41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0905 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0905  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  712    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0830124  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3168  hypothetical protein  66.02 
 
 
365 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0820  hypothetical protein  62.36 
 
 
361 aa  418  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3245  hypothetical protein  61.67 
 
 
363 aa  402  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0249  hypothetical protein  52.62 
 
 
367 aa  374  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0026  hypothetical protein  53.16 
 
 
354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.228478  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1442  hypothetical protein  51.84 
 
 
353 aa  330  2e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000253988  normal  0.0151377 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1621  hypothetical protein  50.75 
 
 
360 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2081  hypothetical protein  49.57 
 
 
356 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2089  hypothetical protein  51.4 
 
 
368 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000895888  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0064  hypothetical protein  49.42 
 
 
362 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2467  hypothetical protein  47.54 
 
 
349 aa  299  7e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000101698  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0601  hypothetical protein  49.24 
 
 
361 aa  294  2e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2434  hypothetical protein  46.97 
 
 
337 aa  287  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.792267  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00560  hypothetical protein  45.82 
 
 
381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0403  hypothetical protein  44.72 
 
 
356 aa  273  3e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25130  hypothetical protein  43.69 
 
 
369 aa  271  1e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.917917 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0957  metal-activated pyridoxal enzyme  43.38 
 
 
352 aa  269  7e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.361179  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0186  hypothetical protein  44.63 
 
 
352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00395817  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2765  hypothetical protein  41.14 
 
 
354 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0570  hypothetical protein  44.75 
 
 
353 aa  219  5e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2313  hypothetical protein  45.23 
 
 
366 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2901  hypothetical protein  41.62 
 
 
345 aa  203  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0538  hypothetical protein  35.71 
 
 
357 aa  193  5e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1636  hypothetical protein  53.17 
 
 
171 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0851  transporter component  29.73 
 
 
159 aa  59.7  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0037  transporter component  29.66 
 
 
156 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0850  cytochrome c heme-binding site  30.94 
 
 
151 aa  56.2  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0786  transporter component  28.97 
 
 
156 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1132  transporter component  28.97 
 
 
156 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0827  transporter component  30.43 
 
 
157 aa  52.8  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0166268  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  34 
 
 
344 aa  53.1  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0785  cytochrome c heme-binding site  31.65 
 
 
151 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1133  cytochrome c heme-binding site  30.22 
 
 
151 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0038  cytochrome c heme-binding site  30.22 
 
 
151 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0826  uncharacterized membrane protein  27.27 
 
 
166 aa  48.9  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171208  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.45 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  32.28 
 
 
371 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4041  YeeE/YedE  28.28 
 
 
367 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.66 
 
 
373 aa  43.5  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.865482  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2590  hypothetical protein  32.8 
 
 
455 aa  42.7  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>