More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0896 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 443 aa  899    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  68.18 
 
 		 428 aa  588  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  67.13 
 
 		 433 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  58.47 
 
 		 429 aa  524  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  55.1 
 
 		 422 aa  487  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  51.7 
 
 		 423 aa  427  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  45.68 
 
 		 443 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  47.54 
 
 		 443 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  45.75 
 
 		 455 aa  360  3e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  44.3 
 
 		 444 aa  360  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  45.87 
 
 		 438 aa  359  6e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  44.5 
 
 		 455 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  46.53 
 
 		 452 aa  354  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  44.47 
 
 		 440 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  49.75 
 
 		 436 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  48.65 
 
 		 438 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  48.65 
 
 		 438 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  49.5 
 
 		 436 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  48.02 
 
 		 438 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  47.17 
 
 		 444 aa  345  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  47.52 
 
 		 437 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  43.79 
 
 		 441 aa  344  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  46.58 
 
 		 438 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  43.27 
 
 		 441 aa  342  9e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  41.99 
 
 		 444 aa  339  5e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  44.32 
 
 		 450 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  47.26 
 
 		 439 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  41.53 
 
 		 444 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  43.88 
 
 		 457 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  45 
 
 		 445 aa  335  9e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  45 
 
 		 445 aa  335  9e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  44.73 
 
 		 456 aa  335  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  47.63 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  46.27 
 
 		 439 aa  333  4e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  46.6 
 
 		 445 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  44.06 
 
 		 458 aa  330  4e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  40.72 
 
 		 439 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  43.56 
 
 		 468 aa  328  9e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  44.13 
 
 		 482 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  44.13 
 
 		 482 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  43.66 
 
 		 439 aa  325  1e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  41.94 
 
 		 432 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  44.36 
 
 		 456 aa  324  2e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  43.58 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  43.9 
 
 		 468 aa  324  2e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  42.76 
 
 		 439 aa  322  8e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  47.35 
 
 		 461 aa  322  9.000000000000001e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  45.95 
 
 		 532 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  44.39 
 
 		 456 aa  322  9.999999999999999e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  49.24 
 
 		 426 aa  320  3.9999999999999996e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  45.57 
 
 		 481 aa  318  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  44.14 
 
 		 445 aa  318  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  49.03 
 
 		 446 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  40.32 
 
 		 435 aa  317  2e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  46.77 
 
 		 535 aa  317  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  45.08 
 
 		 423 aa  316  5e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  43.52 
 
 		 481 aa  316  5e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  49.3 
 
 		 440 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  49.3 
 
 		 440 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  49.3 
 
 		 440 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  43.63 
 
 		 476 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  41.6 
 
 		 439 aa  315  9.999999999999999e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  43.29 
 
 		 515 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  46.11 
 
 		 410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  44.72 
 
 		 515 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  47.07 
 
 		 478 aa  313  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  45.82 
 
 		 440 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  42.92 
 
 		 530 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  50.46 
 
 		 415 aa  311  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  43.98 
 
 		 515 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  38.72 
 
 		 462 aa  311  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  43.98 
 
 		 515 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  43.98 
 
 		 515 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  42.89 
 
 		 451 aa  311  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  44.44 
 
 		 521 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  45.06 
 
 		 440 aa  310  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  38.95 
 
 		 434 aa  310  4e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  39.18 
 
 		 437 aa  310  4e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  43.98 
 
 		 511 aa  310  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  41.36 
 
 		 446 aa  309  5e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  42.65 
 
 		 549 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  43.78 
 
 		 440 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  42.92 
 
 		 479 aa  309  6.999999999999999e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  43.73 
 
 		 513 aa  309  8e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  45 
 
 		 524 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  44.88 
 
 		 479 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  45 
 
 		 530 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  45 
 
 		 524 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  45 
 
 		 524 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  45 
 
 		 524 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  45 
 
 		 524 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  45 
 
 		 530 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  41.57 
 
 		 471 aa  308  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  42.42 
 
 		 478 aa  306  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  42.93 
 
 		 550 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  42.93 
 
 		 538 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  40.18 
 
 		 438 aa  306  5.0000000000000004e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  40.44 
 
 		 483 aa  305  9.000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  43.23 
 
 		 479 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  43.07 
 
 		 451 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>