electron transport complex RsxE subunit  42.86 
 
 
255 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19220  electron transport complex RsxE subunit  44.34 
 
 
237 aa  169  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1921  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  48 
 
 
231 aa  168  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2159  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  44.13 
 
 
230 aa  168  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02969  electron transport complex RsxE subunit  44.08 
 
 
230 aa  168  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1900  electron transport complex RsxE subunit  44.55 
 
 
233 aa  168  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000164726  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2012  electron transport complex RsxE subunit  44.55 
 
 
233 aa  168  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00017811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2248  electron transport complex RsxE subunit  44.55 
 
 
233 aa  168  8e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000887941  normal  0.482499 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0835  electron transport complex RsxE subunit  42.65 
 
 
219 aa  167  9e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0472415  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2039  electron transport complex RsxE subunit  44.04 
 
 
236 aa  167  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02734  NADH-ubiquinone oxidoreductase  46.38 
 
 
230 aa  167  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2194  electron transport complex RsxE subunit  43.4 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1399  electron transport complex RsxE subunit  46.15 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1324  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  45.65 
 
 
215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0288  electron transport complex RsxE subunit  43.14 
 
 
231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18890  electron transport complex RsxE subunit  45.09 
 
 
238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0559311  normal  0.0454317 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2819  electron transport complex RsxE subunit  43.2 
 
 
228 aa  161  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2235  electron transport complex RsxE subunit  44.55 
 
 
232 aa  160  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000336445 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3197  electron transport complex RsxE subunit  44.28 
 
 
244 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.0099576  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3197  electron transport complex RsxE subunit  42.79 
 
 
244 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.113387  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3936  electron transport complex RsxE subunit  44.28 
 
 
244 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.000255424  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2898  electron transport complex RsxE subunit  43.48 
 
 
233 aa  159  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.594329  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3237  electron transport complex RsxE subunit  39.15 
 
 
239 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.205198  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2631  electron transport complex RsxE subunit  41.94 
 
 
228 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.854749  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1170  electron transport complex RsxE subunit  47.29 
 
 
236 aa  156  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50930  Electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  44.71 
 
 
238 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000773379  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1094  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  42.71 
 
 
199 aa  155  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.221672  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2405  electron transport complex RsxE subunit  40.83 
 
 
236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.561649  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1567  electron transport complex RsxE subunit  43.48 
 
 
231 aa  152  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.276457  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1795  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  41.71 
 
 
230 aa  152  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.680327  hitchhiker  0.000244527 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1841  electron transport complex RsxE subunit  43.48 
 
 
231 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000217086  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2344  electron transport complex RsxE subunit  43.48 
 
 
231 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00490465  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1821  electron transport complex RsxE subunit  43.48 
 
 
231 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8848  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01602  NADH-ubiquinone oxidoreductase  47.26 
 
 
231 aa  151  8e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00455055  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2009  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  47.26 
 
 
231 aa  151  8e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206921  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1997  electron transport complex RsxE subunit  47.26 
 
 
231 aa  151  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0507177  normal  0.141925 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01592  hypothetical protein  47.26 
 
 
231 aa  151  8e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00529631  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1708  electron transport complex RsxE subunit  47.26 
 
 
231 aa  151  8e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0245386  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2020  electron transport complex RsxE subunit  40.38 
 
 
225 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.644587  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2994  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  45.31 
 
 
226 aa  150  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1564  electron transport complex RsxE subunit  43.04 
 
 
230 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.257712  normal  0.0772811 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1720  electron transport complex RsxE subunit  43.91 
 
 
230 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208116  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1552  electron transport complex RsxE subunit  43.91 
 
 
230 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1624  electron transport complex RsxE subunit  43.91 
 
 
230 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  normal  0.350823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>