More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0952 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0952  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  100 
 
 
496 aa  994    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1722  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  52.39 
 
 
459 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.209021  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0122  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  51.25 
 
 
511 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.286827 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2204  exodeoxyribonuclease VII large subunit  50.62 
 
 
486 aa  411  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0939  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  49.38 
 
 
456 aa  369  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0421457  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1761  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  43.16 
 
 
455 aa  343  5.999999999999999e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1818  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.85 
 
 
467 aa  286  4e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3005  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.36 
 
 
462 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1267  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.36 
 
 
464 aa  280  6e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000176036  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2985  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.78 
 
 
448 aa  279  9e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.38 
 
 
446 aa  276  7e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.36 
 
 
448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.69 
 
 
453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0718  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.29 
 
 
448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1312  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.49 
 
 
445 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1126  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.15 
 
 
461 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2730  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.98 
 
 
465 aa  273  6e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000422836  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2658  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.33 
 
 
455 aa  273  6e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000423152  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1378  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.16 
 
 
448 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1136  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.88 
 
 
450 aa  272  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000110023  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1304  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.36 
 
 
448 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566056  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3143  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.95 
 
 
448 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2647  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.32 
 
 
466 aa  270  5e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1168  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.16 
 
 
456 aa  269  8e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000633307  normal  0.0126087 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2660  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.16 
 
 
456 aa  269  8e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.87444e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1234  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.19 
 
 
448 aa  269  8e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.181169  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2885  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.37 
 
 
456 aa  269  8.999999999999999e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000248025  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02401  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.37 
 
 
456 aa  269  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000149221  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1159  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.37 
 
 
456 aa  269  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000102008  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.54 
 
 
445 aa  268  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.26 
 
 
457 aa  269  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000210085  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02363  hypothetical protein  35.37 
 
 
456 aa  269  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000142965  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0294  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.93 
 
 
446 aa  268  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0888  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.27 
 
 
443 aa  266  4e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1034  Exodeoxyribonuclease VII  40.04 
 
 
447 aa  267  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3597  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.43 
 
 
458 aa  266  8.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000130865  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.37 
 
 
449 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000315473  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.37 
 
 
449 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.74 
 
 
476 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.58 
 
 
458 aa  265  1e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1233  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.95 
 
 
448 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2661  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.37 
 
 
449 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000015005  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.63 
 
 
458 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000215567  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.89 
 
 
451 aa  264  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.37 
 
 
449 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.63 
 
 
463 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2064  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.27 
 
 
403 aa  263  6e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.227488 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2759  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.29 
 
 
443 aa  263  6e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.340088  normal  0.610939 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.63 
 
 
458 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1339  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.35 
 
 
462 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.81 
 
 
443 aa  262  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0857  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.27 
 
 
443 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.89 
 
 
448 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.71 
 
 
446 aa  261  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000016399  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00415  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.08 
 
 
445 aa  261  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.03 
 
 
458 aa  261  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2746  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.16 
 
 
449 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000699903  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.9 
 
 
463 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0736  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.93 
 
 
444 aa  261  3e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.94 
 
 
459 aa  260  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.54 
 
 
443 aa  260  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15230  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.85 
 
 
459 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173867  hitchhiker  0.000000000874033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.73 
 
 
463 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1296  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.66 
 
 
442 aa  259  6e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0430502  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3734  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.57 
 
 
456 aa  259  7e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000326312  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3125  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.71 
 
 
442 aa  258  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0284972  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2360  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.95 
 
 
447 aa  258  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.203365  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39770  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.75 
 
 
456 aa  257  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.979844  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1025  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.65 
 
 
463 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1027  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.63 
 
 
459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444658  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1865  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.22 
 
 
411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.862893 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.95 
 
 
451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.64 
 
 
414 aa  254  3e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1665  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.49 
 
 
448 aa  254  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.156088  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02974  exonuclease VII, large subunit  32.99 
 
 
450 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143789  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.73 
 
 
463 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1193  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.08 
 
 
458 aa  253  5.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.10806e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.05 
 
 
414 aa  253  6e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1458  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.61 
 
 
454 aa  253  7e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1848  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.17 
 
 
453 aa  252  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000692777  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.17 
 
 
452 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.17 
 
 
452 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2406  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.51 
 
 
475 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000113939  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0612  exodeoxyribonuclease VII  36.02 
 
 
452 aa  251  3e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000716955  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0410  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.87 
 
 
459 aa  251  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000134785  hitchhiker  0.000369784 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.38 
 
 
452 aa  250  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.38 
 
 
452 aa  250  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1670  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  46.75 
 
 
401 aa  250  5e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014352  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1301  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.87 
 
 
459 aa  250  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000114365  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.58 
 
 
452 aa  249  8e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1558  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.71 
 
 
442 aa  248  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0686099  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.97 
 
 
452 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.97 
 
 
452 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.97 
 
 
452 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.97 
 
 
452 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.67 
 
 
447 aa  248  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1415  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.01 
 
 
494 aa  248  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0998332  normal  0.187038 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.97 
 
 
452 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4244  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.78 
 
 
444 aa  247  3e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3218  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.2 
 
 
457 aa  247  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>