More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0959 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 430 aa  881    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  71.09 
 
 		 440 aa  581  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  68.65 
 
 		 442 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  66.03 
 
 		 450 aa  549  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  61.54 
 
 		 442 aa  495  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  59.02 
 
 		 443 aa  474  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  50 
 
 		 461 aa  389  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  48.71 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  49.18 
 
 		 434 aa  381  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  47.53 
 
 		 434 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  47.07 
 
 		 434 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  48.46 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  47.17 
 
 		 438 aa  366  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  47.56 
 
 		 434 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  45.77 
 
 		 434 aa  361  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  45.75 
 
 		 434 aa  361  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  45.24 
 
 		 421 aa  345  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  41.87 
 
 		 441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  43.33 
 
 		 420 aa  331  2e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  44.5 
 
 		 429 aa  327  3e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  39.2 
 
 		 464 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  44.89 
 
 		 436 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  38.15 
 
 		 426 aa  318  2e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  43.61 
 
 		 422 aa  316  6e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  43.61 
 
 		 422 aa  315  8e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  44.71 
 
 		 439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  42.24 
 
 		 432 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  39.01 
 
 		 464 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  41.15 
 
 		 420 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  43.54 
 
 		 426 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  42.69 
 
 		 428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  37.56 
 
 		 426 aa  307  3e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  43.03 
 
 		 425 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  42.82 
 
 		 425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  39.95 
 
 		 443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  41.55 
 
 		 425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  42.14 
 
 		 436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  42.69 
 
 		 425 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  42.58 
 
 		 425 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  42.34 
 
 		 425 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  42.01 
 
 		 398 aa  301  2e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  40.74 
 
 		 458 aa  300  5e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  42.34 
 
 		 425 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  40.29 
 
 		 419 aa  297  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  36.49 
 
 		 444 aa  296  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  39.71 
 
 		 446 aa  296  4e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  43.72 
 
 		 421 aa  296  5e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  38.95 
 
 		 419 aa  295  8e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  41.77 
 
 		 446 aa  295  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  40.43 
 
 		 418 aa  295  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0894  glutamyl-tRNA reductase  38.26 
 
 		 423 aa  295  1e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  40.23 
 
 		 422 aa  294  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  43.35 
 
 		 408 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  39.62 
 
 		 422 aa  293  4e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  37.83 
 
 		 443 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  37.2 
 
 		 444 aa  292  9e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  38.06 
 
 		 443 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  37.64 
 
 		 434 aa  291  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  37.29 
 
 		 458 aa  291  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  41.27 
 
 		 449 aa  291  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  39.25 
 
 		 454 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  36.97 
 
 		 444 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  38.06 
 
 		 444 aa  290  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  38.06 
 
 		 444 aa  290  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  38.06 
 
 		 444 aa  290  4e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  38.06 
 
 		 444 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  38.06 
 
 		 444 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0934  glutamyl-tRNA reductase  37.44 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  39.47 
 
 		 418 aa  288  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  42.28 
 
 		 443 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  42.28 
 
 		 443 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  36.97 
 
 		 444 aa  288  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  36.97 
 
 		 444 aa  288  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0951  glutamyl-tRNA reductase  36.97 
 
 		 425 aa  286  4e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  39.1 
 
 		 418 aa  286  4e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  41.01 
 
 		 422 aa  285  9e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  41.04 
 
 		 432 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  40.95 
 
 		 432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  38.5 
 
 		 428 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  40.95 
 
 		 432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  38.92 
 
 		 440 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2567  glutamyl-tRNA reductase  39.28 
 
 		 416 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000152956  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1426  glutamyl-tRNA reductase  37.83 
 
 		 425 aa  283  6.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  40.95 
 
 		 432 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  40.79 
 
 		 432 aa  282  7.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  40.95 
 
 		 432 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  38.73 
 
 		 428 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  38.22 
 
 		 420 aa  281  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  40.7 
 
 		 432 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1795  glutamyl-tRNA reductase  36.88 
 
 		 425 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  40.7 
 
 		 432 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0919  glutamyl-tRNA reductase  39.33 
 
 		 416 aa  280  5e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505435  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  39.8 
 
 		 429 aa  279  7e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  37.56 
 
 		 423 aa  279  7e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  39.71 
 
 		 434 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  39.71 
 
 		 434 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  41.39 
 
 		 414 aa  277  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  39.85 
 
 		 434 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  39.71 
 
 		 434 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  39.71 
 
 		 434 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>