234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0930 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0930  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  721    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0225684  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2603  hypothetical protein  75.61 
 
 
369 aa  560  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2400  hypothetical protein  76.15 
 
 
369 aa  560  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1866  hypothetical protein  44.71 
 
 
374 aa  248  8e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0464995  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  33.88 
 
 
357 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1255  hypothetical protein  32.79 
 
 
360 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2840  hypothetical protein  33.84 
 
 
360 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  31.76 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  29.02 
 
 
390 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  28.89 
 
 
355 aa  105  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2085  hypothetical protein  27.64 
 
 
418 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230868  normal  0.137994 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  28.08 
 
 
335 aa  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  28.42 
 
 
337 aa  100  4e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  27.67 
 
 
352 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  28.72 
 
 
352 aa  99.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4651  hypothetical protein  26.32 
 
 
419 aa  97.4  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  26.09 
 
 
360 aa  97.1  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  26.09 
 
 
360 aa  97.1  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0563  hypothetical protein  28.53 
 
 
421 aa  96.7  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0497935  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3183  Uncharacterized protein family UPF0324  29.21 
 
 
327 aa  95.9  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  27.46 
 
 
324 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0171  Uncharacterized protein family UPF0324  25.83 
 
 
442 aa  92  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  26.67 
 
 
340 aa  92  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  27.21 
 
 
335 aa  91.7  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4671  hypothetical protein  26.54 
 
 
449 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2550  Uncharacterized protein family UPF0324  29.33 
 
 
348 aa  90.9  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164306  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  26.21 
 
 
352 aa  90.1  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  26.21 
 
 
340 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  26.21 
 
 
352 aa  90.1  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  26.21 
 
 
340 aa  89.7  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  26.88 
 
 
338 aa  89.7  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  25.42 
 
 
354 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  25.89 
 
 
340 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  26.44 
 
 
340 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  25.57 
 
 
352 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3720  hypothetical protein  25.55 
 
 
416 aa  87  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117489  normal  0.0352204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  26.26 
 
 
348 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  25.61 
 
 
355 aa  86.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0423  hypothetical protein  27.65 
 
 
331 aa  86.3  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.198162 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0719  hypothetical protein  31.62 
 
 
379 aa  85.9  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2707  hypothetical protein  28.48 
 
 
423 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000039594  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3197  hypothetical protein  26.78 
 
 
569 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  25.46 
 
 
377 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1635  hypothetical protein  27.22 
 
 
436 aa  84.7  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  28.44 
 
 
339 aa  85.1  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0261  hypothetical protein  27.35 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  25.25 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  25.41 
 
 
340 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  25.41 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  25.41 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  23.87 
 
 
340 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0046  hypothetical protein  27.95 
 
 
473 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0334  hypothetical protein  26.51 
 
 
436 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  27.61 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3343  hypothetical protein  27.12 
 
 
445 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3265  hypothetical protein  25.82 
 
 
445 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  24.76 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  24.36 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  25 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0419  hypothetical protein  29.11 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000120524  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1881  hypothetical protein  29.9 
 
 
347 aa  80.1  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742427 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51806  inner membrane protein  24.2 
 
 
441 aa  80.1  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.959187  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  21.07 
 
 
335 aa  79.3  0.00000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  26.61 
 
 
355 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  25.58 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  25.58 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  25.57 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  25.58 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1657  hypothetical protein  25.99 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3021  hypothetical protein  27.3 
 
 
473 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2815  Uncharacterized protein family UPF0324  24.58 
 
 
434 aa  77.8  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  25.25 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  25.75 
 
 
357 aa  77  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5032  hypothetical protein  25.33 
 
 
355 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.35937 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1657  hypothetical protein  24.75 
 
 
358 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  24.4 
 
 
365 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2420  hypothetical protein  23.28 
 
 
361 aa  76.3  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  22.85 
 
 
361 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  26.94 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2292  hypothetical protein  26.21 
 
 
420 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0756  hypothetical protein  25.9 
 
 
331 aa  75.1  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.825014  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3152  hypothetical protein  25.45 
 
 
445 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.378189  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  28.19 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  26.77 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  28.19 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1523  hypothetical protein  24.42 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.735996 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5713  hypothetical protein  28.02 
 
 
361 aa  73.9  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0304105 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01436  hypothetical protein  26.36 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  22.89 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  23.87 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3661  hypothetical protein  22.9 
 
 
353 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  27 
 
 
325 aa  72.8  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2170  hypothetical protein  28.19 
 
 
593 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  20.73 
 
 
380 aa  71.6  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  26.25 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  26.67 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2242  hypothetical protein  23.91 
 
 
353 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1597  hypothetical protein  26.59 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  21.07 
 
 
348 aa  70.1  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1977  hypothetical protein  24.1 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.284569  normal  0.0203812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>