22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1061 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1061  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  854    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000023277  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0727  hypothetical protein  59.28 
 
 
413 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.190594  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2605  hypothetical protein  57.97 
 
 
412 aa  494  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000329131  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0968  hypothetical protein  59.06 
 
 
423 aa  495  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309382 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0050  hypothetical protein  53.59 
 
 
416 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0736  hypothetical protein  53.37 
 
 
413 aa  437  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000863321  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2075  hydrolase (HAD superfamily)  38.44 
 
 
396 aa  278  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.957527  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0396  HAD superfamily hydrolase  40.26 
 
 
396 aa  276  5e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0008  hypothetical protein  37.82 
 
 
403 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1848  hypothetical protein  35.71 
 
 
411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2052  hydrolase  35.96 
 
 
412 aa  241  1e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0006  hydrolase  35.98 
 
 
406 aa  239  5e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0007  hydrolase  37.89 
 
 
405 aa  236  7e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0891222  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0015  hypothetical protein  35.14 
 
 
408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.2869  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1522  hypothetical protein  36.21 
 
 
408 aa  233  3e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0042  hypothetical protein  35.14 
 
 
408 aa  233  5e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.233125  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0015  hypothetical protein  34.89 
 
 
408 aa  232  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.83051  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1299  hypothetical protein  34.7 
 
 
398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.201423  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1594  hydrolase (HAD superfamily)  34.2 
 
 
396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1938  metal dependent phosphohydrolase  23.62 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000381363  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0590  metal dependent phosphohydrolase  26.63 
 
 
349 aa  65.1  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1074  metal dependent phosphohydrolase  30.12 
 
 
359 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>