35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0904 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0904  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00947642  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0821  hypothetical protein  51.39 
 
 		 79 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3169  SirA family protein  58.18 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3246  SirA family protein  47.95 
 
 		 73 aa  60.5  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1620  SirA family protein  43.66 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.591727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2082  SirA family protein  44.12 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  50 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  50 
 
 		 72 aa  52  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  45.16 
 
 		 196 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2466  hypothetical protein  41.27 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315359  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0248  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  50.8  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  50 
 
 		 193 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  42.86 
 
 		 209 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0063  SirA family protein  45.1 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  45 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  43.1 
 
 		 200 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0027  SirA family protein  41.54 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  38.71 
 
 		 195 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  40.98 
 
 		 202 aa  48.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  46.67 
 
 		 196 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  42.42 
 
 		 196 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  38.71 
 
 		 195 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  47.62 
 
 		 195 aa  47.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00550  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  48.98 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  39.73 
 
 		 195 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2088  hypothetical protein  34.85 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  38.03 
 
 		 199 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  40.35 
 
 		 204 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  36.51 
 
 		 193 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  35.94 
 
 		 208 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  41.54 
 
 		 199 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  36.62 
 
 		 196 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25120  hypothetical protein  39.58 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.518593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4588  SirA family protein  33.33 
 
 		 197 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282378  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  40.3 
 
 		 197 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>