More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0900 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0900  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 384 aa  771    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000108273  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2499  RND family efflux transporter MFP subunit  48.32 
 
 		 416 aa  301  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2372  RND family efflux transporter MFP subunit  44.54 
 
 		 395 aa  288  9e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.09 
 
 		 379 aa  287  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000851177  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1651  secretion protein HlyD  40.43 
 
 		 407 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.986785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.25 
 
 		 440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0450  RND family efflux transporter MFP subunit  44.88 
 
 		 407 aa  276  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.825026 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1610  RND family efflux transporter MFP subunit  42.77 
 
 		 394 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.665479  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0064  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.46 
 
 		 377 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1788  RND family efflux transporter MFP subunit  43.27 
 
 		 383 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3395  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.05 
 
 		 389 aa  226  6e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2802  RND family efflux transporter MFP subunit  38.55 
 
 		 430 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2186  RND family efflux transporter MFP subunit  39.13 
 
 		 435 aa  225  9e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3585  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.82 
 
 		 435 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1596  RND family efflux transporter MFP subunit  40.49 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.566633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0732  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.53 
 
 		 440 aa  223  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  38.67 
 
 		 426 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0736  RND family efflux transporter MFP subunit  37.76 
 
 		 387 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2329  RND family efflux transporter MFP subunit  38.2 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.4455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  38.07 
 
 		 426 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1332  multidrug efflux system subunit MdtA  33.5 
 
 		 444 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713792  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0971  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.25 
 
 		 416 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1309  HlyD family secretion protein  37.43 
 
 		 388 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1266  secretion protein HlyD  34.88 
 
 		 411 aa  216  5e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.279661  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2431  RND family efflux transporter MFP subunit  37.43 
 
 		 435 aa  216  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638771  normal  0.904192 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1129  secretion protein HlyD  36.75 
 
 		 388 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0780076 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1215  multidrug efflux system subunit MdtA  33.5 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3103  multidrug efflux system subunit MdtA  33.68 
 
 		 427 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1513  secretion protein HlyD  40.68 
 
 		 404 aa  212  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0838  RND family efflux transporter MFP subunit  37.84 
 
 		 387 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1206  multidrug efflux system subunit MdtA  37.39 
 
 		 419 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0570202  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2569  secretion protein HlyD  37.8 
 
 		 462 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4661  secretion protein HlyD  36.47 
 
 		 386 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.5 
 
 		 462 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.5 
 
 		 462 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2094  RND family efflux transporter MFP subunit  39.68 
 
 		 377 aa  209  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0888739  normal  0.0111779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2856  RND family efflux transporter MFP subunit  38.37 
 
 		 417 aa  209  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2521  secretion protein HlyD  35.92 
 
 		 435 aa  209  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28820  secretion protein, HlyD family  38.62 
 
 		 441 aa  209  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1501  HlyD family secretion protein  37.71 
 
 		 445 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310778  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1942  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.4 
 
 		 372 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.547654  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1364  membrane fusion protein MdtA  37.71 
 
 		 442 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.284522  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1369  membrane fusion protein MdtA  37.71 
 
 		 445 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3424  secretion protein HlyD  37.01 
 
 		 412 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4389  RND family efflux transporter MFP subunit  36.97 
 
 		 387 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0818366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2902  secretion protein HlyD  38.55 
 
 		 464 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.56576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3537  putative component of multidrug efflux pump, mdtA-like protein  38.72 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2866  HlyD family secretion protein  37.86 
 
 		 576 aa  206  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1510  secretion protein HlyD  35.25 
 
 		 395 aa  206  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.11 
 
 		 372 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2957  secretion protein HlyD  36.42 
 
 		 389 aa  206  7e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0178504  normal  0.933874 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2966  multidrug efflux system subunit MdtA  37.31 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.874422  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  34.58 
 
 		 422 aa  204  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2753  HlyD family secretion protein  33.6 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.41 
 
 		 455 aa  202  6e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.568711  normal  0.749765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3894  RND efflux membrane fusion protein precursor  38.7 
 
 		 385 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1169  RND family efflux transporter MFP subunit  35.87 
 
 		 389 aa  202  8e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.66 
 
 		 455 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416467  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2558  secretion protein HlyD  35.05 
 
 		 451 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1312  multidrug efflux system subunit MdtA  37.31 
 
 		 410 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164615  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2104  RND family efflux transporter MFP subunit  38.11 
 
 		 450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45910  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  38.7 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.170535  normal  0.980017 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.44 
 
 		 388 aa  200  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2021  secretion protein HlyD  42.6 
 
 		 373 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2702  multidrug efflux system subunit MdtA  36.72 
 
 		 411 aa  199  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3489  RND family efflux transporter MFP subunit  34.91 
 
 		 381 aa  199  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.234911 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1577  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.94 
 
 		 434 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  34.53 
 
 		 411 aa  199  7e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3932  multidrug resistance protein mdtA precursor  36.98 
 
 		 473 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.416339 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1971  secretion protein HlyD  37.95 
 
 		 362 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1530  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.78 
 
 		 391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2202  RND family efflux transporter MFP subunit  35.16 
 
 		 407 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5556  HlyD family secretion protein  36.59 
 
 		 460 aa  198  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2482  secretion protein HlyD  35.05 
 
 		 434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179732  normal  0.227362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0533  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.88 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2907  RND efflux system membrane fusion protein  37.2 
 
 		 433 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484522  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3552  multidrug efflux system subunit MdtA  34.33 
 
 		 413 aa  196  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03141  putative resistance transmembrane protein  34.43 
 
 		 449 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1771  RND family efflux transporter MFP subunit  35.78 
 
 		 469 aa  195  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75905 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1172  RND family efflux transporter MFP subunit  35.59 
 
 		 454 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2256  RND family efflux transporter MFP subunit  39.1 
 
 		 538 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589481 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3309  RND family efflux transporter MFP subunit  38.11 
 
 		 430 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1198  RND family efflux transporter MFP subunit  35.59 
 
 		 457 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3581  secretion protein HlyD  36.83 
 
 		 407 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0719  secretion protein HlyD  35.59 
 
 		 457 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  34.51 
 
 		 415 aa  193  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  34.51 
 
 		 415 aa  193  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0601  secretion protein HlyD  37.7 
 
 		 459 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251315  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2363  multidrug efflux system subunit MdtA  35.44 
 
 		 413 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.67985 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2472  multidrug efflux system subunit MdtA  35.44 
 
 		 413 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.957345 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2312  multidrug efflux system subunit MdtA  35.44 
 
 		 413 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2256  multidrug efflux system subunit MdtA  35.44 
 
 		 413 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0346  RND family efflux transporter MFP subunit  36.98 
 
 		 360 aa  192  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.499232  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  34.22 
 
 		 415 aa  192  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  34.22 
 
 		 415 aa  192  9e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.105913 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2356  multidrug efflux system subunit MdtA  35.44 
 
 		 413 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0986  multidrug efflux system subunit MdtA  34.51 
 
 		 415 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  34.22 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2803  secretion protein HlyD  34.34 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.602838  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  34.22 
 
 		 455 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>