72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1120 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1120  amino acid-binding ACT domain protein  100 
 
 
143 aa  291  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.298875  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0447  amino acid-binding ACT domain protein  75 
 
 
143 aa  218  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.266025 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1522  amino acid-binding ACT domain-containing protein  69.72 
 
 
170 aa  209  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0251264 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2088  ACT domain-containing protein  70 
 
 
143 aa  209  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1138  amino acid-binding ACT domain protein  68.31 
 
 
143 aa  207  4e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000787959  normal  0.731263 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0796  amino acid-binding ACT domain protein  66.43 
 
 
143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1682  amino acid-binding ACT domain-containing protein  64.08 
 
 
143 aa  189  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1859  amino acid-binding ACT domain protein  64.29 
 
 
143 aa  189  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00254903  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2191  amino acid-binding ACT domain protein  61.97 
 
 
143 aa  188  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1824  ACT domain-containing protein  61.97 
 
 
143 aa  187  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2036  amino acid-binding ACT domain protein  61.97 
 
 
143 aa  186  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000214069 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1736  ACT domain-containing protein  62.68 
 
 
143 aa  186  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567956  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1670  amino acid-binding ACT domain-containing protein  62.86 
 
 
143 aa  184  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2132  amino acid-binding ACT domain-containing protein  61.27 
 
 
143 aa  181  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0184772  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2322  amino acid-binding ACT domain-containing protein  61.48 
 
 
143 aa  175  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2883  amino acid-binding ACT domain-containing protein  53.57 
 
 
143 aa  168  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3510  amino acid-binding ACT domain protein  54.81 
 
 
143 aa  160  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0260882  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0514  ACT domain-containing protein  54.29 
 
 
143 aa  160  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1575  amino acid-binding ACT domain-containing protein  54.48 
 
 
143 aa  152  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.114486  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1503  amino acid-binding ACT domain protein  50.7 
 
 
143 aa  149  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1570  ACT domain-containing protein  55.56 
 
 
143 aa  149  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0832  amino acid-binding ACT domain-containing protein  48.55 
 
 
147 aa  142  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219299  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0816  amino acid-binding ACT  47.1 
 
 
142 aa  140  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.842739  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0616  ACT domain-containing protein  51.56 
 
 
143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0167  amino acid-binding ACT domain protein  50.75 
 
 
143 aa  137  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0670  amino acid-binding ACT domain protein  48.25 
 
 
143 aa  135  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0261  amino acid-binding ACT domain-containing protein  43.51 
 
 
144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0037  ACT domain-containing protein  47.92 
 
 
147 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1971  amino acid-binding ACT domain-containing protein  50.37 
 
 
142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0053  amino acid-binding ACT domain protein  47.92 
 
 
147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0041  amino acid-binding ACT domain protein  47.92 
 
 
147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0040  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.44 
 
 
147 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3086  amino acid-binding ACT domain-containing protein  45.45 
 
 
135 aa  126  9.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0071  amino acid-binding ACT domain-containing protein  48.25 
 
 
145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0074  amino acid-binding ACT domain protein  47.83 
 
 
142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0065  hypothetical protein  46.38 
 
 
142 aa  118  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0069  amino acid-binding ACT domain protein  45.19 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2859  amino acid-binding ACT domain protein  44.29 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0860  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.43 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0495792  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0210  acetolactate synthase small subunit  38.69 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.846842 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0168  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.43 
 
 
141 aa  114  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1743  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40.71 
 
 
141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.237603 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1421  hypothetical protein  44.29 
 
 
151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3082  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.22 
 
 
143 aa  114  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.61 
 
 
141 aa  114  6e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0708  amino acid-binding ACT domain-containing protein  43.18 
 
 
144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.464159  normal  0.126423 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4321  ACT domain-containing protein  41.38 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0208  amino acid-binding (ACT) protein  40.91 
 
 
145 aa  108  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2122  amino acid-binding ACT domain protein  42.11 
 
 
144 aa  107  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1623  amino acid-binding ACT  40.46 
 
 
144 aa  104  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1579  amino acid-binding ACT domain protein  42.75 
 
 
142 aa  102  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.210637 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0748  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.15 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00491505  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13420  ACT domain-containing protein  46.34 
 
 
142 aa  94.4  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0901  ACT domain-containing protein  37.9 
 
 
129 aa  94.4  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_885  ACT domain protein  36.72 
 
 
129 aa  94  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1014  ACT domain-containing protein  35.94 
 
 
129 aa  92.8  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06230  ACT domain-containing protein  33.06 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.58032  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1455  hypothetical protein  34.04 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.323054 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1584  amino acid-binding ACT domain protein  38.46 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0505283 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0720  putative acetolactate synthase small regulatory subunit  31.3 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.726001 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1319  ACT domain-containing protein  38.79 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0909  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.15 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.394001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2427  amino acid-binding ACT domain protein  35 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.662665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2514  amino acid-binding ACT domain protein  34 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1433  ACT domain-containing protein  34 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.50436  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2396  amino acid-binding ACT domain-containing protein  36 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3113  amino acid-binding ACT domain protein  33.04 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1309  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.7 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2624  acetolactate synthase, small subunit  44 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0326  hypothetical protein  27 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0873  amino acid-binding ACT  23.48 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01980  acetolactate synthase, small subunit  37.29 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000298092  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>