29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1018 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1018  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  437  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2837  nucleotidyl transferase  39.9 
 
 		 220 aa  142  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0282356  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0149  hypothetical protein  37.09 
 
 		 219 aa  121  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0197  hypothetical protein  35.24 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.950311  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50310  sugar nucleotidyltransferase  33.49 
 
 		 220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000057924  hitchhiker  0.000309665 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2615  putative sugar nucleotidyltransferase  29.81 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1279  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  28.82 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.41 
 
 		 428 aa  57  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  29.7 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1173  hypothetical protein  28.63 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0210885  normal  0.86006 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  27.21 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  30.65 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29421  hypothetical protein  28.81 
 
 		 244 aa  48.9  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1841  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  27.4 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3985  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  31.93 
 
 		 241 aa  48.5  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.755294 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2448  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  29.06 
 
 		 453 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.420996  hitchhiker  0.000000146766 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0605  nucleotidyl transferase  34.55 
 
 		 281 aa  45.1  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000562862  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1014  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.33 
 
 		 434 aa  44.7  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  33.04 
 
 		 249 aa  44.3  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1575  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  27.83 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00205775  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  36.84 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  36.84 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  32.43 
 
 		 270 aa  42.7  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  28.95 
 
 		 237 aa  42.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4129  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  37.74 
 
 		 238 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511095 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2348  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  32.46 
 
 		 451 aa  42  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0891  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  35.23 
 
 		 230 aa  42  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2529  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.46 
 
 		 237 aa  41.6  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920696  normal  0.398037 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6661  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  37.7 
 
 		 483 aa  41.2  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>