More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1158 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  100 
 
 		 169 aa  348  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  53.25 
 
 		 169 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  47.93 
 
 		 171 aa  177  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  47.93 
 
 		 171 aa  177  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  47.34 
 
 		 169 aa  174  4e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  52.66 
 
 		 169 aa  174  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  47.85 
 
 		 166 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  47.34 
 
 		 169 aa  170  6.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  47.24 
 
 		 166 aa  168  4e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  46.71 
 
 		 176 aa  167  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  44.97 
 
 		 169 aa  166  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  46.75 
 
 		 174 aa  165  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  46.75 
 
 		 174 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  43.98 
 
 		 169 aa  159  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  44.1 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  42.77 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  43.98 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  43.98 
 
 		 173 aa  150  8e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  41.42 
 
 		 169 aa  150  8.999999999999999e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  41.42 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  42.77 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  45.29 
 
 		 170 aa  142  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  38.46 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  39.41 
 
 		 201 aa  128  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  36.88 
 
 		 166 aa  127  8.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  36.9 
 
 		 187 aa  123  9e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  46.75 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  37.65 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  34.15 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  33.95 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  37.2 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  36.42 
 
 		 274 aa  106  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  34.18 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  38.33 
 
 		 194 aa  99.8  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  37.08 
 
 		 194 aa  99.4  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  37.11 
 
 		 167 aa  99  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  35.29 
 
 		 186 aa  98.6  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  32.73 
 
 		 169 aa  98.6  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  34.73 
 
 		 186 aa  96.7  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  35.93 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  35.76 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  32.97 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  35.9 
 
 		 176 aa  93.6  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  36.71 
 
 		 178 aa  92.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  32.32 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  37.74 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  34.62 
 
 		 176 aa  93.2  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  35.03 
 
 		 178 aa  92  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  33.52 
 
 		 172 aa  91.3  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  35.54 
 
 		 188 aa  91.3  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  30.68 
 
 		 173 aa  89.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  30.41 
 
 		 180 aa  89  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  31.43 
 
 		 202 aa  89  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  31.25 
 
 		 172 aa  88.6  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  32.87 
 
 		 176 aa  87.8  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  34.01 
 
 		 170 aa  87.8  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  33.57 
 
 		 173 aa  87.4  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  30.06 
 
 		 176 aa  86.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  27.43 
 
 		 176 aa  85.5  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  32.72 
 
 		 168 aa  85.5  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  31.13 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  34.04 
 
 		 176 aa  85.5  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  33.14 
 
 		 174 aa  85.5  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  30.77 
 
 		 175 aa  84.3  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  33.53 
 
 		 189 aa  84.3  8e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  34.1 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  32.94 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  29.05 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  35.81 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  32.97 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  36.17 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  31.76 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  29.71 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  31.91 
 
 		 171 aa  80.5  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  32.16 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  31.58 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  32.28 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  30.87 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  30.97 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  27.33 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  30.51 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  29.31 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  28.57 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  29.07 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  29.3 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  28 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  29.07 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  33.33 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  32.93 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  30.73 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  27.33 
 
 		 196 aa  74.3  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  34.33 
 
 		 189 aa  74.3  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  29.76 
 
 		 191 aa  73.9  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  32.67 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  30.3 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  35.29 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  30.16 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  29.38 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  27.49 
 
 		 185 aa  72  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  31.75 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>