88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1055 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  100 
 
 		 198 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  33.75 
 
 		 197 aa  94.7  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  35.62 
 
 		 204 aa  91.3  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  29.95 
 
 		 199 aa  84.7  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  31.03 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  29.41 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  31.28 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  31.61 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  27.68 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  32.02 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  29.19 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  29.19 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  25.97 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  31.09 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  25.65 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  28.65 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  28.81 
 
 		 196 aa  62  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  24.38 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  27.72 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0504  hypothetical protein  27.47 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0320775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  24.23 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  27.84 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3508  resolvase, RNase H-like fold  27.82 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  26.95 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  0.000000370009 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  27.69 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  23.71 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4703  hypothetical protein  25.29 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2832  hypothetical protein  26.88 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.766034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4911  hypothetical protein  25.29 
 
 		 251 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4787  hypothetical protein  25.58 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  28.95 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4964  hypothetical protein  25.6 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340246  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4854  hypothetical protein  27.34 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0367  hypothetical protein  27.34 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  25.42 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2009  hypothetical protein  28.67 
 
 		 221 aa  49.3  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  23.66 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4001  hypothetical protein  26.7 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1795  hypothetical protein  27.13 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1140  putative lipoprotein  26.9 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000741069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  26.9 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000948477  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  26.9 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  26.9 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  26.9 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  31.48 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0041  putative lipoprotein  26.71 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1959  hypothetical protein  22.5 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000996139  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0600  hypothetical protein  26.14 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  28.48 
 
 		 248 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2068  protein of unknown function DUF330  26.6 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3138  hypothetical protein  26.63 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2112  hypothetical protein  30.46 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.178277  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1866  hypothetical protein  30.46 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2578  hypothetical protein  27.89 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  29.33 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02657  hypothetical protein  30.91 
 
 		 202 aa  45.1  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2548  putative lipoprotein  27.21 
 
 		 192 aa  45.1  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00417943  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43450  hypothetical protein  27.22 
 
 		 242 aa  45.1  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140988  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2637  hypothetical protein  27.21 
 
 		 192 aa  45.1  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.2573  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3078  putative lipoprotein  33.73 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.378307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  26.85 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000327636  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  26.85 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000251515  hitchhiker  0.00000297897 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  26.85 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000185697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  26.85 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000240203  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  28.17 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00956  hypothetical protein  26.87 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000276204  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00963  hypothetical protein  26.87 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  29.8 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1991  putative lipoprotein  27.21 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3377  hypothetical protein  26.47 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237475  normal  0.194903 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  25 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  25.37 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  27.52 
 
 		 187 aa  42.7  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3375  putative lipoprotein  26.16 
 
 		 252 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203626  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1267  hypothetical protein  25.42 
 
 		 264 aa  42  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  26.17 
 
 		 187 aa  42  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000042581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1921  hypothetical protein  28.21 
 
 		 199 aa  42  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1653  protein of unknown function DUF330  28.89 
 
 		 185 aa  41.6  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  26.67 
 
 		 225 aa  42  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 187 aa  42  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000482452  normal  0.394753 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0291  putative lipoprotein  27.75 
 
 		 252 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3341  hypothetical protein  27.75 
 
 		 239 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2560  putative lipoprotein  27.75 
 
 		 252 aa  41.6  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 192 aa  41.6  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1714  hypothetical protein  29.73 
 
 		 232 aa  41.2  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000167749 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1153  putative lipoprotein  27.75 
 
 		 256 aa  41.2  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3383  hypothetical protein  27.75 
 
 		 256 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2377  putative lipoprotein  27.75 
 
 		 256 aa  41.2  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>