More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1095 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1095  argininosuccinate synthase  100 
 
 
401 aa  831    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.142038  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0047  argininosuccinate synthase  69.95 
 
 
401 aa  579  1e-164  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1900  argininosuccinate synthase  69.31 
 
 
396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2531  argininosuccinate synthase  67.86 
 
 
400 aa  551  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00599814  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  63.93 
 
 
403 aa  532  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  64.41 
 
 
407 aa  531  1e-149  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2361  argininosuccinate synthase  61.52 
 
 
397 aa  492  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0152126  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0914  argininosuccinate synthase  59.3 
 
 
402 aa  490  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000289862  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2698  argininosuccinate synthase  59.75 
 
 
397 aa  483  1e-135  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.823792  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1382  argininosuccinate synthase  59.16 
 
 
416 aa  484  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.924271 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1533  argininosuccinate synthase  57.89 
 
 
410 aa  478  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.535542  normal  0.279557 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3472  argininosuccinate synthase  59.85 
 
 
406 aa  480  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0061  argininosuccinate synthase  59.55 
 
 
401 aa  477  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2650  argininosuccinate synthase  58.23 
 
 
408 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2873  argininosuccinate synthase  58.23 
 
 
408 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1212  argininosuccinate synthase  58.23 
 
 
408 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1273  argininosuccinate synthase  58.27 
 
 
426 aa  473  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0227151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2970  argininosuccinate synthase  59.03 
 
 
405 aa  471  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1753  argininosuccinate synthase  57.64 
 
 
410 aa  472  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.233709  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0499  argininosuccinate synthase  59.06 
 
 
408 aa  474  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1708  argininosuccinate synthase  55.56 
 
 
406 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0472214  hitchhiker  0.00281031 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2293  argininosuccinate synthase  58.08 
 
 
413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2491  argininosuccinate synthase  58.66 
 
 
399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2568  argininosuccinate synthase  57.83 
 
 
413 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0384503 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  58.08 
 
 
403 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2250  argininosuccinate synthase  57.32 
 
 
413 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137068  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2417  argininosuccinate synthase  58.04 
 
 
406 aa  465  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.20961  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2013  argininosuccinate synthase  56.76 
 
 
409 aa  467  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0978065  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7386  argininosuccinate synthase  58.12 
 
 
413 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2067  argininosuccinate synthase  57.72 
 
 
414 aa  467  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0495  argininosuccinate synthase  59.19 
 
 
405 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.337809  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0609  argininosuccinate synthase  58.12 
 
 
412 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1659  argininosuccinate synthase  57.29 
 
 
411 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409616  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1394  argininosuccinate synthase  56.19 
 
 
405 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.664295 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3031  argininosuccinate synthase  57.25 
 
 
468 aa  462  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526147  normal  0.562744 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2231  argininosuccinate synthase  57.04 
 
 
404 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1377  argininosuccinate synthase  59.33 
 
 
410 aa  464  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2537  argininosuccinate synthase  56.96 
 
 
403 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.994167  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0725  argininosuccinate synthase  58.4 
 
 
403 aa  463  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.304208  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1468  argininosuccinate synthase  56.89 
 
 
410 aa  464  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0853487  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1099  argininosuccinate synthase  57.97 
 
 
408 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6641  argininosuccinate synthase  57.11 
 
 
413 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.453364  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0084  argininosuccinate synthase  56.08 
 
 
409 aa  459  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0882429  normal  0.0155281 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1043  argininosuccinate synthase  55.36 
 
 
407 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3751  argininosuccinate synthase  56.23 
 
 
419 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0067  argininosuccinate synthase  57.64 
 
 
407 aa  459  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_19853  predicted protein  57.84 
 
 
402 aa  461  9.999999999999999e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4763  argininosuccinate synthase  57.18 
 
 
407 aa  460  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3206  argininosuccinate synthase  56.39 
 
 
408 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0747  argininosuccinate synthase  58.02 
 
 
409 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2588  argininosuccinate synthase  56.33 
 
 
403 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3331  argininosuccinate synthase  56.09 
 
 
409 aa  454  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3063  argininosuccinate synthase  57.79 
 
 
405 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711058  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1622  argininosuccinate synthase  55.53 
 
 
405 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00134855  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1849  argininosuccinate synthase  55.75 
 
 
409 aa  457  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4040  argininosuccinate synthase  57.11 
 
 
407 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1195  argininosuccinate synthase  58.87 
 
 
404 aa  456  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0756  argininosuccinate synthase  56.39 
 
 
408 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.589205  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3718  argininosuccinate synthase  57.36 
 
 
407 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3344  argininosuccinate synthase  58.04 
 
 
419 aa  457  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18740  argininosuccinate synthase  55.78 
 
 
405 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00166387  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2674  argininosuccinate synthase  56.97 
 
 
409 aa  457  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2452  Argininosuccinate synthase  56.82 
 
 
404 aa  455  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341026  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4161  argininosuccinate synthase  56.85 
 
 
409 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0074  argininosuccinate synthase  56.53 
 
 
406 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0073  argininosuccinate synthase  56.53 
 
 
406 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2803  argininosuccinate synthase  56.31 
 
 
409 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.953161  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4517  argininosuccinate synthase  54.95 
 
 
405 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2883  argininosuccinate synthase  55.77 
 
 
407 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0086  argininosuccinate synthase  56.53 
 
 
412 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.509496  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4324  argininosuccinate synthase  56.03 
 
 
405 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0601  argininosuccinate synthase  56.93 
 
 
402 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000197496 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1088  argininosuccinate synthase  55.78 
 
 
405 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1129  argininosuccinate synthase  55.78 
 
 
405 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.504857  normal  0.904376 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1631  argininosuccinate synthase  54.95 
 
 
412 aa  450  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0894235  hitchhiker  0.00967015 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0571  argininosuccinate synthase  55.78 
 
 
401 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3623  argininosuccinate synthase  55.05 
 
 
409 aa  450  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.724533  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0680  argininosuccinate synthase  56.68 
 
 
408 aa  450  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1117  argininosuccinate synthase  55.53 
 
 
405 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14080  argininosuccinate synthase  55.64 
 
 
406 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00581538  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1064  argininosuccinate synthase  54.82 
 
 
406 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.269529  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2108  argininosuccinate synthase  55.86 
 
 
405 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2285  argininosuccinate synthase  54.29 
 
 
408 aa  445  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  55.1 
 
 
410 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1027  argininosuccinate synthase  56.09 
 
 
409 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00571105  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2127  argininosuccinate synthase  55 
 
 
406 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.263511  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1864  argininosuccinate synthase  54.7 
 
 
412 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0468314  normal  0.0853528 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  54.94 
 
 
1496 aa  444  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4155  argininosuccinate synthase  54.46 
 
 
405 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3892  argininosuccinate synthase  54.21 
 
 
405 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.141657 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3745  argininosuccinate synthase  55.44 
 
 
406 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1373  argininosuccinate synthase  55.73 
 
 
404 aa  442  1e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0310982  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2423  argininosuccinate synthase  54.73 
 
 
409 aa  442  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.106011  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  53.83 
 
 
399 aa  444  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2916  argininosuccinate synthase  56.6 
 
 
410 aa  444  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3742  argininosuccinate synthase  55.16 
 
 
407 aa  443  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000983467 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0842  argininosuccinate synthase  54.82 
 
 
407 aa  441  1e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00643097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0228  argininosuccinate synthase  54.34 
 
 
406 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0206  argininosuccinate synthase  54.75 
 
 
406 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000461564 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0680  argininosuccinate synthase  55.24 
 
 
393 aa  440  9.999999999999999e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.90622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>