15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1219 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1219  hypothetical protein  100 
 
 
773 aa  1587    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000629207  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3776  hypothetical protein  37.83 
 
 
745 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.94629  normal  0.316653 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2382  hypothetical protein  32.77 
 
 
767 aa  309  1.0000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.507042  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0485  hypothetical protein  30.75 
 
 
743 aa  249  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212025  normal  0.046146 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3532  hypothetical protein  32.61 
 
 
793 aa  228  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2031  AAA ATPase  32.19 
 
 
1150 aa  204  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000206232  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6503  TIR protein  33.93 
 
 
641 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.985723 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6594  hypothetical protein  24.37 
 
 
754 aa  91.3  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0217  hypothetical protein  23.51 
 
 
738 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3802  hypothetical protein  21.99 
 
 
772 aa  65.1  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0133094  hitchhiker  0.00280043 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2993  hypothetical protein  23.42 
 
 
244 aa  61.6  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4976  hypothetical protein  22.13 
 
 
812 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222165  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0135  hypothetical protein  27.85 
 
 
337 aa  49.3  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.385897  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0118  hypothetical protein  27.56 
 
 
337 aa  48.5  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0194  hypothetical protein  26.67 
 
 
1277 aa  45.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>