More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1022 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  100 
 
 		 158 aa  309  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  86.54 
 
 		 158 aa  239  9e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  90.15 
 
 		 158 aa  238  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  89.39 
 
 		 158 aa  237  5e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  66.4 
 
 		 164 aa  175  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  53.24 
 
 		 162 aa  167  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  54.97 
 
 		 165 aa  167  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  51.57 
 
 		 168 aa  165  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  51.33 
 
 		 168 aa  165  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  64.06 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  50.65 
 
 		 163 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  48.32 
 
 		 183 aa  164  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  49.67 
 
 		 165 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  49.67 
 
 		 165 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  53.33 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  50 
 
 		 163 aa  161  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  51.41 
 
 		 159 aa  160  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  56.2 
 
 		 147 aa  160  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  46.2 
 
 		 167 aa  160  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  57.69 
 
 		 165 aa  160  9e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  50.65 
 
 		 164 aa  159  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  49.66 
 
 		 165 aa  158  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  49.66 
 
 		 165 aa  158  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  49.35 
 
 		 164 aa  157  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  47.4 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  49.63 
 
 		 170 aa  150  7e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  50 
 
 		 165 aa  147  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  50.69 
 
 		 163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  50.68 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  48.61 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  47.62 
 
 		 169 aa  141  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  52.82 
 
 		 189 aa  142  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  43.71 
 
 		 159 aa  140  8e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  43.04 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  42 
 
 		 173 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  43.66 
 
 		 174 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  42.47 
 
 		 160 aa  137  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  42.66 
 
 		 169 aa  137  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  47.62 
 
 		 518 aa  137  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  45.27 
 
 		 166 aa  137  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  43.23 
 
 		 163 aa  137  7e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  42.86 
 
 		 165 aa  137  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  44.44 
 
 		 161 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  47.18 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  43.71 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  44.52 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  42.21 
 
 		 174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  41.26 
 
 		 171 aa  134  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  41.14 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  41.14 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  45.33 
 
 		 163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  43.14 
 
 		 161 aa  133  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  44.14 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  47.89 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  48.89 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  44.44 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  42.67 
 
 		 164 aa  131  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  42.76 
 
 		 164 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  40.14 
 
 		 167 aa  131  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  42.76 
 
 		 164 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  42.76 
 
 		 164 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  42.76 
 
 		 164 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  42.67 
 
 		 164 aa  131  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  42.67 
 
 		 164 aa  131  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  42.67 
 
 		 164 aa  131  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  45.64 
 
 		 163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  43.15 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  44.14 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  41.83 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  42.07 
 
 		 192 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  41.83 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  40.14 
 
 		 174 aa  130  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  44.6 
 
 		 163 aa  130  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  45.14 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  42.96 
 
 		 187 aa  130  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  43.14 
 
 		 159 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  40.82 
 
 		 177 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  40.85 
 
 		 166 aa  130  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  40.82 
 
 		 177 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  44.53 
 
 		 159 aa  130  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  40.82 
 
 		 171 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  37.66 
 
 		 174 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  39.47 
 
 		 183 aa  130  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  41.5 
 
 		 162 aa  130  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  45.21 
 
 		 164 aa  130  9e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  40.82 
 
 		 171 aa  130  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  40.85 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  43.15 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  40.85 
 
 		 163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  42.38 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  40.14 
 
 		 167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  40.85 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  44.44 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  41.38 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  40.85 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  39.44 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  41.94 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  43.45 
 
 		 218 aa  128  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  40.14 
 
 		 171 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  40.14 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>