More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0833 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0833  Chromosomal replication initiator DnaA  100 
 
 
482 aa  989    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.093159  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0991  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.35 
 
 
504 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00365365  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.28 
 
 
498 aa  443  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.184051 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2320  DnaA family protein  46.22 
 
 
461 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0326594  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0785  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.07 
 
 
460 aa  396  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.4 
 
 
449 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.12 
 
 
460 aa  212  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  30.39 
 
 
481 aa  211  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.51 
 
 
450 aa  207  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  29.46 
 
 
480 aa  206  9e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3714  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.78 
 
 
458 aa  204  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0883513  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  30.21 
 
 
472 aa  202  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  29.5 
 
 
445 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  29.59 
 
 
450 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  30.37 
 
 
467 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  30.37 
 
 
467 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  30.15 
 
 
467 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.15 
 
 
467 aa  195  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  30.15 
 
 
467 aa  195  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  30.15 
 
 
467 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  30.15 
 
 
467 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  30.15 
 
 
467 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  30.15 
 
 
467 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  30.77 
 
 
472 aa  194  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  30.15 
 
 
466 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  30.15 
 
 
466 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  30.15 
 
 
466 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  30.15 
 
 
466 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  28.09 
 
 
482 aa  194  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  29.28 
 
 
460 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  29.82 
 
 
470 aa  193  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  29.93 
 
 
466 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06201  chromosomal replication initiation protein  28.78 
 
 
464 aa  192  8e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  30.52 
 
 
463 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.98 
 
 
483 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  30.04 
 
 
453 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.9 
 
 
470 aa  191  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000133107  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  31.12 
 
 
462 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  31.12 
 
 
462 aa  190  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0001  chromosomal replication initiation protein  28.36 
 
 
466 aa  190  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08301  chromosomal replication initiation protein  28.48 
 
 
463 aa  190  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  29.82 
 
 
453 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.92 
 
 
464 aa  188  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0136  chromosomal replication initiation protein  27.94 
 
 
452 aa  189  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000582235  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.39 
 
 
462 aa  189  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  30.51 
 
 
468 aa  188  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  30.59 
 
 
465 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  30.82 
 
 
468 aa  187  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  31.56 
 
 
450 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.98 
 
 
439 aa  187  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.4 
 
 
454 aa  186  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  26.37 
 
 
454 aa  186  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3008  chromosomal replication initiation protein  27.88 
 
 
471 aa  186  9e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.81 
 
 
456 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.69 
 
 
474 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00208216  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  30.99 
 
 
478 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  30.15 
 
 
465 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0886  chromosomal replication initiation protein  28.18 
 
 
462 aa  185  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0009  chromosomal replication initiation protein  31.25 
 
 
468 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00184157  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0001  chromosomal replication initiation protein  26.13 
 
 
492 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.943807  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.02 
 
 
480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0206444  normal  0.0774659 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0001  chromosomal replication initiation protein  27.03 
 
 
491 aa  184  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.34 
 
 
447 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  26.95 
 
 
453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  26.6 
 
 
450 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06291  chromosomal replication initiation protein  27.54 
 
 
463 aa  183  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05911  chromosomal replication initiation protein  26.78 
 
 
464 aa  183  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  27.71 
 
 
458 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.97 
 
 
461 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.78 
 
 
509 aa  182  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  26.8 
 
 
460 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0001  chromosomal replication initiation protein  26.43 
 
 
491 aa  182  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.96301  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.93 
 
 
443 aa  182  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3606  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.14 
 
 
476 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  26.46 
 
 
456 aa  181  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  27.27 
 
 
460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0565  chromosomal replication initiation protein  26.69 
 
 
464 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0001  chromosomal replication initiation protein  28.6 
 
 
477 aa  180  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.839498  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  28.63 
 
 
462 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  26.41 
 
 
449 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0001  chromosomal replication initiation protein  26.67 
 
 
477 aa  179  7e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.87 
 
 
469 aa  179  8e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.27 
 
 
591 aa  179  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  26.28 
 
 
446 aa  179  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  28.48 
 
 
462 aa  179  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.27 
 
 
587 aa  179  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0001  chromosomal replication initiation protein  28.04 
 
 
529 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.3 
 
 
439 aa  178  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0001  chromosomal replication initiation protein  27.56 
 
 
500 aa  178  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  29.44 
 
 
459 aa  178  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.07 
 
 
450 aa  178  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  32.6 
 
 
457 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  32.6 
 
 
457 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  26.54 
 
 
450 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0001  chromosomal replication initiation protein  29.51 
 
 
467 aa  177  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.720821  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  28.76 
 
 
461 aa  177  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.68 
 
 
458 aa  177  4e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  29.31 
 
 
457 aa  177  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000224276  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  28.14 
 
 
524 aa  177  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  25.96 
 
 
446 aa  177  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>