More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0881 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 268 aa  556  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  66.04 
 
 		 257 aa  364  1e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  63.06 
 
 		 259 aa  351  8e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  58.05 
 
 		 336 aa  320  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  54.85 
 
 		 257 aa  295  5e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  52.08 
 
 		 255 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  49.44 
 
 		 262 aa  264  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  45.52 
 
 		 255 aa  249  5e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.49 
 
 		 258 aa  240  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  43.28 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  45.63 
 
 		 257 aa  232  5e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  45.15 
 
 		 254 aa  228  5e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  44.57 
 
 		 252 aa  228  8e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  44.4 
 
 		 255 aa  228  9e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  43.85 
 
 		 251 aa  226  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  44.78 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  44.74 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  43.07 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  40 
 
 		 259 aa  223  4e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  41.2 
 
 		 252 aa  222  4e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  40 
 
 		 259 aa  222  6e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1497  exodeoxyribonuclease III Xth  44.94 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0441  exodeoxyribonuclease III (xth)  43.75 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  39.63 
 
 		 259 aa  219  5e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  39.85 
 
 		 253 aa  219  5e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  43.18 
 
 		 250 aa  218  7e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  39.18 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  40.82 
 
 		 251 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  41.79 
 
 		 254 aa  211  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  44.24 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  41.42 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  41.51 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  42.54 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  42.32 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  40.6 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  41.51 
 
 		 250 aa  209  5e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0120  exodeoxyribonuclease III Xth  42.91 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  39.25 
 
 		 249 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  40.15 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.49 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  39.25 
 
 		 250 aa  206  4e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  41.42 
 
 		 252 aa  205  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  41.13 
 
 		 250 aa  206  5e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  41.79 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  41.79 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  41.79 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  41.13 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  41.42 
 
 		 252 aa  202  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  38.11 
 
 		 249 aa  202  4e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11640  exodeoxyribonuclease III  41.88 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  40.3 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  36.84 
 
 		 257 aa  199  6e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  37.4 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0110  exodeoxyribonuclease III Xth  40.3 
 
 		 259 aa  195  7e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0939885 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  39.7 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  38.2 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  38.66 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6423  exodeoxyribonuclease III Xth  38.44 
 
 		 301 aa  192  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  37.45 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0541  exodeoxyribonuclease III  42.38 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.008532  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  39.1 
 
 		 248 aa  189  5e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  37.92 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  37.31 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1689  exonuclease III  35.45 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000145715  hitchhiker  0.000000000000014729 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  39.55 
 
 		 261 aa  181  7e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0107  exodeoxyribonuclease III Xth  37.88 
 
 		 247 aa  181  9.000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2986  exodeoxyribonuclease III Xth  36.84 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0039  exodeoxyribonuclease III Xth  39.31 
 
 		 256 aa  178  7e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2415  exodeoxyribonuclease III Xth  38.35 
 
 		 270 aa  178  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  35.47 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  36.94 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1311  exodeoxyribonuclease III Xth  35.88 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  36.6 
 
 		 258 aa  168  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0254  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.26 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0070  exodeoxyribonuclease III Xth  38.85 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0350  exodeoxyribonuclease III Xth  35.02 
 
 		 269 aa  166  5e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0362795  normal  0.625114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6475  exodeoxyribonuclease III Xth  38.97 
 
 		 264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3225  exodeoxyribonuclease III Xth  37.18 
 
 		 265 aa  165  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  hitchhiker  0.00000209509 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  35.85 
 
 		 260 aa  165  8e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  35.85 
 
 		 260 aa  165  8e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05100  exodeoxyribonuclease III  37.91 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  35.61 
 
 		 257 aa  162  6e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0685  exodeoxyribonuclease III Xth  35.61 
 
 		 260 aa  161  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_5808  predicted protein  38.75 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000562371  normal  0.329515 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0036  exodeoxyribonuclease III Xth  33.83 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0042  exodeoxyribonuclease III Xth  33.83 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  36.23 
 
 		 258 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0224  exodeoxyribonuclease III  35.5 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5745  exodeoxyribonuclease III Xth  36.67 
 
 		 294 aa  158  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321792  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0140  putative exodeoxyribonuclease III protein  34.09 
 
 		 261 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3102  exodeoxyribonuclease III Xth  32.58 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0146  exodeoxyribonuclease III Xth  34.32 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00325986  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0057  exodeoxyribonuclease III Xth  32.58 
 
 		 259 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2491  exodeoxyribonuclease III (xth)  33.33 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3105  exodeoxyribonuclease III Xth  33.33 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3121  exodeoxyribonuclease III Xth  33.33 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0403  exodeoxyribonuclease III  34.08 
 
 		 259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3043  exodeoxyribonuclease III Xth  32.96 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  31.84 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3160  exodeoxyribonuclease III Xth  32.96 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>