More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1013 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
812 aa  1668    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  41.63 
 
 
930 aa  161  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1401  glycosyl transferase family 2  39.37 
 
 
898 aa  146  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.463731  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1497  glycosyl transferase family 2  39.37 
 
 
898 aa  146  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0238039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2458  glycosyl transferase family protein  39.37 
 
 
774 aa  146  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.745195  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  40.48 
 
 
303 aa  138  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  37.22 
 
 
294 aa  134  9e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 
1032 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  35.55 
 
 
235 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
750 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 
318 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
299 aa  113  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  32.71 
 
 
311 aa  112  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.49 
 
 
341 aa  111  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
330 aa  111  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
316 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0309  glycosyltransferase  37.13 
 
 
318 aa  109  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
334 aa  109  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 
305 aa  109  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  34.26 
 
 
363 aa  109  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 
352 aa  108  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 
336 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 
381 aa  108  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 
398 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.6 
 
 
419 aa  107  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  30.62 
 
 
727 aa  107  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  33.49 
 
 
299 aa  107  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
318 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
321 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 
337 aa  106  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 
333 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  34.13 
 
 
544 aa  104  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  32.55 
 
 
300 aa  104  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
324 aa  104  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 
268 aa  104  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 
1177 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
373 aa  103  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 
704 aa  103  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  28.16 
 
 
672 aa  103  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2746  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
260 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
597 aa  103  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
1177 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  31.58 
 
 
255 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 
322 aa  103  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
361 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
450 aa  101  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  25.85 
 
 
581 aa  101  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 
742 aa  101  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 
289 aa  100  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  31.23 
 
 
1182 aa  100  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2737  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
482 aa  100  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0308026  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  33.65 
 
 
347 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  29.83 
 
 
1152 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  32.3 
 
 
373 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
261 aa  100  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
331 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  29.83 
 
 
1152 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
294 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 
1509 aa  100  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.18 
 
 
321 aa  99.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
261 aa  100  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
1035 aa  99.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 
320 aa  99  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
336 aa  98.6  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
306 aa  97.8  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
327 aa  97.4  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.48 
 
 
377 aa  97.4  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
397 aa  97.4  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
336 aa  97.4  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.83 
 
 
466 aa  97.4  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  33.65 
 
 
334 aa  97.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.33 
 
 
317 aa  96.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 
373 aa  96.3  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
305 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 
1250 aa  96.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2207  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 
335 aa  95.5  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
300 aa  95.5  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
378 aa  95.9  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  34.41 
 
 
302 aa  95.9  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0325  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.08 
 
 
643 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0347044  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  32.63 
 
 
276 aa  95.5  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 
385 aa  95.5  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0430  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.88 
 
 
642 aa  95.1  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
342 aa  95.1  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  30.23 
 
 
340 aa  95.1  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
1067 aa  94.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  29.81 
 
 
272 aa  94.7  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
412 aa  94.4  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1233  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 
278 aa  94.4  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.784226  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  24.93 
 
 
1156 aa  94  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 
365 aa  93.6  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.96 
 
 
294 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  24.66 
 
 
314 aa  93.6  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
286 aa  94  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  31.2 
 
 
341 aa  94  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
333 aa  94  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1642  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 
297 aa  94  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3648  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 
738 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250737  normal  0.0159543 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  34.39 
 
 
1739 aa  93.2  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
367 aa  93.2  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>