189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0965 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  100 
 
 		 487 aa  948    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  44.6 
 
 		 285 aa  110  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  45.22 
 
 		 257 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  31.91 
 
 		 271 aa  98.2  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  30.57 
 
 		 271 aa  95.5  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  42.74 
 
 		 263 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  37.61 
 
 		 255 aa  89  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1529  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 240 aa  88.6  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  normal  0.395847 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0473  tol-pal system protein YbgF  39.64 
 
 		 350 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0955872  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  35.96 
 
 		 264 aa  85.9  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  35.96 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  35.96 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  35.96 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  35.96 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2746  hypothetical protein  36.21 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  35.59 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  39.32 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  35.96 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  30.91 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1787  tol-pal system protein YbgF  36.21 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000124758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  30.91 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  30.91 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  30.91 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  30.91 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  30.91 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  35.09 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2536  tol-pal system protein YbgF  36.21 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000911459  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  35.09 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1748  TPR repeat-containing protein  36.21 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000756054  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1744  Tol-Pal system YbgF  36.21 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000201827  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  35.09 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  35.25 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1609  tetratricopeptide domain-containing protein  36.21 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000616267  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  35.59 
 
 		 322 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  38.94 
 
 		 257 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  35.96 
 
 		 262 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  36.75 
 
 		 268 aa  82.8  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  35.9 
 
 		 261 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2529  hypothetical protein  36.21 
 
 		 250 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000104047  normal  0.0224917 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  35.96 
 
 		 258 aa  82.4  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2366  hypothetical protein  36.21 
 
 		 250 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000582291  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2438  hypothetical protein  36.21 
 
 		 250 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000167584  normal  0.413869 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  35.9 
 
 		 245 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  38.05 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  38.76 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  39.36 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  37.07 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  39.36 
 
 		 283 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  30.51 
 
 		 269 aa  79.7  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  30.51 
 
 		 269 aa  79.7  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  31.93 
 
 		 251 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  31.58 
 
 		 269 aa  79.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  40.35 
 
 		 239 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  30.51 
 
 		 269 aa  79.7  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  37.07 
 
 		 241 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  32.46 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  36.21 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  32.2 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  34.48 
 
 		 263 aa  76.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  37.19 
 
 		 272 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  37.19 
 
 		 248 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  36.52 
 
 		 273 aa  76.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  37.61 
 
 		 265 aa  76.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  34.51 
 
 		 262 aa  76.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  38.02 
 
 		 270 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  36.7 
 
 		 276 aa  75.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2729  tol-pal system protein YbgF  35.9 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000699161  hitchhiker  0.0000235132 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  35.9 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3198  tol-pal system protein YbgF  32.2 
 
 		 329 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2713  TPR repeat-containing protein  39.08 
 
 		 305 aa  73.2  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0957329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 275 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2625  Tol-Pal system YbgF  29.45 
 
 		 345 aa  73.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  34.51 
 
 		 301 aa  73.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  36.07 
 
 		 249 aa  72.4  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  34.75 
 
 		 284 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0281  tol-pal system protein YbgF  35.51 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433103  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003911  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 250 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100041  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5489  tol-pal system protein YbgF  34.55 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39153  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2973  TPR domain-containing protein  40.4 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.485874  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  36.52 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  39.47 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  29.27 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  36.07 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3493  tol-pal system protein YbgF  33.04 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0902147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  36.43 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  36.07 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  32.23 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  34.19 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  33.04 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  35.9 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01613  hypothetical protein  33.04 
 
 		 188 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3169  tetratricopeptide TPR_2  26.55 
 
 		 334 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  32.17 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  31.9 
 
 		 243 aa  68.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  32.17 
 
 		 271 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1900  hypothetical protein  33.62 
 
 		 254 aa  68.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.311417  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  33.9 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>