56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0832 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  100 
 
 		 225 aa  454  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1046  surface antigen msp4 family protein  46.22 
 
 		 223 aa  194  9e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135468  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  33.74 
 
 		 245 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  34.4 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  28.57 
 
 		 239 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  28.57 
 
 		 239 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  28.57 
 
 		 239 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  28.16 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  31.08 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  27.4 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  31.31 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5382  porin opacity type  35.67 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  29.11 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  33.33 
 
 		 219 aa  62  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  31.12 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5304  porin opacity type  30.9 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  30.99 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4836  porin opacity type  30.34 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  28.57 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  28.57 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  27.53 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  27.84 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2567  opacity protein and related surface antigens-like protein  30.4 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  35.87 
 
 		 283 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4837  hypothetical protein  27.57 
 
 		 287 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  27.16 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5305  hypothetical protein  27.03 
 
 		 287 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5383  hypothetical protein  26.88 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  34.48 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3966  opacity protein and related surface antigens-like protein  28.9 
 
 		 268 aa  49.7  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601337 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  24.47 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  27.5 
 
 		 340 aa  49.3  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4339  porin  22.27 
 
 		 330 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  26.49 
 
 		 297 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  31.08 
 
 		 186 aa  48.5  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  28.57 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  37.17 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0226  hypothetical protein  25.95 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  25.22 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0404  OmpA/MotB domain protein  33.6 
 
 		 378 aa  46.2  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.735071 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  27.98 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  29.32 
 
 		 181 aa  45.8  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  32.91 
 
 		 181 aa  45.4  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  26.17 
 
 		 183 aa  45.4  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4550  porin  27.27 
 
 		 316 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  30.09 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  24.62 
 
 		 401 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  31.82 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  31.84 
 
 		 284 aa  43.5  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  31.84 
 
 		 284 aa  43.5  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  31.36 
 
 		 282 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  28.16 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1116  hypothetical protein  28.57 
 
 		 290 aa  43.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  29.57 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  28.57 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  27.86 
 
 		 190 aa  41.6  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>