More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0890 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0890  2-alkenal reductase  100 
 
 		 480 aa  960    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.29 
 
 		 450 aa  395  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  54.99 
 
 		 525 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  48.33 
 
 		 444 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3776  PDZ/DHR/GLGF  49.88 
 
 		 483 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  41.67 
 
 		 452 aa  253  7e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0073  2-alkenal reductase  39.29 
 
 		 459 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0754695 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  44.34 
 
 		 478 aa  250  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  34.67 
 
 		 485 aa  250  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0091  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.03 
 
 		 474 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000577253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0079  2-alkenal reductase  42.03 
 
 		 474 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  35.9 
 
 		 476 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  36.42 
 
 		 481 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0073  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.52 
 
 		 474 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  36.73 
 
 		 476 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  36.95 
 
 		 483 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  36.4 
 
 		 464 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  36.72 
 
 		 483 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.69 
 
 		 396 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  37.18 
 
 		 476 aa  240  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  37.16 
 
 		 485 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  36.73 
 
 		 480 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  37.89 
 
 		 472 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  43.09 
 
 		 492 aa  239  6.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  44.72 
 
 		 385 aa  239  9e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  34.48 
 
 		 457 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  42.77 
 
 		 404 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  41.39 
 
 		 459 aa  238  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.65 
 
 		 412 aa  237  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  41.27 
 
 		 464 aa  237  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  35.94 
 
 		 483 aa  237  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  42.67 
 
 		 453 aa  236  5.0000000000000005e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  42.77 
 
 		 404 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  41.93 
 
 		 476 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  37.26 
 
 		 455 aa  236  8e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  39.43 
 
 		 459 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  40.49 
 
 		 500 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  35.22 
 
 		 478 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  39.5 
 
 		 398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  42.9 
 
 		 469 aa  234  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.37 
 
 		 384 aa  233  5e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  43.92 
 
 		 458 aa  233  5e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  42.28 
 
 		 403 aa  232  9e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  37.67 
 
 		 466 aa  232  9e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  34.04 
 
 		 482 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  36.58 
 
 		 450 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  36.93 
 
 		 502 aa  232  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  36.36 
 
 		 451 aa  232  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  36.29 
 
 		 455 aa  232  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  35.25 
 
 		 504 aa  231  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  36.36 
 
 		 450 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  36.36 
 
 		 450 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.86 
 
 		 387 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  36.36 
 
 		 450 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  36.36 
 
 		 449 aa  230  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  36.58 
 
 		 450 aa  229  7e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  36.58 
 
 		 450 aa  229  8e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  36.58 
 
 		 450 aa  229  8e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  40.23 
 
 		 461 aa  229  9e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.88 
 
 		 408 aa  229  9e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  35.46 
 
 		 465 aa  228  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  34.94 
 
 		 467 aa  228  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  42.15 
 
 		 473 aa  228  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  41.77 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.53 
 
 		 398 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  41.51 
 
 		 383 aa  228  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  43.53 
 
 		 462 aa  227  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  36.93 
 
 		 451 aa  227  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  36.15 
 
 		 450 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  41.46 
 
 		 513 aa  226  5.0000000000000005e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.95 
 
 		 401 aa  226  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.48 
 
 		 386 aa  226  7e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  33.93 
 
 		 453 aa  226  8e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.34 
 
 		 385 aa  226  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  34.88 
 
 		 477 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  42.5 
 
 		 372 aa  226  8e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  34.39 
 
 		 471 aa  226  9e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  34.53 
 
 		 479 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  36 
 
 		 450 aa  225  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  37.19 
 
 		 499 aa  225  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  35.6 
 
 		 453 aa  225  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  34.83 
 
 		 482 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0752  2-alkenal reductase  38.9 
 
 		 372 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0327336 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  40.65 
 
 		 401 aa  225  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  34.99 
 
 		 481 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  34.09 
 
 		 477 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.65 
 
 		 401 aa  225  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  36.79 
 
 		 475 aa  225  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  41.26 
 
 		 382 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  42.95 
 
 		 380 aa  224  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  40.65 
 
 		 401 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.65 
 
 		 401 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.65 
 
 		 401 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  34.33 
 
 		 492 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  40.06 
 
 		 474 aa  223  6e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  35.65 
 
 		 479 aa  223  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  33.76 
 
 		 475 aa  223  7e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  35.54 
 
 		 474 aa  223  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  40.06 
 
 		 396 aa  223  8e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  35.76 
 
 		 474 aa  223  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>