148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0819 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  100 
 
 		 229 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  53.39 
 
 		 236 aa  252  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  43.89 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  46.57 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  40.53 
 
 		 219 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  39.91 
 
 		 211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  41.89 
 
 		 209 aa  159  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  36.5 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  37.84 
 
 		 216 aa  134  9e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  30.49 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  30.47 
 
 		 235 aa  105  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  32.62 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  32.89 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  32.09 
 
 		 264 aa  96.3  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  37.2 
 
 		 249 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  37.34 
 
 		 244 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  31.67 
 
 		 219 aa  92  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  35.33 
 
 		 270 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  30.15 
 
 		 204 aa  85.9  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  36.69 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  28.64 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  26.96 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2949  DNA-binding protein, putative  30.43 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  27.56 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1712  CI repressor  24.87 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0120781  normal  0.203735 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2676  putative phage repressor  27.62 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135442 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  34.75 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1230  hypothetical protein  42.65 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.384901  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  30.09 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  32.84 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  30.52 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2281  putative phage repressor  27.85 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  31.82 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  32.14 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  31.71 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  26.88 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  28.85 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  28.51 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  24.89 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  31.33 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  31.33 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  28.1 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  25.94 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  28.37 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  28.18 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  24.89 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  29.24 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  26.27 
 
 		 229 aa  62  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  30.86 
 
 		 243 aa  62  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0805  conserved hypothetical protein, putative peptidase S24  25.56 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  32.35 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  26.79 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1866  putative phage repressor  24.9 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0868  putative phage repressor  25.53 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0373508  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  33.09 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  24.89 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  42.03 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  30.91 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  29.24 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  27.18 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  27.14 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  30.66 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  25.46 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  26.57 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  25 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  27.84 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  27.14 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  26.39 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  27.14 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  24.77 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  36.07 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  26.09 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  29.73 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  24.86 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  38.04 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  30.43 
 
 		 289 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0215  phage repressor protein, putative  21.72 
 
 		 209 aa  52.8  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0406422  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  26.5 
 
 		 222 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  28.89 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  27.78 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  36.96 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2911  putative phage repressor  27.34 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000204879  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  27.21 
 
 		 144 aa  50.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  21.27 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  27.06 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  37 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0976  putative phage repressor  22.91 
 
 		 284 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.786838  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1586  putative PAS/PAC sensor protein  40.98 
 
 		 541 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.822014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1183  putative prophage repressor  27.35 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355534  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.47 
 
 		 213 aa  48.9  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2707  putative PAS/PAC sensor protein  42.37 
 
 		 640 aa  48.5  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.109569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  32.46 
 
 		 264 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2423  LexA repressor  30.84 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  27.98 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1859  CI repressor  35.48 
 
 		 128 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00836044  normal  0.0132709 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2543  putative phage repressor  27.16 
 
 		 289 aa  46.6  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>