176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1045 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1045  hypothetical protein  100 
 
 		 517 aa  1029    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000634893  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0161  integral membrane protein  49.4 
 
 		 584 aa  418  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0150458 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1685  hypothetical protein  49.2 
 
 		 516 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  32.21 
 
 		 739 aa  193  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  27.86 
 
 		 881 aa  168  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1145  hypothetical protein  32.9 
 
 		 312 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  29.31 
 
 		 872 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  28.34 
 
 		 877 aa  166  8e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  30.43 
 
 		 880 aa  163  5.0000000000000005e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  30.08 
 
 		 880 aa  163  9e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3203  hypothetical protein  35.23 
 
 		 311 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.030051 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  31.16 
 
 		 863 aa  162  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  30.97 
 
 		 863 aa  161  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  30.04 
 
 		 872 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1503  hypothetical protein  35.1 
 
 		 317 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1476  hypothetical protein  35.1 
 
 		 317 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5128  hypothetical protein  33.22 
 
 		 320 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79824  normal  0.0594862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0832  hypothetical protein  31.65 
 
 		 314 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5424  hypothetical protein  32.41 
 
 		 320 aa  153  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06897  hitchhiker  0.00740076 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  32.52 
 
 		 850 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  27.46 
 
 		 813 aa  149  9e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0977  hypothetical protein  33.98 
 
 		 320 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1006  protein of unknown function DUF470  33.98 
 
 		 320 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  30.18 
 
 		 854 aa  147  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0804  hypothetical protein  33.6 
 
 		 313 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4027  hypothetical protein  30.9 
 
 		 317 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  31.47 
 
 		 850 aa  144  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0267  hypothetical protein  27.43 
 
 		 692 aa  144  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  31.47 
 
 		 850 aa  144  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1658  hypothetical protein  30.72 
 
 		 356 aa  143  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  27.56 
 
 		 870 aa  143  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  30.69 
 
 		 867 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1041  hypothetical protein  30.39 
 
 		 368 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4044  hypothetical protein  30.59 
 
 		 313 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  30.1 
 
 		 864 aa  140  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  29.28 
 
 		 867 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  29.66 
 
 		 880 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  29.17 
 
 		 880 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3194  integral membrane protein-like protein  30.3 
 
 		 393 aa  135  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00740284  decreased coverage  0.00804794 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3589  hypothetical protein  30.03 
 
 		 362 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106529  hitchhiker  0.00246674 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  32.36 
 
 		 855 aa  134  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  32.83 
 
 		 864 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5004  hypothetical protein  29.87 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0841  integral membrane protein-like protein  30.26 
 
 		 339 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.18385 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3617  hypothetical protein  32.38 
 
 		 350 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  30.31 
 
 		 864 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  29.15 
 
 		 869 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  27.98 
 
 		 880 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  27.77 
 
 		 879 aa  127  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  31.5 
 
 		 850 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  31.1 
 
 		 850 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  31.1 
 
 		 850 aa  126  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2810  putative membrane protein of unknown function  28.28 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  31.5 
 
 		 850 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0024  hypothetical protein  30.03 
 
 		 338 aa  124  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5576  hypothetical protein  31.76 
 
 		 355 aa  124  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  30.3 
 
 		 854 aa  124  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  30.49 
 
 		 889 aa  123  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  28.2 
 
 		 880 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  31.47 
 
 		 844 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  32.75 
 
 		 844 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  30.69 
 
 		 889 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  30.69 
 
 		 889 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  29.18 
 
 		 896 aa  123  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2915  hypothetical protein  29.33 
 
 		 343 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2688  hypothetical protein  29.33 
 
 		 343 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3951  hypothetical protein  31.17 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0277158  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2647  hypothetical protein  30.87 
 
 		 319 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.412337 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2485  hypothetical protein  30.23 
 
 		 310 aa  121  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607254  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  29.65 
 
 		 883 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4925  hypothetical protein  28.34 
 
 		 344 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  30.77 
 
 		 876 aa  120  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5268  hypothetical protein  29.28 
 
 		 344 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3502  hypothetical protein  28.16 
 
 		 332 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0901  hypothetical protein  30.41 
 
 		 329 aa  118  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  27.35 
 
 		 875 aa  117  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  27.66 
 
 		 864 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  27.38 
 
 		 880 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  27.38 
 
 		 880 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0774  hypothetical protein  27.04 
 
 		 344 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.551414  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  28.57 
 
 		 877 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  28.57 
 
 		 877 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0879  hypothetical protein  30.87 
 
 		 317 aa  114  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00199978  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0504  hypothetical protein  27.56 
 
 		 351 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.579853 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2286  integral membrane protein-like protein  29.54 
 
 		 326 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.042451  hitchhiker  0.0000479445 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4608  hypothetical protein  28.12 
 
 		 321 aa  114  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0184  hypothetical protein  26.64 
 
 		 360 aa  114  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  31.74 
 
 		 864 aa  114  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0756  hypothetical protein  27.19 
 
 		 351 aa  114  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0886  hypothetical protein  27.3 
 
 		 344 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  31.99 
 
 		 864 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2169  integral membrane protein-like protein  28.48 
 
 		 338 aa  113  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0811  hypothetical protein  30.42 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00494476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  29.02 
 
 		 866 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00755  conserved inner membrane protein  31.07 
 
 		 318 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2527  hypothetical protein  28.26 
 
 		 340 aa  111  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00772  hypothetical protein  31.07 
 
 		 318 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  29.52 
 
 		 864 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1469  hypothetical protein  29.35 
 
 		 368 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0291454  normal  0.344342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0842  hypothetical protein  30.74 
 
 		 318 aa  109  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>